La division Ginkgophyta comprend une seule espèce vivante, le Ginkgo biloba. Arbre rustique à feuilles caduques, le Ginkgo ressemble à un angiosperme en ce que la tige ligneuse est fréquemment et irrégulièrement ramifiée et porte de larges feuilles, qui sont en forme d’éventail avec des veines ramifiées de façon dichotomique. Bien qu’il soit aujourd’hui largement cultivé dans le monde, le Ginkgo est une espèce en voie de disparition, ses populations naturelles ayant été réduites à une petite portion des montagnes du sud-est de la Chine.

Comme les cycadales, le Ginkgo est dioïque et porte des microsporanges et des mégasporanges sur des arbres séparés. Un microstrobilus de Ginkgo est porté sur une pousse naine parmi les feuilles en éventail. L’axe du microstrobilus porte des appendices pédonculés aux extrémités desquels se trouvent deux microsporanges. Les mégastrobiles sont portés par des tiges allongées et minces, chacune ayant une paire d’ovules terminaux. Habituellement, un seul ovule mûrit en une graine.

Les tiges du Ginkgo sont anatomiquement similaires à celles des conifères. Le Ginkgo possède deux types de branches : des branches principales allongées et des branches latérales naines qui portent des feuilles. Après plusieurs années, ces pousses naines se développent en courtes excroissances tronquées à partir de la tige.