La colocalisation en microscopie fait référence à différentes méthodes d’analyse de données pour caractériser le degré de chevauchement entre deux canaux dans une image (conventionnellement appelés canaux R et G, ou canaux rouge et vert, indépendamment de la Longueur d’onde qu’ils ont effectivement enregistrée). Une application typique en microscopie à fluorescence consiste à étudier la présence de deux cibles marquées dans la même région d’une cellule.
Pour une introduction accessible, voir Coefficients de colocalisation et Notions de base sur la colocalisation.
N’oubliez pas que le flou et le bruit affectent la colocalisation.
Voir Analyseur de colocalisation et Théorie de la colocalisation pour plus de détails.

Colocalisation d’objets

Notez que l’Analyseur d’objets du logiciel Huygens fournit également des mesures de colocalisation au niveau de l’objet. L’analyseur de colocalisation travaille plutôt au niveau de l’image entière, malgré le fait que certaines statistiques locales des régions de colocalisation peuvent être facilement récupérées.
Les deux analyseurs fonctionnent, en ce sens, de manière complémentaire.

• L’analyseur d’objets vous permet de définir des objets (voir Segmentation d’objets) et de voir dans quelle mesure ils se chevauchent, en volume ou en intensité. Les objets ainsi définis peuvent se chevaucher avec d’autres objets, ou non. Vous pouvez filtrer les objets qui ne se colocalisent pas du tout.
• L’analyseur de colocalisation explore l’ensemble de l’image pour rechercher des régions de colocalisation sur la base des coefficients de colocalisation habituels. Ces régions sont ensuite segmentées et traitées comme des objets à analyser. Ces objets sont donc toujours des volumes d’intersection.