Fundado en 1815 como el Seneca Republican, pasó a llamarse The Ithaca Journal en 1823. Según su página web (ver enlaces más abajo), la primera edición diaria del periódico se publicó en 1870 y sus oficinas se encuentran en el mismo edificio que ocupa desde 1905.
El Journal fue adquirido por Frank E. Gannett en 1912, convirtiéndose así en el segundo periódico local de lo que más tarde se convertiría en el conglomerado de medios Gannett Co, Inc. Se fusionó con el Daily News en 1919 y adoptó oficialmente el nombre de The Ithaca Journal-News, aunque se publica con el nombre de The Ithaca Journal.
Entre sus estrellas se encontraba Kenneth Van Sickle, el editor de deportes de toda la vida que tuvo una popular columna durante décadas, en la que cubría todo tipo de temas, desde Cornell y el Ithaca College hasta las escuelas secundarias y los deportes recreativos locales.
El periódico, en 1985, bajo la dirección del editor jefe Joseph Junod, ganó el premio a lo mejor de Gannett en cobertura deportiva por su revista semanal Softball. En esa época, el Journal también contaba con tres fotógrafos, cuyo trabajo era conocido en todo Gannett y en la industria periodística.
En mayo de 1996, el Journal cambió a un horario de impresión y distribución matutino después de muchos años como diario vespertino. Hasta ese momento, el periódico dirigido por estudiantes de la Universidad de Cornell, The Cornell Daily Sun, había sido el único diario matutino de la ciudad.
El 12 de junio de 2006, las instalaciones de impresión del periódico se trasladaron a las instalaciones de producción de Gannett Central New York en Johnson City, Nueva York, situadas en las afueras de Binghamton, Nueva York. Esta nueva instalación también alberga las instalaciones de impresión del Binghamton Press & Sun-Bulletin y del Elmira Star-Gazette, ambos diarios propiedad de Gannett.
Después de este traslado, el edificio actual de The Ithaca Journal será renovado para incluir más espacio de oficinas.
A finales de 2006, The Ithaca Journal despidió a parte de su personal de circulación, marketing y publicidad de Ithaca. Las necesidades de circulación y marketing del periódico se gestionan ahora desde la oficina de Binghamton.
En junio de 2020, la plantilla local del periódico se reducía a un solo reportero: Matt Steecker. Esto ha dado lugar a días sin noticias de Ithaca. En su lugar, el periódico utiliza el contenido de las propiedades de Gannett en Binghamton y Elmira para llenar el papel y el sitio web.