Publikationen
In einem frühen Werk, einem medizinischen Traktat über die Tugenden der Milch, Libellus de lacte et operibus lactariis (1545), findet sich ein Brief an einen Freund, in dem er die Berge als eines der größten Wunder der Natur preist. Dieser Hinweis und ein späterer Bericht über seine Besteigung des Pilatus (1555) stellen eine der ersten Aufzeichnungen über das Bergsteigen dar.
Im Jahr 1545 veröffentlichte Gesner seine Bibliotheca universalis, die erste Bibliographie ihrer Art, in der etwa 1.800 Autoren alphabetisch mit den Titeln ihrer Werke, Anmerkungen, Bewertungen und Kommentaren zu Art und Verdienst jedes Eintrags aufgeführt sind. Diesem monumentalen Nachschlagewerk folgte 1548 das enzyklopädische Werk Pandectarum sive Partitionum universalium Conradi Gesneri…libri xxi, in dem Gesner versuchte, das aufgezeichnete Wissen der Welt in 21 Rubriken zu erfassen. Die ersten 19 Bücher wurden 1548 veröffentlicht; das letzte, das dem theologischen Denken gewidmet war, erschien 1549, während das 20. Buch über die Medizin nie vollendet wurde.
Gesners nächste monumentale Leistung war ein Kompendium des aufgezeichneten Wissens über das Tierleben, die Historiae animalium, in der er versuchte, beobachtete Fakten von Mythen und populären Irrtümern zu unterscheiden. Der erste Band (1551), ein großzügig illustriertes Werk von 1.100 Folioseiten, befasste sich mit lebendgebärenden Vierbeinern (vierfüßige Tiere, die lebende Junge gebären). Spätere Bände über eierlegende Vierfüßer (Tiere, die ihre Jungen aus Eiern schlüpfen), Vögel, Fische und andere Wassertiere folgten 1554, 1555 und 1556; der teilweise fertiggestellte fünfte Band über Schlangen wurde 1587 posthum veröffentlicht.
Gesner hat nie eine ähnlich umfassende Übersicht über die Pflanzenwelt fertiggestellt, aber seine Notizen und etwa 1.500 Holzstiche von Pflanzen und ihren wichtigen Blüten und Samen wurden zwei Jahrhunderte nach seinem Tod von anderen Autoren verwendet. Obwohl er zu Lebzeiten vor allem für seine botanischen Werke bekannt war, veröffentlichte Gesner auch Mithridates: de differentis linguis (1555), eine Beschreibung von etwa 130 damals bekannten Sprachen, und eine Ausgabe (1556) der Werke des römischen Vielschreibers Claudius Aelian aus dem 3. Jahrhundert.