Eine Huaca konnte entlang einer zeremoniellen Prozessionslinie oder -route gebaut werden, wie es für die Durchführung heiliger Rituale in der Hauptstadt Cusco der Fall war. Solche Linien wurden als Ceques bezeichnet. Die Arbeit von Tom Zuidema und Brian Bauer (UT-Austin) untersucht die verschiedenen Debatten über ihre Verwendung und Bedeutung.

Diese Linien wurden angelegt, um die Kosmologie der Kultur auszudrücken, und waren manchmal astronomisch auf verschiedene Sternaufgänge und -untergänge ausgerichtet. Sie betrafen jahreszeitliche Zeremonien und die Zeitmessung (für die Zwecke der Landwirtschaft, der Zeremonien und der Aufzeichnungen). Diese ceque-Linien haben große Ähnlichkeit mit den Prozessionslinien bei den Maya (sacbe), den Chacoanern und den Muisca (Suna).

In bestimmten huacas wurden besondere Anlagen errichtet, in denen die Priester aufwendige Rituale und religiöse Zeremonienkulturen gestalteten. Zum Beispiel wurde in Cusco die Sonnenzeremonie (Inti Raymi) durchgeführt. Die Inkas bauten kreativ auf einem bereits bestehenden System der religiösen Verehrung der Völker auf, die sie in ihr Reich aufnahmen. Dieser Austausch stellte sicher, dass die eroberten Völker die Vorschriften einhielten. Die Inkas verpflanzten und kolonisierten auch ganze Gruppen von Personen mit Inka-Hintergrund in neu aufgenommene Völker, um eine bessere Verteilung der Inka-Personen über ihr gesamtes Reich zu erreichen und so weitreichenden Widerstand zu vermeiden. In diesem Fall wurden die huacas und pacarinas zu bedeutenden Zentren gemeinsamer Verehrung und zu einem Punkt der Vereinigung ethnisch und sprachlich unterschiedlicher Völker. Sie trugen dazu bei, den oft geografisch getrennten Völkern Einigkeit und eine gemeinsame Staatsbürgerschaft zu verleihen. Schon vor der Einführung des Katholizismus entwickelten die Menschen ein System von Pilgerfahrten zu diesen verschiedenen Heiligtümern.