La división Ginkgophyta consta de una única especie viva, el Ginkgo biloba. El Ginkgo, un árbol caducifolio resistente, se asemeja a una angiosperma en el sentido de que el tallo leñoso está frecuente e irregularmente ramificado y lleva hojas anchas, que tienen forma de abanico con venas ramificadas dicotómicamente. Aunque en la actualidad se cultiva ampliamente en todo el mundo, el Ginkgo es una especie en peligro de extinción, ya que sus poblaciones naturales se han reducido a una pequeña porción de las montañas del sureste de China.

Al igual que las cícadas, el Ginkgo es dioico y tiene microsporangios y megasporangios en árboles separados. Un microstrobilo de Ginkgo nace en un brote enano entre las hojas en forma de abanico. El eje microstrobilar lleva apéndices pedunculados en cuyos extremos hay dos microsporangios. Los megaesporangios nacen en tallos alargados y delgados, cada uno con un par de óvulos terminales. Por lo general, sólo un óvulo madura en una semilla.

Los tallos del Ginkgo son anatómicamente similares a los de las coníferas. El Ginkgo tiene dos tipos de ramas: las ramas principales alargadas y las ramas laterales enanas que llevan hojas. Al cabo de varios años, esos brotes enanos se convierten en brotes cortos y rechonchos del tallo.