Genus: Flavivirus

Unterscheidungsmerkmale

Das 5′-Ende des Genoms besitzt eine Typ-I-Kappe (m7GpppAmp), die bei Viren der anderen Gattungen nicht vorkommt. Die meisten Flaviviren werden durch arthropode Vektoren, Stechmücken oder Zecken, auf Wirbeltiere übertragen, in denen sie sich aktiv vermehren. Einige Flaviviren werden von Nagetieren oder Fledermäusen ohne bekannte Arthropodenvektoren übertragen.

Virion

Morphologie

Die Viren haben einen Durchmesser von 50 nm und eine kugelförmige Gestalt (Abbildung 1.Flavivirus). Es können zwei Virusformen unterschieden werden. Reife Virionen enthalten zwei viruskodierte membranassoziierte Proteine, E und M. Intrazelluläre unreife Virionen enthalten den Vorläufer prM, der während der Reifung proteolytisch in M gespalten wird (Stadler et al., 1997). In bestimmten Fällen werden auch teilweise reife/unreife Formen aus infizierten Zellen freigesetzt. Die Virionstrukturen des Dengue-Virus (DENV) und des West-Nil-Virus (WNV) wurden durch Röntgenkristallographie bestimmt (Kuhn et al., 2002, Mukhopadhyay et al., 2003). Das Hüllprotein E ist ein dimeres, stäbchenförmiges Molekül, das parallel zur Membran ausgerichtet ist und in seiner pH-neutralen Konformation keine stachelartigen Fortsätze bildet (Yu et al., 2008). Bildrekonstruktionen aus kryo-elektronenmikroskopischen Aufnahmen (Abbildung 1.Flavivirus) haben gezeigt, dass die Virionenhülle eine ikosaedrische Symmetrie aufweist, bei der die E-Protein-Dimere in einer fischgrätenartigen Anordnung organisiert sind.

Abbildung 1.Flavivirus. Dreidimensionale kryo-elektronenmikroskopische Rekonstruktionen von unreifen (links) und reifen (rechts) Partikeln eines Isolats des Dengue-Virus (mit freundlicher Genehmigung von M. Rossmann). Abgebildet ist eine Oberflächenwiedergabe des unreifen Dengue-Virus mit einer Auflösung von 12,5Å (links) und des reifen Dengue-Virus mit einer Auflösung von 10Å (rechts). Die Viren sind maßstabsgetreu abgebildet, aber nicht farblich maßstabsgetreu. Die Dreiecke umreißen eine ikosaedrische Einheit.

Physikochemische und physikalische Eigenschaften

Das Mr. des Virions ist nicht genau bestimmt worden. Reife Virionen sedimentieren bei etwa 200S und haben eine Auftriebsdichte von etwa 1,19 g cm-3 in Saccharose (Kokorev et al., 1976). Die Viren sind bei einem leicht alkalischen pH-Wert von 8,0 stabil, werden aber durch saure pH-Werte, Temperaturen über 40 °C, organische Lösungsmittel, Detergenzien, ultraviolettes Licht und Gammastrahlung leicht inaktiviert.

Nukleinsäure

Die Virion-RNA der Flaviviren ist eine infektiöse ssRNA mit positiver Richtung von 9,2-11,0 kb. Das 5′-Ende des Genoms besitzt eine Typ-I-Kappe (m-7GpppAmp), wobei auf das A ein hochkonserviertes G-Nukleotid folgt. Den 3′-Enden fehlt ein terminaler Poly(A)-Trakt und sie enden mit dem konservierten Dinukleotid CU.

Proteine

Virionen enthalten drei Strukturproteine: das Kapsid (C, 11 kDa), das Haupt-Hüllprotein (E, 50 kDa) und entweder prM (26 kDa) in unreifen Virionen oder M (8 kDa) in reifen Virionen. Das E-Protein ist das virale Hämagglutinin, das sowohl die Rezeptorbindung als auch die pH-abhängige Fusionsaktivität nach der Aufnahme durch rezeptorvermittelte Endozytose vermittelt. Sieben Nicht-Strukturproteine werden in infizierten Zellen synthetisiert: NS1 (46 kDa), NS2A (22 kDa), NS2B (14 kDa), NS3 (70 kDa), NS4A (16 kDa), NS4B (27 kDa) und NS5 (103 kDa). Einige Mitglieder der Gattung weisen Sequenzen auf, die offenbar einen Teil der translatierenden Ribosomen dazu veranlassen, sich um -1 nt zu verschieben und die Translation im neuen Leseraster fortzusetzen, um ein „Transframe“-Fusionsprotein zu erzeugen (Firth und Atkins 2009). Wenn dies funktionell genutzt wird, spricht man von programmed-1 ribosomal frameshifting (-1 PRF). NS1 hat mehrere Formen und Funktionen, wobei eine zellassoziierte Form bei der viralen RNA-Replikation funktioniert und eine sekretierte Form die Komplementaktivierung reguliert. Eine solche Form, ein NS1′-Protein, ist das Produkt eines -1 ribosomalen Frameshifts und spielt eine Rolle bei der viralen Neuroinvasivität (Melian et al., 2010). Das N-terminale Drittel von NS1 bildet zusammen mit NS2B den viralen Serinproteasekomplex, der an der Verarbeitung des Polyproteins beteiligt ist. Der C-terminale Teil von NS3 enthält eine RNA-Helicase-Domäne, die an der RNA-Replikation beteiligt ist, sowie eine RNA-Triphosphatase-Aktivität, die wahrscheinlich an der Bildung der 5′-terminalen Cap-Struktur der viralen RNA beteiligt ist. NS5 ist das größte und am höchsten konservierte Protein, das als virales RdRP fungiert und auch eine Methyltransferase-Aktivität besitzt, die an der Modifikation der viralen Cap-Struktur beteiligt ist.

Lipide

Viren enthalten ca. 17% Lipide, die aus den Membranen der Wirtszellen stammen.

Kohlenhydrate

Viren enthalten ca. 9% Kohlenhydrate (Glykolipide, Glykoproteine), deren Zusammensetzung und Struktur von der Wirtszelle (Wirbeltier oder Arthropode) abhängen. N-Glykosylierungsstellen sind in den Proteinen prM (1 bis 3 Stellen), E (0 bis 2 Stellen) und NS1 (1 bis 3 Stellen) vorhanden.

Genomorganisation und Replikation

Die genomische RNA ist die einzige virale Boten-RNA in infizierten Zellen. Sie besteht aus einem einzigen langen ORF von mehr als 10.000 nt, der für alle strukturellen und nicht-strukturellen Proteine kodiert und von NCRs am 5′- und 3′-terminalen Ende flankiert wird (Abbildung 2.Flavivirus).

Abbildung 2.Flavivirus. Flavivirus-Genomorganisation (nicht maßstabsgetreu) und Polyproteinprozessierung. Die RNA des Virions ist etwa 11 kb lang. Oben ist das virale Genom mit den kodierenden Regionen für strukturelle und nicht-strukturelle Proteine sowie den 5′- und 3′-NCRs dargestellt. Die Kästchen unter dem Genom bezeichnen virale Proteine, die durch die proteolytische Prozessierungskaskade gebildet werden. P-, H- und R-Symbole zeigen die Lokalisierung der NS3-Protease, der NS3-RNA-Helikase bzw. der NS5-RdRP-Domäne an.

Sowohl die 5′-NCR als auch die 3′-NCR enthalten RNA-Sequenzmotive, die an der viralen RNA-Translation, der Replikation und möglicherweise der Verpackung beteiligt sind. Obwohl die sekundäre RNA-Struktur und die Funktion einiger Elemente konserviert sind, können die Sequenzzusammensetzung, die Länge und die genaue Lokalisierung zwischen verschiedenen Mitgliedern der Gattung erheblich variieren, insbesondere zwischen durch Zecken und Mücken übertragenen Flaviviren. In einigen Fällen enthält der 3′-NCR des durch Zecken übertragenen Enzephalitis-Virus beispielsweise einen internen Poly(A)-Trakt. Die Virusinfektion führt zu einer dramatischen Umstrukturierung der Zellmembranstrukturen innerhalb des perinukleären endoplasmatischen Retikulums (ER) und zur Bildung von aus dem ER stammenden vesikulären Paketen, die höchstwahrscheinlich die Orte der viralen Replikation darstellen. Nach der Übersetzung der eingehenden genomischen RNA beginnt die RNA-Replikation mit der Synthese komplementärer negativer Stränge, die dann als Vorlage für die Herstellung zusätzlicher positivsträngiger Moleküle in Genomlänge verwendet werden. Diese werden durch einen semikonservativen Mechanismus synthetisiert, an dem replikative Zwischenstufen (die sowohl doppelsträngige Regionen als auch naszierende einzelsträngige Moleküle enthalten) und replikative Formen (Duplex-RNA-Moleküle) beteiligt sind. Die Translation beginnt in der Regel am ersten AUG des ORF, kann aber bei durch Moskitos übertragenen Flaviviren auch an einem zweiten, 12 bis 14 Codons stromabwärts gelegenen In-Frame-AUG erfolgen. Das Polyprotein wird durch zelluläre Proteasen und die virale Serinprotease NS2B-NS3 zu den reifen Struktur- und Nichtstrukturproteinen verarbeitet. Die Proteintopologie in Bezug auf das ER und das Zytoplasma wird durch interne Signal- und Stop-Transfer-Sequenzen bestimmt. Viruspartikel können zunächst im rauen endoplasmatischen Retikulum beobachtet werden, das vermutlich der Ort der Virusassemblierung ist. Diese unreifen Virionen werden dann durch die Membransysteme des sekretorischen Weges des Wirts zur Zelloberfläche transportiert, wo die Exozytose stattfindet. Kurz vor der Freisetzung der Virionen wird das prM-Protein durch Furin oder eine Furin-ähnliche zelluläre Protease gespalten, um reife Virionen zu erzeugen. Infizierte Zellen setzen auch ein nicht-infektiöses subvirales Partikel frei, das einen niedrigeren Sedimentationskoeffizienten als das ganze Virus hat (70S statt 200S) und eine Hämagglutinationsaktivität aufweist.

Biologie

Wirtsbereich

Flaviviren können eine Vielzahl von Wirbeltierarten und in vielen Fällen auch Arthropoden infizieren. Einige Viren haben ein begrenztes Wirtsspektrum bei Wirbeltieren (z. B. nur Primaten), während andere eine Vielzahl von Arten (Säugetiere, Vögel usw.) infizieren und sich in ihnen vermehren können. Der übliche Infektionsweg für Arthropoden besteht darin, dass sie sich von einem virämischen Wirbeltierwirt ernähren, doch wurde für durch Zecken übertragene Flaviviren auch eine nicht-virämische Übertragung zwischen Vektoren beschrieben. Eine neue Gruppe nicht klassifizierter Viren der Gattung, darunter das Cell Fusing Agent Virus, scheint nur Stechmücken zu infizieren, und mehrere weitere, genetisch sehr unterschiedliche reine Insektenflaviviren wurden jetzt identifiziert (Blitvich und Firth 2015).

Übertragung

Die meisten Flaviviren sind von Arthropoden übertragene Viren mit Übertragungszyklen von hämatophagen Arthropodenvektoren auf Wirbeltierwirte. Etwa 50 % der bekannten Flaviviren werden von Stechmücken übertragen, 28 % von Zecken und der Rest von Nagetieren oder Fledermäusen ohne bekannte Arthropodenvektoren. Bei einigen Flaviviren ist der Übertragungszyklus noch nicht bekannt. In bestimmten Fällen können Flaviviren durch Blutprodukte, Organtransplantationen, nicht pasteurisierte Milch oder Aerosole auf den Menschen übertragen werden. Von einigen durch Zecken übertragenen Flaviviren ist bekannt, dass sie direkt von Zecke zu Zecke übertragen werden. Bei den Arthropoden-Vektoren können die Viren auch transovarial oder vertikal (Stechmücken, Zecken) und transstadial (Zecken) übertragen werden. Zu den Mechanismen der Virusübertragung bei den reinen Insektenflaviviren gehört möglicherweise die vertikale Übertragung, aber es müssen auch andere Mechanismen in Betracht gezogen werden, um den Erfolg zu erklären, mit dem sich diese Viren weltweit ausgebreitet haben.

Geografische Verbreitung

Flaviviren sind weltweit verbreitet, aber einzelne Arten sind auf bestimmte endemische oder epidemische Gebiete beschränkt (z.B., Gelbfiebervirus in tropischen und subtropischen Regionen Afrikas und Südamerikas; Dengue-Virus in tropischen Gebieten Asiens, Ozeaniens, Afrikas, Australiens und Amerikas; Japanisches Enzephalitis-Virus in Südostasien; Zeckenenzephalitis-Virus in Europa und Nordasien).

Pathogenität

Mehr als 50 % der bekannten Flaviviren wurden mit menschlichen Erkrankungen in Verbindung gebracht, darunter viele wichtige menschliche Krankheitserreger wie das Gelbfiebervirus, das Dengue-Virus, das Zika-Virus, das Japanische Enzephalitis-Virus, das West-Nil-Virus und das durch Zecken übertragene Enzephalitis-Virus. Die ausgelösten Krankheiten können mit Symptomen des zentralen Nervensystems (z. B. Meningitis, Enzephalitis), Fieber, Arthralgie, Hautausschlag und hämorrhagischem Fieber einhergehen. Mehrere Flaviviren sind pathogen für Haus- oder Wildtiere (Truthahn, Schwein, Pferd, Schaf, Hund, Moorhuhn, Bisamratte) und verursachen wirtschaftlich bedeutende Krankheiten.

Antigenität

Alle Flaviviren sind serologisch verwandt, was durch Bindungstests wie ELISA und durch Hämagglutinationshemmung mit polyklonalen und monoklonalen Antikörpern nachgewiesen werden kann. Neutralisationstests sind aussagekräftiger und wurden zur Identifizierung enger verwandter Flavivirus-Serokomplexe (wie in Abbildung 1.Flaviviridae dargestellt) verwendet, allerdings nicht bis auf Artniveau. Das Hüllprotein E ist das Hauptziel für neutralisierende Antikörper und löst eine schützende Immunität aus. Das E-Protein induziert auch kreuzreaktive, nicht-neutralisierende Antikörper gegen Flaviviren. Antigene, die an der Neutralisierung beteiligt sind, wurden in jeder der drei Strukturdomänen des E-Proteins lokalisiert. Die prM- und NS1-Proteine können ebenfalls Antikörper induzieren, die infizierte Tiere vor einer tödlichen Infektion schützen.

Speziesabgrenzungskriterien

Speziesabgrenzungskriterien in der Gattung umfassen:

  • Nukleotid- und abgeleitete Aminosäuresequenzdaten.
  • Antigene Merkmale.
  • Geografische Assoziation.
  • Vektorassoziation.
  • Wirtsassoziation.
  • Krankheitsassoziation.
  • Ökologische Merkmale.

Bei der Abgrenzung von Arten wird eine Kombination der oben aufgeführten Kriterien berücksichtigt. Während die Nukleotidsequenzverwandtschaft und die sich daraus ergebenden Phylogenien wichtige Kriterien für die Artabgrenzung sind, können die anderen aufgeführten Kriterien bei der Abgrenzung von genetisch eng verwandten Viren besonders nützlich sein. So weisen beispielsweise fernöstliche (FE) Stämme des Zeckenenzephalitis-Virus im Vergleich zum Virus des hämorrhagischen Fiebers von Omsk deutliche ökologische Unterschiede auf, obwohl sie genetisch relativ eng miteinander verwandt sind. FE-Stämme des Zeckenenzephalitis-Virus sind vorwiegend mit Ixodes persulcatus-Zecken in Waldgebieten im fernen Osten Russlands assoziiert, während das Omsk-Virus des hämorrhagischen Fiebers in den Steppenregionen Westsibiriens vor allem mit Dermacentor spp. und in geringerem Maße mit Ixodes spp. assoziiert ist. Diese Viren sind auch in Neutralisationstests mit Rekonvaleszentenseren antigenisch unterscheidbar.

Lupenkrankheitsvirus und Zeckenenzephalitisvirus sind ein weiteres Beispiel für Viren, die trotz ihrer engen genetischen Verwandtschaft und ähnlicher Wirtsbereiche unterschiedliche Ökologien (Moorlandschaften versus Wälder), Pathogenitäten (Rothühner, Schafe/Ziegen versus Menschen) und geografische Verbreitungen (Großbritannien versus Europa/Eurasien) aufweisen, was ihre Klassifizierung als Mitglieder verschiedener Spezies rechtfertigt, nämlich Lupenkrankheitsvirus und Zeckenenzephalitisvirus.

Die vier Dengue-Virus-Serotypen hingegen gehören alle zu einer einzigen Spezies (Dengue-Virus), obwohl sie phylogenetisch und antigenetisch recht unterschiedlich sind. Dies ist durch die Tatsache gerechtfertigt, dass sie in denselben geografischen Gebieten und ökologischen Lebensräumen zirkulieren, identische Vektoren nutzen und ähnliche Lebenszyklen und Krankheitsmanifestationen aufweisen (Tabelle 1.Flavivirus).

Tabelle 1.Flavivirus. Flaviviren, gruppiert nach Vektor und Wirt.

>Omsker hämorrhagisches Fieber-Virus

Virusart

Virusname

Akzessionsnummer

Viruskürzel

Zecken-übertragen, Säugetierwirt

Gadgets Gully Virus

Gadgets Gully Virus

DQ235145

GGYV

Kyasanur Waldkrankheitsvirus

Kyasanur Waldkrankheitsvirus

AY323490

KFDV

Alkhumra hämorrhagisches Fieber Virus

AF331718

AHFV

Langat-Virus

Langat-Virus

AF253419

LGTV

Louping krankes Virus

Lutschendes krankes Virus

Y07863

LIV

Britischer Subtyp

D12937

LIV-.Brit

Irischer Untertyp

X86784

LIV-Ir

Spanischer Subtyp

DQ235152

LIV-Spanien

Türkisches Schaf-Enzephalitis-Virus Subtyp

DQ235151

TSEV

Griechische Ziegenenzephalitis Virus-Subtyp

DQ235153

GGEV

Omsker hämorrhagisches Fieber-Virus

AY193805

OHFV

Powassan-Virus

Powassan-Virus

L06436

POWV

Hirschzeckenvirus

AF311056

DTV

Royal Farm Virus

Royal Farm virus

DQ235149

RFV

Tick-borne encephalitis virus

Europäischer Subtyp

U27495

TBEV-Eur

Fernöstlicher Subtyp

X07755

TBEV-FE

Sibirischer Subtyp

L40361

TBEV-Sib

Zecken-übertragen, Seevogelwirt

Meaban-Virus

Meaban-Virus

DQ235144

MEAV

Saumarez Reef virus

Saumarez Reef Virus

DQ235150

SREV

Tyuleniy Virus

Tyuleniy-Virus

KF815939

TYUV

Wahrscheinlich Zecken-übertragbar

Kadam-Virus

Kadam Virus

DQ235146

KADV

Mosquito-übertragbar, Aroa-Virus-Gruppe

Aroa-Virus

Aroa-Virus

AY632536

AROAV

Bussuquara-Virus

AF013366

BSQV

Iguape-Virus

AF013375

IGUV

Naranjal-Virus

AF013390

NJLV

Mosquito-übertragbar, Dengue-Virus-Gruppe

Dengue-Virus

Dengue-Virus 1

U88536

DENV-1

Dengue-Virus 2

U87411

DENV-2

Dengue-Virus 3

M93130

DENV-3

Dengue-Virus 4

AF326573

DENV-4

Moskitoübertragen, Japanische Enzephalitis Virus Gruppe

Cacipacore Virus

Cacipacoré Virus

KF917536

CPCV

Japanische Enzephalitis-Virus

Japanisches Enzephalitis-Virus

M18370

JEV

Koutango-Virus

Koutango-Virus

AF013384

KOUV

Murray-Tal-Enzephalitis-Virus

Alfuy-Virus

AF013360

ALFV

Murray Valley Enzephalitis-Virus

AF161266

MVEV

St. Louis Enzephalitis-Virus

St. Louis-Enzephalitis-Virus

DQ525916

SLEV

Usutu-Virus

Usutu-Virus

AY453411

USUV

West Nil Virus

Kunjin Virus

D00246

KUNV

West Nil Virus

M12294

WNV

Yaoundé-Virus

Yaoundé-Virus

AF013413

YAOV

Mosquito-übertragbar, Kokobera-Virus-Gruppe

Kokobera-Virus

Kokobera-Virus

AY632541

KOKV

Stratford-Virus

AF013407

STRV

Mosquito-übertragbar, Ntaya Virus Gruppe

Bagaza Virus

Bagaza Virus

AY632545

BAGV

Ilheus-Virus

Ilhéus-Virus

AY632539

ILHV

Rocio-Virus

AF013397

ROCV

Israel Truthahn-Meningoenzephalitis-Virus

Israel Truthahn Meningoenzephalitis-Virus

AF013377

ITV

Ntaya Virus

Ntaya Virus

JX236040

NTAV

Tembusu Virus

Tembusu Virus

JF895923

TMUV

Zika Virus

Zika Virus

AY632535

ZIKV

Mosquito-übertragbar, Gelbfieber-Virus-Gruppe

Sepik-Virus

Sepik-Virus

DQ837642

SEPV

Wesselsbron-Virus

Wesselsbron Virus

EU707555

WESSV

Gelbfiebervirus

Gelbfiebervirus

X03700

YFV

Wahrscheinlich durch Mückenborne, Kedougou-Virus-Gruppe

Kedougou-Virus

Kédougou-Virus

AY632540

KEDV

wahrscheinlich durch Mücken übertragen, Edge Hill Virus Gruppe

Banzi Virus

Banzi Virus

DQ859056

BANV

Boubouivirus

Boubouivirus

DQ859057

BOUV

Edge Hill Virus

Edge Hill Virus

DQ859060

EHV

Jugra Virus

Jugra Virus

DQ859066

JUGV

Saboya Virus

Potiskum-Virus

DQ859067

POTV

Saboya Virus

DQ859062

SABV

Uganda S Virus

Uganda S virus

DQ859065

UGSV

Unbekannter Vektor, Entebbe-Fledermausvirus-Gruppe

Entebbe-Fledermausvirus

Entebbe-Fledermausvirus

DQ837641

ENTV

Sokuluk-Virus

AF013405

SOKV

Yokose-Virus

Yokose Virus

AB114858

YOKV

Unbekannter Vektor, Modoc Virus Gruppe

Apoi Virus

Apoi Virus

AF160193

APOIV

Cowbone Ridge Virus

Cowbone Ridge-Virus

AF013370

CRV

Jutiapa Virus

Jutiapa Virus

KJ469371

JUTV

Modoc-Virus

Modoc-Virus

AJ242984

MODV

Sal Vieja virus

Sal Vieja virus

AF013401

SVV

San Perlita virus

San Perlita-Virus

AF013402

SPV

Unbekannter Vektor, Rio-Bravo-Virus-Gruppe

Bukalasa-Fledermaus-Virus

Bukalasa-Fledermaus-Virus

AF013365

BBV

Carey Island Virus

Carey Island Virus

AF013368

CIV

Dakar-Fledermaus-Virus

Dakar-Fledermaus-Virus

AF013371

DBV

Montana Myotis Leukoenzephalitis-Virus

Montana Myotis Leukoenzephalitis-Virus

AJ299445

MMLV

Phnom Penh Fledermausvirus

Batu Cave Virus

AF013369

BCV

Phnom Penh Fledermausvirus

AF013394

PPBV

Rio Bravo Virus

Rio Bravo Virus

AF144692

RBV

Mitglied der Art

Exemplarisches Isolat der Art
Species Virus name Isolate Accession number RefSeq number Available sequence Virus Abbrev.
Apoi-Virus Apoi-Virus ApMAR AF160193 NC_003676 Komplettes Genom APOIV
Aroa Virus Aroa-Virus BeAn 4073 AY632536 NC_009026 Komplettes Genom AROAV
Aroa-Virus Aroa-Virus VenA-1809 AF013362 Teilgenom AROAV
Aroa-Virus Bussuquara Virus BeAn 4073 AF013366 Teilgenom BSQV
Aroa Virus Iguape-Virus SP An71686 AF013375 Partialgenom IGUV
Aroa Virus Naranjal Virus 25008 AF013390 Teilgenom NJLV
Bagaza-Virus Bagaza-Virus DakAr B209 AY632545 NC_012534 Vollständiges Genom BAGV
Banzi-Virus Banzi-Virus SAH 366 DQ859056 NC_043110 Komplett Genom BANV
Bouboui Virus Bouboui Virus DAK AR B490 DQ859057 NC_033693 Komplettes Genom BOUV
Bukalasa-Fledermausvirus Bukalasa-Fledermausvirus UGBP-111 AF013365 NC_043111 Teilgenom BBV
Cacipacore Virus Cacipacoré Virus BeAn 3276000 KF917536 NC_026623 Komplettes Genom CPCV
Carey Island Virus Carey Island Virus P70-1215 AF013368 NC_043112 Teilgenom CIV
Cowbone Ridge Virus Cowbone Ridge Virus W-10986 AF013370 NC_043113 Teilgenom CRV
Dakar-Fledermaus-Virus Dakar-Fledermaus-Virus 209 AF013371 NC_043114 Teilgenom DBV
Dengue-Virus Dengue-Virus Typ 2 16681 U87411 NC_001474 Komplettes Genom DENV-2
Dengue-Virus Dengue-Virus Typ 1 45AZ5 U88536 Vollständiges Genom DENV-1
Dengue-Virus Dengue-Virus Typ 3 H87 M93130 Vollständiges Genom DENV-3
Dengue-Virus Dengue-Virus Typ 4 814669 AF326573 Komplettes Genom DENV-4
Edge Hill Virus Edge Hill Virus YMP 48 DQ859060 NC_030289 Komplettes Genom EHV
Entebbe Fledermausvirus Entebbe Fledermausvirus UgIL-30 DQ837641 NC_008718 Komplettes Genom ENTV
Entebbe Fledermausvirus Sokuluk Virus LEIV-400K AF013405 Teilgenom SOKV
Gadgets Gully Virus Gadgets Gully Virus Aus DQ235145 NC_033723 Komplettes Genom GGYV
Ilheus-Virus Ilhéus-Virus Original AY632539 NC_009028 Komplettes Genom ILHV
Ilheus virus Rocio virus H-34675 AF013397 Teilgenom ROCV
Israel Truthahn-Meningoencephalomyelitis Virus Israelisches Truthahn-Meningoenzephalomyelitis-Virus AF013377 NC_043115 Partialgenom ITV
Japanisches Enzephalitis Virus Japanisches Enzephalitis Virus JaOArS982 M18370 NC_001437 Komplettes Genom JEV
Jugra Virus Jugra Virus P-9-314 DQ859066 NC_033699 Komplettes Genom JUGV
Jutiapa virus Jutiapa virus JG-128 KJ469371 NC_026620 Komplettes Genom JUTV
Kadam Virus Kadam Virus Uganda DQ235146 NC_033724 Komplettes Genom KADV
Kedougou Virus Kédougou Virus DakAar D1470 AY632540 NC_012533 Komplettes Genom KEDV
Kokobera Virus Kokobera Virus AusMRM 32 AY632541 NC_009029 komplettes Genom KOKV
Kokobera-Virus Stratford-Virus AUSC-338 AF013407 Teilgenom STRV
Koutango Virus Koutango-Virus Dak Ar D1470 AF013384 NC_043116 Partialgenom KOUV
Kyasanur Forest Disease Virus Kyasanur Forest Disease Virus AY323490 NC_039218 Komplettes Genom KFDV
Kyasanur Forest disease virus Alkhumra Hämorrhagisches Fieber Virus 1176 AF331718 Komplettes Genom AHFV
Langat-Virus Langat-Virus TP21 AF253419 NC_003690 Ganzes Genom LGTV
Lukosevirus Lukosevirus 369/T2 Y07863 NC_001809 Komplettes Genom LIV
Lippenkrankheitsvirus Lippenkrankheitsvirus-Britischer Subtyp LI/31 D12937 Partialgenom LIV-Brit
Erkältungsvirus Erkältungsvirus-Irischer Subtyp LI/MA54 X86784 Teilgenom LIV-Ir
Lungenkrankheitsvirus Lungenkrankheitsvirus-Spanischer Subtyp 87/2617 DQ235152 Komplettes codierendes Genom LIV-Spanien
Lippenkrankheitsvirus Türkisches Schaf-Enzephalitis-Virus Subtyp TTE80 DQ235151 Komplettes kodierendes Genom TSEV
Lupenkrankheitsvirus Griechischer Ziegenenzephalititsvirus Subtyp Vergina DQ235153 Komplettes kodierendes Genom GGEV
Meaban Virus Meaban virus Frankreich DQ235144 NC_033721 Komplettes Genom MEAV
Modoc virus Modoc Virus M544 AJ242984 NC_003635 Komplettes Genom MODV
Montana myotis Leukoenzephalitis-Virus Montana Myotis Leukoenzephalitis-Virus USA AJ299445 NC_004119 Komplettes Genom MMLV
Murray-Tal-Enzephalitis-Virus Murray-Tal-Enzephalitis-Virus 18629 AF161266 NC_000943 Komplettes Genom MVEV
Murray-Tal-Enzephalitis-Virus Alfuy-Virus MRM-3929 AF013360 Teilgenom ALFV
Ntaya Virus Ntaya Virus IPDIA JX236040 NC_018705 Komplettes Genom NTAV
Omsker hämorrhagisches Fieber-Virus Omsker hämorrhagisches Fieber-Virus Bogoluvovska AY193805 NC_005062 Komplettes Genom OHFV
Phnom Penh Bat Virus Phnom Penh Bat Virus CAMA-.38D AF013394 Teilgenom PPBV
Phnom Penh Fledermausvirus Batu Cave Virus P70-1459 AF013369 Teilgenom BCV
Powassan Virus Powassan Virus LB L06436 NC_003687 Komplettes Genom POWV
Powassan Virus Hirschzeckenvirus ctb30 AF311056 Komplettes codierendes Genom DTV
Rio Bravo Virus Rio Bravo Virus RiMAR AF144692 NC_003675 Komplettes Genom RBV
Royal Farm virus Royal Farm virus Afghanistan DQ235149 NC_039219 Vollständiges Genom RFV
Saboya Virus Saboya Virus Dak AR D4600 DQ859062 NC_033697 Ganzes Genom SABV
Saboya-Virus Potiskum-Virus IBAN 10069 DQ859067 Komplettes kodierendes Genom POTV
Saint Louis Enzephalitis Virus St. Louis-Enzephalitis-Virus Kern217 DQ525916 NC_007580 Komplettes Genom SLEV
Sal Vieja Virus Sal Vieja Virus 38TWM-106 AF013401 NC_043117 Teilgenom SVV
San Perlita virus San Perlita virus 71V-1251 AF013402 NC_043118 Teilgenom SPV
Saumarez Reef virus Saumarez Reef Virus Australien DQ235150 NC_033726 Komplettes Genom SREV
Sepik Virus Sepik-Virus MK7148 DQ837642 NC_008719 Ganzes Genom SEPV
Tembusu Virus Tembusu-Virus JS804 JF895923 NC_015843 Komplettes Genom TMUV
Tick-borne encephalitis virus Tick-borne encephalitis virus-European subtype Neudoerfl U27495 NC_001672 Complete genome TBEV-Eur
Zeckenenzephalitis-Virus Zeckenenzephalitis-Virus – Fernöstlicher Subtyp Sofjin X07755 Teilgenom TBEV-FE
Tick-borne encephalitis virus Tick-borne encephalitis virus-Sibirischer Subtyp Vasilchenko L40361 Komplettes Genom TBEV-Sib
Tyuleniy Virus Tyuleniy Virus LEIV-6C KF815939 NC_023424 Komplettes Genom TYUV
Uganda S Virus Uganda S Virus Uganda DQ859065 NC_033698 Ganzes Genom UGSV
Usutu-Virus Usutu-Virus Wien 2001 AY453411 NC_006551 Ganzes Genom USUV
Wesselsbron-Virus Wesselsbron-Virus SAH177 EU707555 NC_012735 Komplettes Genom WESSV
West Nil-Virus West-Nil-Virus 956 M12294 NC_001563 komplettes Genom WNV
West-Nil-Virus Kunjin-Virus MRM61C D00246 Ganzes Genom KUNV
Yaoundé-Virus DakArY 276 AF013413 Teilgenom YAOV
Gelbfiebervirus Gelbfiebervirus 17D X03700 NC_002031 Vollständiges Genom YFV
Yokose-Virus Yokose-Virus Oita 36 AB114858 NC_005039 Komplettes Genom YOKV
Zika Virus Zika Virus MR 766 AY632535 NC_012532 Komplettes Genom ZIKV
Zika Virus Zika Virus Pf13/251013-18 KY766069 komplettes Genom ZIKV
Zika-Virus Zika-Virus H/PF/2013 KJ776791 komplettes Genom ZIKV
Zika Virus Zika Virus PRVABC59 KX377337 komplettes Genom ZIKV
Virusnamen, die Auswahl von Beispielisolaten und Virusabkürzungen, sind keine offiziellen ICTV-Bezeichnungen.

Verwandt, nicht klassifizierte Viren

Virusname

Akzessionsnummer

Viruskürzel

Säugetierzecken-borne

Karshi virus

DQ235147

KSIV

Mosquito-borne

Fitzroy River Virus

KM361634

FRV

Spondweni Virus

DQ859064

SPOV

T’Ho-Virus

EU879061

Insekten-spezifische Flaviviren

Aedes Flavivirus

AB488408

AEFV

Aedes galloisi flavivirus

AB639347

AGFV

Anopheles flavivirus

KX148546

AnFV

Calbertado-Virus

EU569288

CLBOV

Zellfusionierendes Agens-Virus

M91671

CFAV

Cuacua-Virus

KX245154

CuCuV

Culex flavivirus

GQ165808

CXFV

Culex theileri Flavivirus

HE574574

CXthFV

Culiseta Flavivirus

KT599442

CsFV

Ecuador Paraiso Escondido Virus

KJ152564

EPEV

Hanko-Virus

JQ268258

HaFV

Kamiti River Virus

AY149905

KRV

Mercadeo-Virus

KP688058

MECDV

Moskito-Flavivirus

KC464457

MoFV

Nakiwogo Virus

GQ165809

NAKV

Nienokoue Virus

JQ957875

NiFV

Palm Creek Virus

KC505248

PCFV

Parramatta River Virus

KT192549

PaRV

Quảng Bình Virus

FJ644291

QBV

Xishuangbanna aedes

Flavivirus

KU201526

XFV

Yamadai-Flavivirus

AB981186

YDFV

Viren ohne bekannten Arthropodenvektor

Barkedji Virus

KC496020

BJV

Cháoyáng Virus

FJ883471

CHAOV

Donggang-Virus

JQ086551

DONV

Ilomantsi-Virus

KC692067

ILOV

Kampung Karu Virus

KY320648

KPKV

Lammi-Virus

FJ606789

LAMV

La Tina Virus

KY320649

LTNV

Long Pine Key Virus

KY290256

LPKV

Marisma Moskito Virus

MF139576

MMV

Nanay-Virus

MF139575

NANV

Ngoye-Virus

DQ400858

NGOV

Nhumirim-Virus

KJ210048

NHUV

Nounané-Virus

EU159426

NOUV

Tamana Fledermausvirus

AF285080

TABV

Segmentierte flavi-like viruses

Jingmen tick virus

KJ001579;
KJ001580;
KJ001581;
KJ001582

JMTV

Mogiana-Zeckenvirus

JX390986;
KY523073;
JX390985;
KY523074

MGTV

Alongshan Virus

MH158415;
MH158416;
MH158417;
MH158418

ASV

Guaico Culex virus

KM461666;
KM461667;
KM461668;
KM461669;
KM461670

GCXV

Shuangao-Insektenvirus 7

KR902717;
KR902718;
KR902719;
KR902720

SAIV7

Wuhan-Floh-Virus

KR902713;
KR902714;
KR902715;
KR902716

WHFV

Wuhan Blattlausvirus 1

KR902721;
KR902722;
KR902723;
KR902724

WHAV1

Wuhan aphid virus 2

KR902725;
KR902726;
KR902727;
KR902728

WHAV2

Wuhan cricket virus

KR902709;
KR902710;
KR902711;
KR902712

WHCV

Virusnamen und Virusabkürzungen sind keine offiziellen ICTV-Bezeichnungen.

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