La calorimétrie indirecte mesure la consommation d’O2 et la production de CO2. En supposant que tout l’oxygène est utilisé pour oxyder les combustibles dégradables et que tout le CO2, ainsi dégagé, est récupéré, il est possible de calculer la quantité totale d’énergie produite. Il doit être clair que la « production d’énergie » signifie la conversion de l’énergie chimique libre des nutriments en énergie chimique de l’ATP, plus la perte d’une partie de l’énergie pendant le processus d’oxydation. La calorimétrie indirecte respiratoire, ou calorimétrie indirecte (CI) comme l’appellent la plupart des auteurs, est une méthode non invasive et très précise du taux métabolique, avec un taux d’erreur inférieur à 1 %. Elle présente une reproductibilité élevée et a été considérée comme une méthode de référence. Cette méthode permet d’estimer le BEE et le REE, et permet également d’identifier les substrats énergétiques qui sont principalement métabolisés par le corps à un moment donné. Elle est basée sur la mesure indirecte de la chaleur produite par l’oxydation des macronutriments, qui est estimée en surveillant la consommation d’oxygène (O2) et la production de dioxyde de carbone (CO2) pendant une certaine période de temps. Le calorimètre est équipé d’un collecteur de gaz qui s’adapte au sujet et d’un système qui mesure le volume et les concentrations d’O2 et de CO2 minute par minute. Par l’intermédiaire d’une valve unidirectionnelle, le calorimètre recueille et quantifie le volume et la concentration d’O2 inspiré et de CO2 expiré par le sujet. Une fois un volume atteint, la dépense énergétique au repos est calculée par la formule de Weir et les résultats sont affichés dans un logiciel attaché au système. Une autre formule utilisée est:

M = V O 2 ( R Q – 0.7 0.3 e c + 1 – R Q 0.3 e f ) {\displaystyle M=VO_{2}\left({\frac {RQ-0.7}{0.3}}e_{c}+{\frac {1-RQ}{0.3}e_{f}\right)}

où RQ est le quotient respiratoire (rapport du volume de CO2 produit au volume d’O2 consommé), e c {\displaystyle e_{c}}

est 21,13 kilojoules (5,05 kcal), la chaleur libérée par litre d’oxygène par l’oxydation des glucides, et e f {\displaystyle e_{f}}.

est 19,62 kilojoules (4,69 kcal), la valeur pour les graisses. Cela donne le même résultat que la formule de Weir à QR = 1 (combustion uniquement des glucides), et presque la même valeur à QR = 0,7 (combustion uniquement des graisses).⊅∑′.