Det blev grundlagt i 1815 som Seneca Republican og blev omdøbt til The Ithaca Journal i 1823. Ifølge dens hjemmeside (se links nedenfor) blev den første daglige udgave af avisen udgivet i 1870, og dens kontorer har til huse i den samme bygning, som den har haft siden 1905.

The Journal blev købt af Frank E. Gannett i 1912 og blev dermed den anden lokale avis i det, der senere skulle blive til mediekonglomeratet Gannett Co, Inc. Den fusionerede med Daily News i 1919 og antog officielt navnet The Ithaca Journal-News, selv om den udgives under navnet The Ithaca Journal.

Af dens stjerner var Kenneth Van Sickle, den mangeårige sportsredaktør, som havde en populær klumme i årtier, der dækkede alt fra Cornell og Ithaca College til high schools og lokal fritidssport.

Avisen vandt i 1985, under ledende redaktør Joseph Junod, Best of Gannett for sportsdækning for sit ugentlige Softball-magasin. På det tidspunkt var The Journal også hjemsted for tre fotografer, hvis arbejde blev bemærket i hele Gannett og avisbranchen.

I maj 1996 skiftede The Journal til en morgentryk- og distributionsplan efter mange år som et eftermiddagsdagblad. Indtil da havde avisen, der blev drevet af studerende fra Cornell University, The Cornell Daily Sun, været den eneste morgenavis i byen.

Den 12. juni 2006 blev avisens trykkerier flyttet til Gannett Central New York Production Facility i Johnson City, New York, der ligger uden for Binghamton, New York. Dette nye anlæg huser også trykkerierne for Binghamton Press & Sun-Bulletin og Elmira Star-Gazette, begge dagblade, der er ejet af Gannett.

I forlængelse af denne flytning vil The Ithaca Journals eksisterende bygning blive renoveret for at omfatte udvidet kontorplads.

I slutningen af 2006 afskedigede The Ithaca Journal nogle af sine Ithaca-baserede medarbejdere inden for distribution, markedsføring og annoncering. Avisens oplags- og markedsføringsbehov forvaltes nu fra kontoret i Binghamton.

I juni 2020 var avisens lokale personale nede på kun en enkelt journalist: Matt Steecker. Dette har resulteret i dage uden nyheder fra Ithaca. I stedet bruger avisen indhold fra Gannetts ejendomme i Binghamton og Elmira til at fylde avisen og hjemmesiden.