Die Abteilung Ginkgophyta besteht aus einer einzigen lebenden Art, Ginkgo biloba. Als winterharter Laubbaum ähnelt der Ginkgo einem Angiospermen, da der verholzte Stamm häufig und unregelmäßig verzweigt ist und breite Blätter trägt, die fächerförmig sind und dichotomisch verzweigte Adern haben. Obwohl er heute weltweit in großem Umfang angebaut wird, ist der Ginkgo eine gefährdete Art, da seine natürlichen Bestände auf einen kleinen Teil der Berge im Südosten Chinas reduziert wurden.

Wie die Cycadeen ist der Ginkgo zweihäusig und trägt Mikrosporangien und Megasporangien auf getrennten Bäumen. Ein Ginkgo-Mikrostrobilus befindet sich an einem Zwergspross zwischen den fächerförmigen Blättern. Die mikrostrobile Achse trägt gestielte Anhängsel, an deren Enden sich jeweils zwei Mikrosporangien befinden. Die Megastrobili befinden sich an länglichen, schlanken Stielen mit je einem Paar endständiger Samenanlagen. Gewöhnlich reift nur eine Samenanlage zu einem Samen heran.

Die Stängel des Ginkgo sind anatomisch denen der Nadelbäume ähnlich. Der Ginkgo hat zwei Arten von Ästen: langgestreckte Hauptäste und zwergwüchsige Seitenäste, die Blätter tragen. Nach einigen Jahren entwickeln sich diese Zwergzweige zu kurzen, stummelartigen Ablegern des Stammes.