La plupart des études sur la migration des civelles (Anguilla anguilla) sont réalisées dans les estuaires naturels, où elles pénètrent dans des systèmes d’eau douce pour y vivre pendant une période de plusieurs années avant de regagner la mer pour se reproduire. Dans ces systèmes naturels, le débit des rivières joue un rôle majeur en attirant et en dirigeant les anguilles migratrices. Cependant, les zones côtières sont de plus en plus urbanisées et caractérisées par des barrières anthropiques et des flux d’eau entravés ou artificiels. Les effets de ces flux sur la migration des civelles sont mal connus. Par conséquent, dans cette étude, les civelles ont été échantillonnées dans des stations de pompage d’eau dans une partie construite du delta du Rhin aux Pays-Bas. Un modèle mixte à effets linéaires a été utilisé pour déterminer les effets des flux d’eau douce provenant des stations de pompage d’eau sur la capture des civelles. Nous avons constaté que les flux d’eau douce provenant des stations de pompage d’eau avaient un effet significatif mais faible sur la capture des civelles. L’activité de pompage n’a pas eu d’effet significatif sur les captures de civelles dans les sites d’échantillonnage avec un flux d’eau douce continu provenant des passes à poissons. Cependant, la faible valeur prédictive du modèle et le faible nombre d’individus par échantillon ont empêché de tirer des conclusions solides sur les effets des flux d’eau douce anthropiques sur la migration des civelles. Des techniques de suivi individuel plus nombreuses devraient être utilisées pour améliorer la compréhension du comportement migratoire des civelles.