Kolokalisering i mikroskopi henviser til forskellige dataanalysemetoder til at karakterisere graden af overlapning mellem to kanaler i et billede (konventionelt kaldet R- og G-kanaler, eller røde og grønne kanaler, uafhængigt af den bølgelængde, de faktisk har registreret). En typisk anvendelse i fluorescensmikroskopi er at studere tilstedeværelsen af to mærkede mål i det samme område af en celle.
For en tilgængelig introduktion se Kolokaliseringskoefficienter og Kolokaliseringsgrundlaget.
Husk, at sløring og støj påvirker kolokalisering.
Se Colocalization Analyzer og Colocalization Theory for flere detaljer.

Objektkolokalisering

Bemærk, at Object Analyzer i Huygens-softwaren også giver kolokaliseringsmålinger på objektniveau. Colocalization Analyzer arbejder mere på niveauet for hele billedet, på trods af at nogle lokale statistikker for de kolokaliserende regioner nemt kan hentes.
Både analysatorer arbejder i denne forstand på komplementære måder.

• Object Analyzer giver dig mulighed for at definere objekter (se Object Segmentation) og se, hvor meget de overlapper hinanden, i volumen eller intensitet. Objekter, der er defineret på denne måde, kan overlappe med andre objekter eller ej. Du kan filtrere objekter, der slet ikke kolokaliserer, fra.
• Colocalization Analyzer udforsker hele billedet for at søge efter kolokaliserende regioner baseret på de sædvanlige kolokaliseringskoefficienter. Disse regioner segmenteres derefter og behandles som objekter, der skal analyseres. Disse objekter er derfor altid skæringspladsvolumener.