- Unterscheidungsmerkmale
- Virion
- Morphologie
- Physikochemische und physikalische Eigenschaften
- Nukleinsäure
- Proteine
- Lipide
- Kohlenhydrate
- Genomorganisation und Replikation
- Biologie
- Wirtsbereich
- Übertragung
- Geografische Verbreitung
- Pathogenität
- Antigenität
- Speziesabgrenzungskriterien
- Mitglied der Art
- Virusnamen, die Auswahl von Beispielisolaten und Virusabkürzungen, sind keine offiziellen ICTV-Bezeichnungen.
- Verwandt, nicht klassifizierte Viren
- Virusnamen und Virusabkürzungen sind keine offiziellen ICTV-Bezeichnungen.
Unterscheidungsmerkmale
Das 5′-Ende des Genoms besitzt eine Typ-I-Kappe (m7GpppAmp), die bei Viren der anderen Gattungen nicht vorkommt. Die meisten Flaviviren werden durch arthropode Vektoren, Stechmücken oder Zecken, auf Wirbeltiere übertragen, in denen sie sich aktiv vermehren. Einige Flaviviren werden von Nagetieren oder Fledermäusen ohne bekannte Arthropodenvektoren übertragen.
Virion
Morphologie
Die Viren haben einen Durchmesser von 50 nm und eine kugelförmige Gestalt (Abbildung 1.Flavivirus). Es können zwei Virusformen unterschieden werden. Reife Virionen enthalten zwei viruskodierte membranassoziierte Proteine, E und M. Intrazelluläre unreife Virionen enthalten den Vorläufer prM, der während der Reifung proteolytisch in M gespalten wird (Stadler et al., 1997). In bestimmten Fällen werden auch teilweise reife/unreife Formen aus infizierten Zellen freigesetzt. Die Virionstrukturen des Dengue-Virus (DENV) und des West-Nil-Virus (WNV) wurden durch Röntgenkristallographie bestimmt (Kuhn et al., 2002, Mukhopadhyay et al., 2003). Das Hüllprotein E ist ein dimeres, stäbchenförmiges Molekül, das parallel zur Membran ausgerichtet ist und in seiner pH-neutralen Konformation keine stachelartigen Fortsätze bildet (Yu et al., 2008). Bildrekonstruktionen aus kryo-elektronenmikroskopischen Aufnahmen (Abbildung 1.Flavivirus) haben gezeigt, dass die Virionenhülle eine ikosaedrische Symmetrie aufweist, bei der die E-Protein-Dimere in einer fischgrätenartigen Anordnung organisiert sind.
Abbildung 1.Flavivirus. Dreidimensionale kryo-elektronenmikroskopische Rekonstruktionen von unreifen (links) und reifen (rechts) Partikeln eines Isolats des Dengue-Virus (mit freundlicher Genehmigung von M. Rossmann). Abgebildet ist eine Oberflächenwiedergabe des unreifen Dengue-Virus mit einer Auflösung von 12,5Å (links) und des reifen Dengue-Virus mit einer Auflösung von 10Å (rechts). Die Viren sind maßstabsgetreu abgebildet, aber nicht farblich maßstabsgetreu. Die Dreiecke umreißen eine ikosaedrische Einheit.
Physikochemische und physikalische Eigenschaften
Das Mr. des Virions ist nicht genau bestimmt worden. Reife Virionen sedimentieren bei etwa 200S und haben eine Auftriebsdichte von etwa 1,19 g cm-3 in Saccharose (Kokorev et al., 1976). Die Viren sind bei einem leicht alkalischen pH-Wert von 8,0 stabil, werden aber durch saure pH-Werte, Temperaturen über 40 °C, organische Lösungsmittel, Detergenzien, ultraviolettes Licht und Gammastrahlung leicht inaktiviert.
Nukleinsäure
Die Virion-RNA der Flaviviren ist eine infektiöse ssRNA mit positiver Richtung von 9,2-11,0 kb. Das 5′-Ende des Genoms besitzt eine Typ-I-Kappe (m-7GpppAmp), wobei auf das A ein hochkonserviertes G-Nukleotid folgt. Den 3′-Enden fehlt ein terminaler Poly(A)-Trakt und sie enden mit dem konservierten Dinukleotid CU.
Proteine
Virionen enthalten drei Strukturproteine: das Kapsid (C, 11 kDa), das Haupt-Hüllprotein (E, 50 kDa) und entweder prM (26 kDa) in unreifen Virionen oder M (8 kDa) in reifen Virionen. Das E-Protein ist das virale Hämagglutinin, das sowohl die Rezeptorbindung als auch die pH-abhängige Fusionsaktivität nach der Aufnahme durch rezeptorvermittelte Endozytose vermittelt. Sieben Nicht-Strukturproteine werden in infizierten Zellen synthetisiert: NS1 (46 kDa), NS2A (22 kDa), NS2B (14 kDa), NS3 (70 kDa), NS4A (16 kDa), NS4B (27 kDa) und NS5 (103 kDa). Einige Mitglieder der Gattung weisen Sequenzen auf, die offenbar einen Teil der translatierenden Ribosomen dazu veranlassen, sich um -1 nt zu verschieben und die Translation im neuen Leseraster fortzusetzen, um ein „Transframe“-Fusionsprotein zu erzeugen (Firth und Atkins 2009). Wenn dies funktionell genutzt wird, spricht man von programmed-1 ribosomal frameshifting (-1 PRF). NS1 hat mehrere Formen und Funktionen, wobei eine zellassoziierte Form bei der viralen RNA-Replikation funktioniert und eine sekretierte Form die Komplementaktivierung reguliert. Eine solche Form, ein NS1′-Protein, ist das Produkt eines -1 ribosomalen Frameshifts und spielt eine Rolle bei der viralen Neuroinvasivität (Melian et al., 2010). Das N-terminale Drittel von NS1 bildet zusammen mit NS2B den viralen Serinproteasekomplex, der an der Verarbeitung des Polyproteins beteiligt ist. Der C-terminale Teil von NS3 enthält eine RNA-Helicase-Domäne, die an der RNA-Replikation beteiligt ist, sowie eine RNA-Triphosphatase-Aktivität, die wahrscheinlich an der Bildung der 5′-terminalen Cap-Struktur der viralen RNA beteiligt ist. NS5 ist das größte und am höchsten konservierte Protein, das als virales RdRP fungiert und auch eine Methyltransferase-Aktivität besitzt, die an der Modifikation der viralen Cap-Struktur beteiligt ist.
Lipide
Viren enthalten ca. 17% Lipide, die aus den Membranen der Wirtszellen stammen.
Kohlenhydrate
Viren enthalten ca. 9% Kohlenhydrate (Glykolipide, Glykoproteine), deren Zusammensetzung und Struktur von der Wirtszelle (Wirbeltier oder Arthropode) abhängen. N-Glykosylierungsstellen sind in den Proteinen prM (1 bis 3 Stellen), E (0 bis 2 Stellen) und NS1 (1 bis 3 Stellen) vorhanden.
Genomorganisation und Replikation
Die genomische RNA ist die einzige virale Boten-RNA in infizierten Zellen. Sie besteht aus einem einzigen langen ORF von mehr als 10.000 nt, der für alle strukturellen und nicht-strukturellen Proteine kodiert und von NCRs am 5′- und 3′-terminalen Ende flankiert wird (Abbildung 2.Flavivirus).
Abbildung 2.Flavivirus. Flavivirus-Genomorganisation (nicht maßstabsgetreu) und Polyproteinprozessierung. Die RNA des Virions ist etwa 11 kb lang. Oben ist das virale Genom mit den kodierenden Regionen für strukturelle und nicht-strukturelle Proteine sowie den 5′- und 3′-NCRs dargestellt. Die Kästchen unter dem Genom bezeichnen virale Proteine, die durch die proteolytische Prozessierungskaskade gebildet werden. P-, H- und R-Symbole zeigen die Lokalisierung der NS3-Protease, der NS3-RNA-Helikase bzw. der NS5-RdRP-Domäne an.
Sowohl die 5′-NCR als auch die 3′-NCR enthalten RNA-Sequenzmotive, die an der viralen RNA-Translation, der Replikation und möglicherweise der Verpackung beteiligt sind. Obwohl die sekundäre RNA-Struktur und die Funktion einiger Elemente konserviert sind, können die Sequenzzusammensetzung, die Länge und die genaue Lokalisierung zwischen verschiedenen Mitgliedern der Gattung erheblich variieren, insbesondere zwischen durch Zecken und Mücken übertragenen Flaviviren. In einigen Fällen enthält der 3′-NCR des durch Zecken übertragenen Enzephalitis-Virus beispielsweise einen internen Poly(A)-Trakt. Die Virusinfektion führt zu einer dramatischen Umstrukturierung der Zellmembranstrukturen innerhalb des perinukleären endoplasmatischen Retikulums (ER) und zur Bildung von aus dem ER stammenden vesikulären Paketen, die höchstwahrscheinlich die Orte der viralen Replikation darstellen. Nach der Übersetzung der eingehenden genomischen RNA beginnt die RNA-Replikation mit der Synthese komplementärer negativer Stränge, die dann als Vorlage für die Herstellung zusätzlicher positivsträngiger Moleküle in Genomlänge verwendet werden. Diese werden durch einen semikonservativen Mechanismus synthetisiert, an dem replikative Zwischenstufen (die sowohl doppelsträngige Regionen als auch naszierende einzelsträngige Moleküle enthalten) und replikative Formen (Duplex-RNA-Moleküle) beteiligt sind. Die Translation beginnt in der Regel am ersten AUG des ORF, kann aber bei durch Moskitos übertragenen Flaviviren auch an einem zweiten, 12 bis 14 Codons stromabwärts gelegenen In-Frame-AUG erfolgen. Das Polyprotein wird durch zelluläre Proteasen und die virale Serinprotease NS2B-NS3 zu den reifen Struktur- und Nichtstrukturproteinen verarbeitet. Die Proteintopologie in Bezug auf das ER und das Zytoplasma wird durch interne Signal- und Stop-Transfer-Sequenzen bestimmt. Viruspartikel können zunächst im rauen endoplasmatischen Retikulum beobachtet werden, das vermutlich der Ort der Virusassemblierung ist. Diese unreifen Virionen werden dann durch die Membransysteme des sekretorischen Weges des Wirts zur Zelloberfläche transportiert, wo die Exozytose stattfindet. Kurz vor der Freisetzung der Virionen wird das prM-Protein durch Furin oder eine Furin-ähnliche zelluläre Protease gespalten, um reife Virionen zu erzeugen. Infizierte Zellen setzen auch ein nicht-infektiöses subvirales Partikel frei, das einen niedrigeren Sedimentationskoeffizienten als das ganze Virus hat (70S statt 200S) und eine Hämagglutinationsaktivität aufweist.
Biologie
Wirtsbereich
Flaviviren können eine Vielzahl von Wirbeltierarten und in vielen Fällen auch Arthropoden infizieren. Einige Viren haben ein begrenztes Wirtsspektrum bei Wirbeltieren (z. B. nur Primaten), während andere eine Vielzahl von Arten (Säugetiere, Vögel usw.) infizieren und sich in ihnen vermehren können. Der übliche Infektionsweg für Arthropoden besteht darin, dass sie sich von einem virämischen Wirbeltierwirt ernähren, doch wurde für durch Zecken übertragene Flaviviren auch eine nicht-virämische Übertragung zwischen Vektoren beschrieben. Eine neue Gruppe nicht klassifizierter Viren der Gattung, darunter das Cell Fusing Agent Virus, scheint nur Stechmücken zu infizieren, und mehrere weitere, genetisch sehr unterschiedliche reine Insektenflaviviren wurden jetzt identifiziert (Blitvich und Firth 2015).
Übertragung
Die meisten Flaviviren sind von Arthropoden übertragene Viren mit Übertragungszyklen von hämatophagen Arthropodenvektoren auf Wirbeltierwirte. Etwa 50 % der bekannten Flaviviren werden von Stechmücken übertragen, 28 % von Zecken und der Rest von Nagetieren oder Fledermäusen ohne bekannte Arthropodenvektoren. Bei einigen Flaviviren ist der Übertragungszyklus noch nicht bekannt. In bestimmten Fällen können Flaviviren durch Blutprodukte, Organtransplantationen, nicht pasteurisierte Milch oder Aerosole auf den Menschen übertragen werden. Von einigen durch Zecken übertragenen Flaviviren ist bekannt, dass sie direkt von Zecke zu Zecke übertragen werden. Bei den Arthropoden-Vektoren können die Viren auch transovarial oder vertikal (Stechmücken, Zecken) und transstadial (Zecken) übertragen werden. Zu den Mechanismen der Virusübertragung bei den reinen Insektenflaviviren gehört möglicherweise die vertikale Übertragung, aber es müssen auch andere Mechanismen in Betracht gezogen werden, um den Erfolg zu erklären, mit dem sich diese Viren weltweit ausgebreitet haben.
Geografische Verbreitung
Flaviviren sind weltweit verbreitet, aber einzelne Arten sind auf bestimmte endemische oder epidemische Gebiete beschränkt (z.B., Gelbfiebervirus in tropischen und subtropischen Regionen Afrikas und Südamerikas; Dengue-Virus in tropischen Gebieten Asiens, Ozeaniens, Afrikas, Australiens und Amerikas; Japanisches Enzephalitis-Virus in Südostasien; Zeckenenzephalitis-Virus in Europa und Nordasien).
Pathogenität
Mehr als 50 % der bekannten Flaviviren wurden mit menschlichen Erkrankungen in Verbindung gebracht, darunter viele wichtige menschliche Krankheitserreger wie das Gelbfiebervirus, das Dengue-Virus, das Zika-Virus, das Japanische Enzephalitis-Virus, das West-Nil-Virus und das durch Zecken übertragene Enzephalitis-Virus. Die ausgelösten Krankheiten können mit Symptomen des zentralen Nervensystems (z. B. Meningitis, Enzephalitis), Fieber, Arthralgie, Hautausschlag und hämorrhagischem Fieber einhergehen. Mehrere Flaviviren sind pathogen für Haus- oder Wildtiere (Truthahn, Schwein, Pferd, Schaf, Hund, Moorhuhn, Bisamratte) und verursachen wirtschaftlich bedeutende Krankheiten.
Antigenität
Alle Flaviviren sind serologisch verwandt, was durch Bindungstests wie ELISA und durch Hämagglutinationshemmung mit polyklonalen und monoklonalen Antikörpern nachgewiesen werden kann. Neutralisationstests sind aussagekräftiger und wurden zur Identifizierung enger verwandter Flavivirus-Serokomplexe (wie in Abbildung 1.Flaviviridae dargestellt) verwendet, allerdings nicht bis auf Artniveau. Das Hüllprotein E ist das Hauptziel für neutralisierende Antikörper und löst eine schützende Immunität aus. Das E-Protein induziert auch kreuzreaktive, nicht-neutralisierende Antikörper gegen Flaviviren. Antigene, die an der Neutralisierung beteiligt sind, wurden in jeder der drei Strukturdomänen des E-Proteins lokalisiert. Die prM- und NS1-Proteine können ebenfalls Antikörper induzieren, die infizierte Tiere vor einer tödlichen Infektion schützen.
Speziesabgrenzungskriterien
Speziesabgrenzungskriterien in der Gattung umfassen:
- Nukleotid- und abgeleitete Aminosäuresequenzdaten.
- Antigene Merkmale.
- Geografische Assoziation.
- Vektorassoziation.
- Wirtsassoziation.
- Krankheitsassoziation.
- Ökologische Merkmale.
Bei der Abgrenzung von Arten wird eine Kombination der oben aufgeführten Kriterien berücksichtigt. Während die Nukleotidsequenzverwandtschaft und die sich daraus ergebenden Phylogenien wichtige Kriterien für die Artabgrenzung sind, können die anderen aufgeführten Kriterien bei der Abgrenzung von genetisch eng verwandten Viren besonders nützlich sein. So weisen beispielsweise fernöstliche (FE) Stämme des Zeckenenzephalitis-Virus im Vergleich zum Virus des hämorrhagischen Fiebers von Omsk deutliche ökologische Unterschiede auf, obwohl sie genetisch relativ eng miteinander verwandt sind. FE-Stämme des Zeckenenzephalitis-Virus sind vorwiegend mit Ixodes persulcatus-Zecken in Waldgebieten im fernen Osten Russlands assoziiert, während das Omsk-Virus des hämorrhagischen Fiebers in den Steppenregionen Westsibiriens vor allem mit Dermacentor spp. und in geringerem Maße mit Ixodes spp. assoziiert ist. Diese Viren sind auch in Neutralisationstests mit Rekonvaleszentenseren antigenisch unterscheidbar.
Lupenkrankheitsvirus und Zeckenenzephalitisvirus sind ein weiteres Beispiel für Viren, die trotz ihrer engen genetischen Verwandtschaft und ähnlicher Wirtsbereiche unterschiedliche Ökologien (Moorlandschaften versus Wälder), Pathogenitäten (Rothühner, Schafe/Ziegen versus Menschen) und geografische Verbreitungen (Großbritannien versus Europa/Eurasien) aufweisen, was ihre Klassifizierung als Mitglieder verschiedener Spezies rechtfertigt, nämlich Lupenkrankheitsvirus und Zeckenenzephalitisvirus.
Die vier Dengue-Virus-Serotypen hingegen gehören alle zu einer einzigen Spezies (Dengue-Virus), obwohl sie phylogenetisch und antigenetisch recht unterschiedlich sind. Dies ist durch die Tatsache gerechtfertigt, dass sie in denselben geografischen Gebieten und ökologischen Lebensräumen zirkulieren, identische Vektoren nutzen und ähnliche Lebenszyklen und Krankheitsmanifestationen aufweisen (Tabelle 1.Flavivirus).
Tabelle 1.Flavivirus. Flaviviren, gruppiert nach Vektor und Wirt.
Virusart |
Virusname |
Akzessionsnummer |
Viruskürzel |
Zecken-übertragen, Säugetierwirt |
|||
Gadgets Gully Virus |
Gadgets Gully Virus |
DQ235145 |
GGYV |
Kyasanur Waldkrankheitsvirus |
Kyasanur Waldkrankheitsvirus |
AY323490 |
KFDV |
Alkhumra hämorrhagisches Fieber Virus |
AF331718 |
AHFV |
|
Langat-Virus |
Langat-Virus |
AF253419 |
LGTV |
Louping krankes Virus |
Lutschendes krankes Virus |
Y07863 |
LIV |
Britischer Subtyp |
D12937 |
LIV-.Brit |
|
Irischer Untertyp |
X86784 |
LIV-Ir |
|
Spanischer Subtyp |
DQ235152 |
LIV-Spanien |
|
Türkisches Schaf-Enzephalitis-Virus Subtyp |
DQ235151 |
TSEV |
|
Griechische Ziegenenzephalitis Virus-Subtyp |
DQ235153 |
GGEV |
|
Omsker hämorrhagisches Fieber-Virus |
AY193805 |
OHFV |
|
Powassan-Virus |
Powassan-Virus |
L06436 |
POWV |
Hirschzeckenvirus |
AF311056 |
DTV |
|
Royal Farm Virus |
Royal Farm virus |
DQ235149 |
RFV |
Tick-borne encephalitis virus |
Europäischer Subtyp |
U27495 |
TBEV-Eur |
Fernöstlicher Subtyp |
X07755 |
TBEV-FE |
|
Sibirischer Subtyp |
L40361 |
TBEV-Sib |
|
Zecken-übertragen, Seevogelwirt |
|||
Meaban-Virus |
Meaban-Virus |
DQ235144 |
MEAV |
Saumarez Reef virus |
Saumarez Reef Virus |
DQ235150 |
SREV |
Tyuleniy Virus |
Tyuleniy-Virus |
KF815939 |
TYUV |
Wahrscheinlich Zecken-übertragbar |
|||
Kadam-Virus |
Kadam Virus |
DQ235146 |
KADV |
Mosquito-übertragbar, Aroa-Virus-Gruppe |
|||
Aroa-Virus |
Aroa-Virus |
AY632536 |
AROAV |
Bussuquara-Virus |
AF013366 |
BSQV |
|
Iguape-Virus |
AF013375 |
IGUV |
|
Naranjal-Virus |
AF013390 |
NJLV |
|
Mosquito-übertragbar, Dengue-Virus-Gruppe |
|||
Dengue-Virus |
Dengue-Virus 1 |
U88536 |
DENV-1 |
Dengue-Virus 2 |
U87411 |
DENV-2 |
|
Dengue-Virus 3 |
M93130 |
DENV-3 |
|
Dengue-Virus 4 |
AF326573 |
DENV-4 |
|
Moskitoübertragen, Japanische Enzephalitis Virus Gruppe |
|||
Cacipacore Virus |
Cacipacoré Virus |
KF917536 |
CPCV |
Japanische Enzephalitis-Virus |
Japanisches Enzephalitis-Virus |
M18370 |
JEV |
Koutango-Virus |
Koutango-Virus |
AF013384 |
KOUV |
Murray-Tal-Enzephalitis-Virus |
Alfuy-Virus |
AF013360 |
ALFV |
Murray Valley Enzephalitis-Virus |
AF161266 |
MVEV |
|
St. Louis Enzephalitis-Virus |
St. Louis-Enzephalitis-Virus |
DQ525916 |
SLEV |
Usutu-Virus |
Usutu-Virus |
AY453411 |
USUV |
West Nil Virus |
Kunjin Virus |
D00246 |
KUNV |
West Nil Virus |
M12294 |
WNV |
|
Yaoundé-Virus |
Yaoundé-Virus |
AF013413 |
YAOV |
Mosquito-übertragbar, Kokobera-Virus-Gruppe |
|||
Kokobera-Virus |
Kokobera-Virus |
AY632541 |
KOKV |
Stratford-Virus |
AF013407 |
STRV |
|
Mosquito-übertragbar, Ntaya Virus Gruppe |
|||
Bagaza Virus |
Bagaza Virus |
AY632545 |
BAGV |
Ilheus-Virus |
Ilhéus-Virus |
AY632539 |
ILHV |
Rocio-Virus |
AF013397 |
ROCV |
|
Israel Truthahn-Meningoenzephalitis-Virus |
Israel Truthahn Meningoenzephalitis-Virus |
AF013377 |
ITV |
Ntaya Virus |
Ntaya Virus |
JX236040 |
NTAV |
Tembusu Virus |
Tembusu Virus |
JF895923 |
TMUV |
Zika Virus |
Zika Virus |
AY632535 |
ZIKV |
Mosquito-übertragbar, Gelbfieber-Virus-Gruppe |
|||
Sepik-Virus |
Sepik-Virus |
DQ837642 |
SEPV |
Wesselsbron-Virus |
Wesselsbron Virus |
EU707555 |
WESSV |
Gelbfiebervirus |
Gelbfiebervirus |
X03700 |
YFV |
Wahrscheinlich durch Mückenborne, Kedougou-Virus-Gruppe |
|||
Kedougou-Virus |
Kédougou-Virus |
AY632540 |
KEDV |
wahrscheinlich durch Mücken übertragen, Edge Hill Virus Gruppe |
|||
Banzi Virus |
Banzi Virus |
DQ859056 |
BANV |
Boubouivirus |
Boubouivirus |
DQ859057 |
BOUV |
Edge Hill Virus |
Edge Hill Virus |
DQ859060 |
EHV |
Jugra Virus |
Jugra Virus |
DQ859066 |
JUGV |
Saboya Virus |
Potiskum-Virus |
DQ859067 |
POTV |
Saboya Virus |
DQ859062 |
SABV |
|
Uganda S Virus |
Uganda S virus |
DQ859065 |
UGSV |
Unbekannter Vektor, Entebbe-Fledermausvirus-Gruppe |
|||
Entebbe-Fledermausvirus |
Entebbe-Fledermausvirus |
DQ837641 |
ENTV |
Sokuluk-Virus |
AF013405 |
SOKV |
|
Yokose-Virus |
Yokose Virus |
AB114858 |
YOKV |
Unbekannter Vektor, Modoc Virus Gruppe |
|||
Apoi Virus |
Apoi Virus |
AF160193 |
APOIV |
Cowbone Ridge Virus |
Cowbone Ridge-Virus |
AF013370 |
CRV |
Jutiapa Virus |
Jutiapa Virus |
KJ469371 |
JUTV |
Modoc-Virus |
Modoc-Virus |
AJ242984 |
MODV |
Sal Vieja virus |
Sal Vieja virus |
AF013401 |
SVV |
San Perlita virus |
San Perlita-Virus |
AF013402 |
SPV |
Unbekannter Vektor, Rio-Bravo-Virus-Gruppe |
|||
Bukalasa-Fledermaus-Virus |
Bukalasa-Fledermaus-Virus |
AF013365 |
BBV |
Carey Island Virus |
Carey Island Virus |
AF013368 |
CIV |
Dakar-Fledermaus-Virus |
Dakar-Fledermaus-Virus |
AF013371 |
DBV |
Montana Myotis Leukoenzephalitis-Virus |
Montana Myotis Leukoenzephalitis-Virus |
AJ299445 |
MMLV |
Phnom Penh Fledermausvirus |
Batu Cave Virus |
AF013369 |
BCV |
Phnom Penh Fledermausvirus |
AF013394 |
PPBV |
|
Rio Bravo Virus |
Rio Bravo Virus |
AF144692 |
RBV |
Mitglied der Art
Species | Virus name | Isolate | Accession number | RefSeq number | Available sequence | Virus Abbrev. | |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Apoi-Virus | Apoi-Virus | ApMAR | AF160193 | NC_003676 | Komplettes Genom | APOIV | |
Aroa Virus | Aroa-Virus | BeAn 4073 | AY632536 | NC_009026 | Komplettes Genom | AROAV | |
Aroa-Virus | Aroa-Virus | VenA-1809 | AF013362 | Teilgenom | AROAV | ||
Aroa-Virus | Bussuquara Virus | BeAn 4073 | AF013366 | Teilgenom | BSQV | ||
Aroa Virus | Iguape-Virus | SP An71686 | AF013375 | Partialgenom | IGUV | ||
Aroa Virus | Naranjal Virus | 25008 | AF013390 | Teilgenom | NJLV | ||
Bagaza-Virus | Bagaza-Virus | DakAr B209 | AY632545 | NC_012534 | Vollständiges Genom | BAGV | |
Banzi-Virus | Banzi-Virus | SAH 366 | DQ859056 | NC_043110 | Komplett Genom | BANV | |
Bouboui Virus | Bouboui Virus | DAK AR B490 | DQ859057 | NC_033693 | Komplettes Genom | BOUV | |
Bukalasa-Fledermausvirus | Bukalasa-Fledermausvirus | UGBP-111 | AF013365 | NC_043111 | Teilgenom | BBV | |
Cacipacore Virus | Cacipacoré Virus | BeAn 3276000 | KF917536 | NC_026623 | Komplettes Genom | CPCV | |
Carey Island Virus | Carey Island Virus | P70-1215 | AF013368 | NC_043112 | Teilgenom | CIV | |
Cowbone Ridge Virus | Cowbone Ridge Virus | W-10986 | AF013370 | NC_043113 | Teilgenom | CRV | |
Dakar-Fledermaus-Virus | Dakar-Fledermaus-Virus | 209 | AF013371 | NC_043114 | Teilgenom | DBV | |
Dengue-Virus | Dengue-Virus Typ 2 | 16681 | U87411 | NC_001474 | Komplettes Genom | DENV-2 | |
Dengue-Virus | Dengue-Virus Typ 1 | 45AZ5 | U88536 | Vollständiges Genom | DENV-1 | ||
Dengue-Virus | Dengue-Virus Typ 3 | H87 | M93130 | Vollständiges Genom | DENV-3 | ||
Dengue-Virus | Dengue-Virus Typ 4 | 814669 | AF326573 | Komplettes Genom | DENV-4 | ||
Edge Hill Virus | Edge Hill Virus | YMP 48 | DQ859060 | NC_030289 | Komplettes Genom | EHV | |
Entebbe Fledermausvirus | Entebbe Fledermausvirus | UgIL-30 | DQ837641 | NC_008718 | Komplettes Genom | ENTV | |
Entebbe Fledermausvirus | Sokuluk Virus | LEIV-400K | AF013405 | Teilgenom | SOKV | ||
Gadgets Gully Virus | Gadgets Gully Virus | Aus | DQ235145 | NC_033723 | Komplettes Genom | GGYV | |
Ilheus-Virus | Ilhéus-Virus | Original | AY632539 | NC_009028 | Komplettes Genom | ILHV | |
Ilheus virus | Rocio virus | H-34675 | AF013397 | Teilgenom | ROCV | ||
Israel Truthahn-Meningoencephalomyelitis Virus | Israelisches Truthahn-Meningoenzephalomyelitis-Virus | AF013377 | NC_043115 | Partialgenom | ITV | ||
Japanisches Enzephalitis Virus | Japanisches Enzephalitis Virus | JaOArS982 | M18370 | NC_001437 | Komplettes Genom | JEV | |
Jugra Virus | Jugra Virus | P-9-314 | DQ859066 | NC_033699 | Komplettes Genom | JUGV | |
Jutiapa virus | Jutiapa virus | JG-128 | KJ469371 | NC_026620 | Komplettes Genom | JUTV | |
Kadam Virus | Kadam Virus | Uganda | DQ235146 | NC_033724 | Komplettes Genom | KADV | |
Kedougou Virus | Kédougou Virus | DakAar D1470 | AY632540 | NC_012533 | Komplettes Genom | KEDV | |
Kokobera Virus | Kokobera Virus | AusMRM 32 | AY632541 | NC_009029 | komplettes Genom | KOKV | |
Kokobera-Virus | Stratford-Virus | AUSC-338 | AF013407 | Teilgenom | STRV | ||
Koutango Virus | Koutango-Virus | Dak Ar D1470 | AF013384 | NC_043116 | Partialgenom | KOUV | |
Kyasanur Forest Disease Virus | Kyasanur Forest Disease Virus | AY323490 | NC_039218 | Komplettes Genom | KFDV | ||
Kyasanur Forest disease virus | Alkhumra Hämorrhagisches Fieber Virus | 1176 | AF331718 | Komplettes Genom | AHFV | ||
Langat-Virus | Langat-Virus | TP21 | AF253419 | NC_003690 | Ganzes Genom | LGTV | |
Lukosevirus | Lukosevirus | 369/T2 | Y07863 | NC_001809 | Komplettes Genom | LIV | |
Lippenkrankheitsvirus | Lippenkrankheitsvirus-Britischer Subtyp | LI/31 | D12937 | Partialgenom | LIV-Brit | ||
Erkältungsvirus | Erkältungsvirus-Irischer Subtyp | LI/MA54 | X86784 | Teilgenom | LIV-Ir | ||
Lungenkrankheitsvirus | Lungenkrankheitsvirus-Spanischer Subtyp | 87/2617 | DQ235152 | Komplettes codierendes Genom | LIV-Spanien | ||
Lippenkrankheitsvirus | Türkisches Schaf-Enzephalitis-Virus Subtyp | TTE80 | DQ235151 | Komplettes kodierendes Genom | TSEV | ||
Lupenkrankheitsvirus | Griechischer Ziegenenzephalititsvirus Subtyp | Vergina | DQ235153 | Komplettes kodierendes Genom | GGEV | ||
Meaban Virus | Meaban virus | Frankreich | DQ235144 | NC_033721 | Komplettes Genom | MEAV | |
Modoc virus | Modoc Virus | M544 | AJ242984 | NC_003635 | Komplettes Genom | MODV | |
Montana myotis Leukoenzephalitis-Virus | Montana Myotis Leukoenzephalitis-Virus | USA | AJ299445 | NC_004119 | Komplettes Genom | MMLV | |
Murray-Tal-Enzephalitis-Virus | Murray-Tal-Enzephalitis-Virus | 18629 | AF161266 | NC_000943 | Komplettes Genom | MVEV | |
Murray-Tal-Enzephalitis-Virus | Alfuy-Virus | MRM-3929 | AF013360 | Teilgenom | ALFV | ||
Ntaya Virus | Ntaya Virus | IPDIA | JX236040 | NC_018705 | Komplettes Genom | NTAV | |
Omsker hämorrhagisches Fieber-Virus | Omsker hämorrhagisches Fieber-Virus | Bogoluvovska | AY193805 | NC_005062 | Komplettes Genom | OHFV | |
Phnom Penh Bat Virus | Phnom Penh Bat Virus | CAMA-.38D | AF013394 | Teilgenom | PPBV | ||
Phnom Penh Fledermausvirus | Batu Cave Virus | P70-1459 | AF013369 | Teilgenom | BCV | ||
Powassan Virus | Powassan Virus | LB | L06436 | NC_003687 | Komplettes Genom | POWV | |
Powassan Virus | Hirschzeckenvirus | ctb30 | AF311056 | Komplettes codierendes Genom | DTV | ||
Rio Bravo Virus | Rio Bravo Virus | RiMAR | AF144692 | NC_003675 | Komplettes Genom | RBV | |
Royal Farm virus | Royal Farm virus | Afghanistan | DQ235149 | NC_039219 | Vollständiges Genom | RFV | |
Saboya Virus | Saboya Virus | Dak AR D4600 | DQ859062 | NC_033697 | Ganzes Genom | SABV | |
Saboya-Virus | Potiskum-Virus | IBAN 10069 | DQ859067 | Komplettes kodierendes Genom | POTV | ||
Saint Louis Enzephalitis Virus | St. Louis-Enzephalitis-Virus | Kern217 | DQ525916 | NC_007580 | Komplettes Genom | SLEV | |
Sal Vieja Virus | Sal Vieja Virus | 38TWM-106 | AF013401 | NC_043117 | Teilgenom | SVV | |
San Perlita virus | San Perlita virus | 71V-1251 | AF013402 | NC_043118 | Teilgenom | SPV | |
Saumarez Reef virus | Saumarez Reef Virus | Australien | DQ235150 | NC_033726 | Komplettes Genom | SREV | |
Sepik Virus | Sepik-Virus | MK7148 | DQ837642 | NC_008719 | Ganzes Genom | SEPV | |
Tembusu Virus | Tembusu-Virus | JS804 | JF895923 | NC_015843 | Komplettes Genom | TMUV | |
Tick-borne encephalitis virus | Tick-borne encephalitis virus-European subtype | Neudoerfl | U27495 | NC_001672 | Complete genome | TBEV-Eur | |
Zeckenenzephalitis-Virus | Zeckenenzephalitis-Virus – Fernöstlicher Subtyp | Sofjin | X07755 | Teilgenom | TBEV-FE | ||
Tick-borne encephalitis virus | Tick-borne encephalitis virus-Sibirischer Subtyp | Vasilchenko | L40361 | Komplettes Genom | TBEV-Sib | ||
Tyuleniy Virus | Tyuleniy Virus | LEIV-6C | KF815939 | NC_023424 | Komplettes Genom | TYUV | |
Uganda S Virus | Uganda S Virus | Uganda | DQ859065 | NC_033698 | Ganzes Genom | UGSV | |
Usutu-Virus | Usutu-Virus | Wien 2001 | AY453411 | NC_006551 | Ganzes Genom | USUV | |
Wesselsbron-Virus | Wesselsbron-Virus | SAH177 | EU707555 | NC_012735 | Komplettes Genom | WESSV | |
West Nil-Virus | West-Nil-Virus | 956 | M12294 | NC_001563 | komplettes Genom | WNV | |
West-Nil-Virus | Kunjin-Virus | MRM61C | D00246 | Ganzes Genom | KUNV | ||
Yaoundé-Virus | DakArY 276 | AF013413 | Teilgenom | YAOV | |||
Gelbfiebervirus | Gelbfiebervirus | 17D | X03700 | NC_002031 | Vollständiges Genom | YFV | |
Yokose-Virus | Yokose-Virus | Oita 36 | AB114858 | NC_005039 | Komplettes Genom | YOKV | |
Zika Virus | Zika Virus | MR 766 | AY632535 | NC_012532 | Komplettes Genom | ZIKV | |
Zika Virus | Zika Virus | Pf13/251013-18 | KY766069 | komplettes Genom | ZIKV | ||
Zika-Virus | Zika-Virus | H/PF/2013 | KJ776791 | komplettes Genom | ZIKV | ||
Zika Virus | Zika Virus | PRVABC59 | KX377337 | komplettes Genom | ZIKV |
Virusnamen, die Auswahl von Beispielisolaten und Virusabkürzungen, sind keine offiziellen ICTV-Bezeichnungen.
Verwandt, nicht klassifizierte Viren
Virusname |
Akzessionsnummer |
Viruskürzel |
Säugetierzecken-borne |
||
Karshi virus |
DQ235147 |
KSIV |
Mosquito-borne |
||
Fitzroy River Virus |
KM361634 |
FRV |
Spondweni Virus |
DQ859064 |
SPOV |
T’Ho-Virus |
EU879061 |
|
Insekten-spezifische Flaviviren |
||
Aedes Flavivirus |
AB488408 |
AEFV |
Aedes galloisi flavivirus |
AB639347 |
AGFV |
Anopheles flavivirus |
KX148546 |
AnFV |
Calbertado-Virus |
EU569288 |
CLBOV |
Zellfusionierendes Agens-Virus |
M91671 |
CFAV |
Cuacua-Virus |
KX245154 |
CuCuV |
Culex flavivirus |
GQ165808 |
CXFV |
Culex theileri Flavivirus |
HE574574 |
CXthFV |
Culiseta Flavivirus |
KT599442 |
CsFV |
Ecuador Paraiso Escondido Virus |
KJ152564 |
EPEV |
Hanko-Virus |
JQ268258 |
HaFV |
Kamiti River Virus |
AY149905 |
KRV |
Mercadeo-Virus |
KP688058 |
MECDV |
Moskito-Flavivirus |
KC464457 |
MoFV |
Nakiwogo Virus |
GQ165809 |
NAKV |
Nienokoue Virus |
JQ957875 |
NiFV |
Palm Creek Virus |
KC505248 |
PCFV |
Parramatta River Virus |
KT192549 |
PaRV |
Quảng Bình Virus |
FJ644291 |
QBV |
Xishuangbanna aedes Flavivirus |
KU201526 |
XFV |
Yamadai-Flavivirus |
AB981186 |
YDFV |
Viren ohne bekannten Arthropodenvektor |
||
Barkedji Virus |
KC496020 |
BJV |
Cháoyáng Virus |
FJ883471 |
CHAOV |
Donggang-Virus |
JQ086551 |
DONV |
Ilomantsi-Virus |
KC692067 |
ILOV |
Kampung Karu Virus |
KY320648 |
KPKV |
Lammi-Virus |
FJ606789 |
LAMV |
La Tina Virus |
KY320649 |
LTNV |
Long Pine Key Virus |
KY290256 |
LPKV |
Marisma Moskito Virus |
MF139576 |
MMV |
Nanay-Virus |
MF139575 |
NANV |
Ngoye-Virus |
DQ400858 |
NGOV |
Nhumirim-Virus |
KJ210048 |
NHUV |
Nounané-Virus |
EU159426 |
NOUV |
Tamana Fledermausvirus |
AF285080 |
TABV |
Segmentierte flavi-like viruses |
||
Jingmen tick virus |
KJ001579; |
JMTV |
Mogiana-Zeckenvirus |
JX390986; |
MGTV |
Alongshan Virus |
MH158415; |
ASV |
Guaico Culex virus |
KM461666; |
GCXV |
Shuangao-Insektenvirus 7 |
KR902717; |
SAIV7 |
Wuhan-Floh-Virus |
KR902713; |
WHFV |
Wuhan Blattlausvirus 1 |
KR902721; |
WHAV1 |
Wuhan aphid virus 2 |
KR902725; |
WHAV2 |
Wuhan cricket virus |
KR902709; |
WHCV |