Differenzgel-Elektrophorese (DIGE)

Die Proteinanalyse wird zunehmend zu einem Eckpfeiler bei der Entschlüsselung der molekularen Mechanismen des Lebens. Die Proteomik, die großmaßstäbliche und hochempfindliche Analyse von Proteinen, ist bereits ein zentraler Bestandteil der neuen Biowissenschaften wie der Systembiologie und der Systemmedizin. Die Proteomik hängt jedoch in hohem Maße von den bisherigen und künftigen Fortschritten bei den Proteinreinigungs- und -analyseverfahren ab. Die DIGE, die Proteine in ihrer intakten Form quantifizieren kann, ist eine der wenigen Methoden, die diese Art der Analyse erleichtern und gleichzeitig die Protein-Isoformen in einem MS-kompatiblen Zustand für die weitere Identifizierung und Charakterisierung mit hoher analytischer Empfindlichkeit bereitstellen kann. Differentialgel-Elektrophorese: Methods and Protocols führt in das Konzept der DIGE und ihre Vorteile für die quantitative Proteinanalyse ein. Es enthält detaillierte Protokolle und wichtige Hinweise zu den praktischen Aspekten der DIGE mit sowohl allgemeinen als auch spezifischen Anwendungen in den verschiedenen Bereichen der quantitativen Proteomik. Aufgeteilt in vier prägnante Abschnitte, beginnt dieser ausführliche Band mit den Grundlagen der DIGE, der Technik und ihren praktischen Details mit einem Schwerpunkt auf der Planung eines DIGE-Experiments und seiner Datenanalyse. Der nächste Abschnitt stellt verschiedene DIGE-Methoden vor, von denen Wissenschaftler weltweit Gebrauch machen, bis hin zu neuartigen Methoden, und gibt einen Überblick über das, was sich in der DIGE-Welt am Horizont abzeichnet. Der Band schließt mit einem Überblick über das breite Spektrum der DIGE-Anwendungen von der klinischen Proteomik bis hin zu Anwendungen in der Tier-, Pflanzen- und mikrobiellen Proteomik. Die Kapitel sind im Format der erfolgreichen Reihe Methods in Molecular Biology™ geschrieben und enthalten Einführungen in die jeweiligen Themen, Listen der benötigten Materialien und Reagenzien, schrittweise, leicht reproduzierbare Laborprotokolle sowie Hinweise zur Fehlersuche und zur Vermeidung bekannter Fallstricke.

Authoritativ und zugänglich, Differential Gel Electrophoresis: Methods and Protocols kann sowohl von Anfängern mit etwas Hintergrundwissen in Biochemie oder Molekularbiologie als auch von Experten in der Proteomik genutzt werden, die ihr Verständnis von DIGE und deren Einsatz in vielen Bereichen und Anwendungsgebieten vertiefen möchten. Mit seinen vielen Protokollen, Anwendungen und methodischen Varianten ist es auch ein einzigartiges Nachschlagewerk für alle, die grundlegende Details über das Funktionsprinzip der DIGE und Ideen für mögliche zukünftige Anwendungen der DIGE in neuartigen analytischen Ansätzen suchen.

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