Immunofænotyping er en teknik, der anvendes til at undersøge de proteiner, der udtrykkes af celler. Denne teknik anvendes almindeligvis i grundforskning og til laboratoriediagnostiske formål. Den kan udføres på vævsafsnit (frisk eller fikseret væv), cellesuspension osv. Et eksempel er påvisning af tumormarkører, som f.eks. ved diagnosticering af leukæmi. Det indebærer mærkning af hvide blodlegemer med antistoffer, der er rettet mod overfladeproteiner på deres membran. Ved at vælge passende antistoffer kan leukæmiske cellers differentiering bestemmes nøjagtigt. De mærkede celler behandles i et flowcytometer, et laserbaseret instrument, der er i stand til at analysere tusindvis af celler i sekundet. Hele proceduren kan udføres på celler fra blod, knoglemarv eller rygmarvsvæske i løbet af få timer.

Et eksempel på oplysninger, der leveres gennem immunofænotyping: “Den flowcytometriske immunofænotyping-rapport viste, at de maligne celler var positive for CD19, CD10, dimCD20, CD45, HLA-DR og λ immunoglobulin light chain. Der var ingen coekspression af CD5 eller CD23 i den monoklonale B-cellepopulation.”

Immunofænotyping er en meget almindelig flowcytometri-test, hvor fluorophore-konjugerede antistoffer anvendes som prober til farvning af målceller med høj aviditet og affinitet. Denne teknik gør det muligt at foretage en hurtig og nem fænotyping af hver enkelt cellelinje i en heterogen prøve i henhold til tilstedeværelsen eller fraværet af en proteinkombination. Dermed øges synligheden i komplekse prøver.