Amazonische Seekühe sind Pflanzenfresser, haben also keine Schneide- oder Eckzähne, sondern sind mit Backenzähnen ausgestattet, die zum Zerkleinern der Unterwasservegetation bestimmt sind. Seltsamerweise scheinen Amazonas-Seekühe im Gegensatz zu anderen Säugetieren ihre Backenzähne im hinteren Teil ihres Kiefers zu regenerieren. Abgenutzte Backenzähne, die ausfallen, werden schnell durch brandneue Backenzähne ersetzt, die sich nach vorne bewegen, um die Lücken zu schließen.
Sie sind so sanftmütig wie ihr Gesicht und bevorzugen ruhige Schwarzwasserseen und Lagunen. In diesen Gebieten gibt es eine üppige Unterwasservegetation, von der sie sich ernähren können. Wenn die Trockenzeit anbricht und sich das Wasser des Regenwaldes zurückzieht, können Amazonas-Seekühe wochen- oder monatelang fasten, wenn die Vegetation knapp ist. Sie ernähren sich bevorzugt von aquatischer und semi-aquatischer Vegetation wie Gräsern, Wassersalat, Wasserblasen, Hornkraut, Seerosen und Wasserhyazinthen, und wenn eine Palmfrucht ins Wasser fällt, fressen sie auch diese. An einem durchschnittlichen Tag kann eine Amazonas-Seekuh bis zu 5 bis 18 % ihres Körpergewichts fressen. Wenn Fasten notwendig ist, ermöglichen es die Fettreserven und der niedrige Stoffwechsel der Amazonas-Seekuh, bis zu sieben Monate mit wenig oder gar keiner Nahrung zu überleben.
Als Einzelgänger durchstreift sie das gesamte Amazonasbecken und kann in Ecuador, Kolumbien, Peru, Bolivien, Venezuela, Guyana und Brasilien gesichtet werden. Manchmal findet man die einsame Seekuh auch in Gruppen von bis zu acht Tieren. Man findet sie bei der Nahrungsaufnahme auf der Oberfläche von Seen und Flüssen. Besucher werden wahrscheinlich zuerst die Nase der Seekühe sehen, da sie alle vier Minuten mit der Nase voran an die frische Luft kommen. Im Gegensatz zu ihren internationalen Vettern lebt die Amazonas-Seekuh ausschließlich in Süßwasserumgebungen.
Auf der Suche nach Nahrung folgen Amazonas-Seekühe den saisonalen Bewegungen des Amazonas-Flusses. In der Regenzeit ziehen die Seekühe in überschwemmte Gebiete, die nährstoffreich und vegetationsreich sind, in der Trockenzeit dagegen in tiefere Gewässer.
Amazonas-Seekühe brüten saisonal während der Zeit, in der der Wasserstand steigt. In Ecuador wurden die meisten Geburten in den Monaten Januar und Juni gemeldet, aber im Allgemeinen scheinen Geburten häufig zwischen Dezember und Juli stattzufinden, wobei die meisten zwischen Februar und Mai auftreten. Die Trächtigkeitsdauer beträgt zwölf bis vierzehn Monate, und die Weibchen bekommen in der Regel alle zwei Jahre ein weiteres Jungtier. Nach der Geburt werden die Jungtiere auf dem Rücken ihrer Mütter getragen oder schwimmen dicht an deren Seite.
Amazonen-Seekühe kontrollieren ihre Körpertemperatur auf eine besondere Weise. Schließmuskeln in ihren Blutgefäßen leiten den Blutfluss in Bereiche um, die in engem Kontakt zum Wasser stehen. Außerdem nutzen sie ihr Körperfett, um den Wärmeverlust zu verringern. Dies ist besonders nützlich bei der abendlichen Nahrungssuche, da Amazonas-Seekühe sowohl tag- als auch nachtaktiv sind.
Zu den natürlichen Fressfeinden der Amazonas-Seekühe gehören Haie, Krokodile und Jaguare. Leider wird das Fett und Fleisch der Seekühe von menschlichen Jägern sehr geschätzt, die das sich langsam bewegende Tier über Seen und Flüsse verfolgen. Die genaue Anzahl der Seekühe in Ecuador ist nicht bekannt, aber man geht davon aus, dass sie aufgrund des Verlusts ihres Lebensraums, der Fischerei und der Verschmutzung durch Ölförderprojekte und Ölverschmutzung stark gefährdet sind. Die Amazonas-Seekuh ist auf ihre eigene Weise wunderschön und eine gefährdete Art, die von der Unterstützung aller Besucher aus dem In- und Ausland profitieren kann.