A kolokalizáció a mikroszkópiában különböző adatelemzési módszerekre utal, amelyekkel a kép két csatornája közötti átfedés mértékét jellemezhetjük (amelyeket egyezményesen R és G csatornáknak vagy vörös és zöld csatornáknak neveznek, függetlenül a ténylegesen regisztrált hullámhosszuktól). A fluoreszcens mikroszkópiában tipikus alkalmazás a két jelölt célpont jelenlétének vizsgálata egy sejt ugyanazon régiójában.
Az érthető bevezetésért lásd a Kolokalizációs együtthatók és a Kolokalizáció alapjai című fejezeteket.
Ne feledje, hogy az elmosódás és a zaj befolyásolja a kolokalizációt.
A további részletekért lásd Colocalization Analyzer és Colocalization Theory.

Objektumkolokalizáció

Megjegyezzük, hogy a Huygens szoftverben található Object Analyzer objektumszintű kolokalizációs méréseket is biztosít. A Colocalization Analyzer inkább a teljes kép szintjén dolgozik, annak ellenére, hogy a kolokalizációs régiók néhány helyi statisztikája könnyen kinyerhető.
A két elemző ebben az értelemben egymást kiegészítő módon működik.

• Az Object Analyzer lehetővé teszi, hogy objektumokat definiáljunk (lásd Object Segmentation), és megnézzük, hogy azok mennyire fedik át egymást, térfogatban vagy intenzitásban. Az így definiált objektumok átfedhetnek más objektumokkal, vagy nem. Kiszűrheti azokat az objektumokat, amelyek egyáltalán nem kolokalizálnak.
• A Kolokalizációs elemző a teljes képet vizsgálja, hogy a szokásos kolokalizációs együtthatók alapján kolokalizáló régiókat keressen. Ezeket a régiókat ezután szegmentálja és elemzendő objektumokként kezeli. Ezek az objektumok tehát mindig metszési térfogatok.