Graham a commencé son ministère comme pasteur de East Side Baptist à Cross Plains dans le comté de Callahan, au Texas (1970-1971). Après son pastorat associé à l’église baptiste de Sagamore Hill (1972-1975), il a ensuite été pasteur de la First Baptist Church à Hobart, Oklahoma (1975-1978), de la First Baptist Church à Duncan, Oklahoma (1978-1981), et de la First Baptist Church à West Palm Beach, Floride (1981-1989).

En 1989, l’église baptiste de Prestonwood, alors une congrégation de Dallas comptant environ 11 000 membres, a appelé Graham comme pasteur après que son pasteur fondateur, Bill Weber, ait admis avoir eu une liaison extraconjugale et ait démissionné, mais il cherchait activement à retrouver son poste de pasteur, et à défaut avait convaincu plusieurs des membres les plus riches de l’église — dont la magnat des cosmétiques Mary Kay Ash — de soutenir une nouvelle église qu’il était en train de créer.

Alors que la famille de l’église continuait à augmenter de quelque 2 000 membres par an, et sans possibilité d’expansion sur le site original de Far North Dallas, les dirigeants et les membres ont prié, enquêté, délibéré et finalement, en 1999, construit un nouveau complexe de culte de 7 500 places, une école et un ministère sur 140 acres (0,57 km2) dans l’ouest de Plano.

En 2006, Prestonwood a ouvert son deuxième campus à Prosper, près de l’autoroute américaine 380 et Dallas Parkway. La même année, l’église a également achevé une nouvelle aile pour les enfants et mis à jour ses installations pour les ministères PowerPoint, y compris une mise à niveau vers la haute définition (HDTV).

L’église a atteint la marque des 43 000 membres en 2018, avec une fréquentation régulière des services de culte d’environ 17 000 personnes en moyenne.

Graham a effectué deux mandats en tant que président de la Convention baptiste du Sud, la plus grande dénomination baptiste américaine, avec 16 millions de membres, et en tant que président de la Conférence des pasteurs de la SBC.

Le pasteur Graham a été président d’honneur de la Journée nationale de prière de 2015 et est actuellement membre du Conseil consultatif religieux du président Donald Trump. Il a participé au service national de prière à la cathédrale nationale de Washington le lendemain de l’investiture.