「イルミナティ」とは、世界で最も強力なヒーローたちからなる秘密組織である：魔術師スプリームドクター・ストレンジ、インヒューマンズの王ブラックボルト、Xメンの創設者でミュータント権活動家のチャールズ・エグゼビア、ファンタスティック・フォーの創設メンバーのリード・リチャーズ、アトランティスの王ナマー・サブマリーナ、アベンジャーズの創設メンバーアイアンマン（アントニースターク）であった。

もともとトニー・スタークは、クリー＝スクラル戦争が地球を巻き込んだ直後、ブラックパンサーとともにこの6人を束ねた。 彼は、既存のスーパーチームやグループをすべて統合することで、同様の脅威に対抗できるメガグループを結成することを提案した。 結局、このアイデアは、情報を共有し、個々のグループがどのように対応するかを秘密裏に決める秘密結社に規模が縮小され、T’charaはそのグループに参加しないことを選択することになった。 アイアンマンがハルクを騙して宇宙へ行き、地球から遠くの惑星へ送り出すことに決めるまで、このグループは続きました。 ナモーはその選択に反対して去り、エグゼビア教授はハウス・オブ・M|スカーレット・ウィッチが現実を歪めた後に姿を消したため、グループは解体された。 その後、アイアンマンが目前に迫った超人登録法を発表し、南北戦争を防ぐために公の場で全員が強く同意するよう求めた時、彼らは一旦集結する。 このときも、ほとんどの人がこの法律への反対を表明したため、グループは分裂し、アイアンマンとリード・リチャーズがグループを解散させた。

しかし、アベンジャーズの最新のメンバーが暗殺者エレクトラを装ったスクルルを発見したとき、アイアンマンは最後にもう一度グループを招集する。 ブラックボルトがスクラルであることを明かし、残りのイルミナティを攻撃したのだ。 この新しいタイプの検出不可能なスカルスーパーソルジャーは、アイアンマンとそのグループの排除に成功しそうになったが、その前にネイマーがこのエイリアンの戦士を殺すことに成功した。 アイアンマンは次に襲ってきた2体のスカルル兵士を撃破したが、時すでに遅し。 エイリアンはイルミナティのメンバーに不信の種を植え付けるという任務を完了した。 ナマーが最初に立ち去り、他のメンバーもすぐに後に続いた。 地球のヒーローたちが再びお互いを信頼し、地球が失われる前にこの秘密の侵略を撃退する方法を見つけることができるかどうかは、時間が解決するのみである。