Zwei verschiedene Extraktionsmethoden zur Extraktion von Sorghum (Sorghum bicolor L. Moench.) Lagerproteinen für die Freizonen-Kapillarelektrophorese (FZCE)-Analyse wurden verglichen. Ein traditionelles Lösungsmittel auf der Basis von 60 % t-Butanol wurde mit einem Boratpuffer mit einem pH-Wert von 10 verglichen, der das anionische Detergens SDS enthielt, gefolgt von einer Ausfällung der Nonkafirine mit 60 % t-Butanol. Die FZCE-Analyse beider Extrakttypen ergab identische Muster, obwohl das SDS allen Proteinen das gleiche Verhältnis von Ladung zu Masse verleihen sollte. Diese Methode wurde auch erfolgreich auf Maisproteine angewandt. Es wird angenommen, dass die Verwendung von t-Butanol zur Ausfällung der Nicht-Kafirine in Verbindung mit der Elektrophorese bei niedrigem pH-Wert das SDS aus den Speicherproteinen entfernt hat. Das SDS-Extraktionsverfahren führte zu stabileren Extrakten für die FZCE-Analyse. Diese Extrakte konnten auch direkt für SDS-Kapillarelektrophorese (SDS-CE) Trennungen verwendet werden. Die Kafirine von 15 Genotypen wurden mit diesem Verfahren extrahiert und mittels FZCE und SDS-CE analysiert. Die Auflösung der Kafirine mittels FZCE war wesentlich höher als die der SDS-CE, was zeigt, dass die Kafirinproteine ein hohes Maß an Ladungsdichtevariabilität innerhalb einer relativ kleinen Molekülgrößenverteilung aufweisen. In den FZCE-Elektropherogrammen waren zwei unterschiedliche Gruppen von α-Kafirinen zu erkennen.