„Illuminati” to tajna organizacja składająca się z kilku najpotężniejszych bohaterów świata: Sorceror Supreme Doctor Strange; Black Bolt, król Inhumans; Charles Xavier, założyciel X-Men i działacz na rzecz praw mutantów; Reed Richards, członek-założyciel Fantastycznej Czwórki; Namor the Sub-Mariner, król Atlantydy; oraz Iron Man (Anthony Stark), członek-założyciel Avengers. Tych sześciu mężczyzn pracowało razem przez nieokreśloną ilość czasu, aby uformować i ukształtować status świata nadludzi i świata wokół niego.

Oryginalnie, Tony Stark zjednoczył tych mężczyzn wraz z Czarną Panterą krótko po tym, jak wojna Kree-Skrull po raz pierwszy zaangażowała Ziemię. Zasugerował, że tworzą mega grupę, która byłaby przygotowana do stawienia czoła podobnym zagrożeniom poprzez zjednoczenie wszystkich istniejących super zespołów i grup. Ostatecznie pomysł ten został zminimalizowany w skali do tajnej kabały, która dzieliłaby się informacjami i decydowała potajemnie, jak wszystkie poszczególne grupy będą ze sobą korespondować, przy czym T’challa nie zdecydował się dołączyć do grupy.

Grupa spotykała się, by omawiać różne kwestie, w tym powrót Sentry’ego. Grupa trwała do czasu, gdy Iron Man postanowił oszukać Hulka, by ten udał się w kosmos, a następnie wysłał go z Ziemi na odległą planetę. Gdy Namor odszedł z powodu niezgody na taki wybór, a profesor Xavier zniknął po tym, jak House of M|Scarlet Witch wypaczyła rzeczywistość, grupa rozpadła się. Zebrali się raz jeszcze, gdy Iron Man ogłosił zbliżającą się ustawę o rejestracji nadludzi i poprosił, by wszyscy publicznie wyrazili na nią zgodę, by zapobiec wojnie domowej. Ponownie, grupa została podzielona, gdy większość zadeklarowała swój sprzeciw wobec ustawy, pozostawiając Iron Mana i Reeda Richardsa do rozwiązania grupy.

Jednakże Iron Man wezwał grupę do siebie po raz ostatni, gdy najnowsze zgromadzenie Avengers odkryło Skrulla udającego zabójcę Elektry. Podczas gdy próbuje dowiedzieć się, co dokładnie zrobić z sytuacją, Black Bolt ujawnił się jako Skrull, jak również i zaatakował resztę Illuminati. Ten nowy typ niewykrywalnego superżołnierza Skrullów prawie zdołał wyeliminować Iron Mana i jego grupę, ale Namor zdołał zabić obcego wojownika, zanim to się stało. Iron Man następnie zniszczył kolejnych dwóch żołnierzy Skrullów, którzy zaatakowali, ale było już za późno. Obcy najeźdźcy dokończyli swoje zadanie zasiania ziarna nieufności wśród członków Illuminati. Namor był pierwszym, który odszedł, a reszta wkrótce podążyła za nim. Tylko czas pokaże, czy ziemscy bohaterowie zdołają znaleźć sposób, by znów sobie zaufać i odeprzeć tę tajną inwazję, zanim planeta zostanie stracona.