Das 1815 als Seneca Republican gegründete Blatt wurde 1823 in The Ithaca Journal umbenannt. Laut seiner Website (siehe Links unten) wurde die erste Tagesausgabe 1870 veröffentlicht, und seine Büros befinden sich im selben Gebäude, in dem es seit 1905 untergebracht ist.
Das Journal wurde 1912 von Frank E. Gannett aufgekauft und war damit die zweite Lokalzeitung des späteren Medienkonglomerats Gannett Co, Inc. Sie fusionierte 1919 mit der Daily News und nahm offiziell den Namen The Ithaca Journal-News an, obwohl sie unter dem Namen The Ithaca Journal herausgegeben wird.
Zu ihren Stars gehörte Kenneth Van Sickle, der langjährige Sportredakteur, der jahrzehntelang eine beliebte Kolumne hatte, in der er über alles von Cornell und dem Ithaca College über die High Schools bis hin zum lokalen Freizeitsport berichtete.
Die Zeitung gewann 1985 unter dem leitenden Redakteur Joseph Junod den Preis Best of Gannett for Sports Coverage für ihr wöchentliches Softball-Magazin. Zu dieser Zeit beschäftigte das Journal auch drei Fotografen, deren Arbeit bei Gannett und in der gesamten Zeitungsbranche Beachtung fand.
Im Mai 1996 stellte das Journal nach vielen Jahren als Nachmittagszeitung auf den Druck und die Verteilung am Vormittag um. Bis dahin war die von Studenten der Cornell University herausgegebene Cornell Daily Sun die einzige Morgenzeitung der Stadt gewesen.
Am 12. Juni 2006 wurden die Druckanlagen der Zeitung in die Gannett Central New York Production Facility in Johnson City, New York, außerhalb von Binghamton, New York, verlegt. Diese neue Anlage beherbergt auch die Druckereien für das Binghamton Press & Sun-Bulletin und die Elmira Star-Gazette, beides Tageszeitungen im Besitz von Gannett.
Nach diesem Umzug wird das bestehende Gebäude des Ithaca Journal renoviert, um erweiterte Büroräume einzurichten.
Ende 2006 entließ das Ithaca Journal einige seiner in Ithaca ansässigen Mitarbeiter aus den Bereichen Vertrieb, Marketing und Werbung. Der Vertrieb und das Marketing der Zeitung werden nun vom Büro in Binghamton aus gesteuert.
Im Juni 2020 bestand das lokale Personal der Zeitung nur noch aus einem einzigen Reporter: Matt Steecker. Das hat dazu geführt, dass es Tage gibt, an denen es keine Nachrichten aus Ithaca gibt. Stattdessen verwendet die Zeitung Inhalte aus den Gannett-Büros in Binghamton und Elmira, um die Zeitung und die Website zu füllen.