Excavata

Som Rhizaria er Excavata (figur 5(e)-5(j)) primært en samling af protozoer, men omfatter også en enkelt gruppe af sekundære alger. Den seneste fælles forfader af excavataer var en flagellat (sandsynligvis en fritlevende bakterieædende) med en karakteristisk bred fødesporingsspalte, og forskellige eksisterende fritlevende grupper har stadig denne grundlæggende celleform (Simpson, 2003; f.eks. figur 5(f)). Excavater er opdelt i to hovedundergrupper, Metamonada og Discoba (Hampl et al., 2009). Metamonader nedstammer fra en fælles forfader, der havde mistet evnen til at udføre aerob respiration og har derfor stærkt modificerede mitokondrier af forskellig art, der mangler mitokondrielt genom (Cavalier-Smith, 2003; Stairs et al., 2015). Mange metamonader er fritlevende og lever i iltfattige hav- eller ferskvandsmiljøer (f.eks. Kolisko et al., 2010; Figur 5(f)), men flere undergrupper er blevet specialiserede parasitter eller symbionter af dyr. Tarmparasitten Giardia og den urogenitale parasit Trichomonas vaginalis er meget udbredte menneskelige patogener (f.eks, Adam, 2001; Lehker og Alderete, 2000), men der er også en spektakulær mangfoldighed af symbiotiske metamonader i bagkødet på mange træædende termitter (Brugerolle og Lee, 2002a,b; figur 5(e)).

De fleste Discoba har aerobe mitokondrier med organellære genomer, faktisk er den lille flagellatgruppe Jakobida (f.eks, Reclinomonas og Andalucia) har mitokondrielle genomer, der bevarer flere unikke gener og flere bakterielignende træk, end nogen anden eukaryot (Burger et al., 2013; Lang et al., 1997). Discoba omfatter også Heterolobosea (Figur 5(g)), hvoraf mange har skiftevis amøbe- og flagellatfaser (den berygtede “hjerneædende amøbe” Naegleria fowleri er en heterolobosea; se Visvesvara, 2013). Den sidste store Discoba-gruppe, Euglenozoa, omfatter talrige protozoiske flagellater, som er rigelige overfladeassocierede bakterivorer og rovdyr af mikrobielle eukaryoter (f.eks. ‘bodonide’ kinetoplastider og phagotrofiske euglenider; Boenigk og Arndt, 2002; Larsen og Patterson, 1990; Figur 5(j)). Den omfatter også de parasitiske kinetoplastider, der forårsager sovesyge, Chagas’ sygdom og leishmaniasis hos mennesker (alle forårsaget af forskellige trypanosomatider; figur 5(h)), og flere vigtige sygdomme hos dyr og nogle få planter (Simpson et al., 2006; Vickerman, 2002). Euglenozoa er også det taksonomiske hjemsted for de fotosyntetiske euglenider, som er sekundære alger med en plastid af grønalgeoprindelse (se ovenfor; Figur 5(i)).