Založen v roce 1815 jako Seneca Republican, v roce 1823 byl přejmenován na The Ithaca Journal. Podle jeho webových stránek (viz odkazy níže) vyšlo první denní vydání novin v roce 1870 a jeho kanceláře sídlí ve stejné budově, kterou obývají od roku 1905.
Deník v roce 1912 koupil Frank E. Gannett, čímž se stal druhými místními novinami pozdějšího mediálního konglomerátu Gannett Co, Inc. V roce 1919 se sloučil s deníkem Daily News a oficiálně přijal název The Ithaca Journal-News, ačkoli vychází pod názvem The Ithaca Journal.
Mezi jeho hvězdy patřil Kenneth Van Sickle, dlouholetý sportovní redaktor, který po desetiletí vedl populární rubriku, v níž se věnoval všemu od Cornellu a Ithaca College přes střední školy až po místní rekreační sporty.
Deník v roce 1985 pod vedením šéfredaktora Josepha Junoda získal cenu Best of Gannett za sportovní zpravodajství za svůj týdeník Softball. V té době v deníku působili také tři fotografové, jejichž práce si všiml celý Gannett i novinový průmysl.
V květnu 1996 přešel deník The Journal po mnoha letech jako odpolední deník na ranní tisk a distribuci. Do té doby byly jediným ranním deníkem ve městě noviny The Cornell Daily Sun, které vedli studenti Cornellovy univerzity.
Dne 12. června 2006 se tiskárna novin přestěhovala do výrobního závodu společnosti Gannett Central New York v Johnson City ve státě New York, který se nachází u města Binghamton ve státě New York. V tomto novém zařízení se nachází také tiskárna deníků Binghamton Press & Sun-Bulletin a Elmira Star-Gazette, které vlastní společnost Gannett.
Po tomto přestěhování bude stávající budova deníku The Ithaca Journal zrekonstruována a budou v ní rozšířeny kancelářské prostory.
Na konci roku 2006 deník The Ithaca Journal propustil část svých zaměstnanců, kteří se zabývají distribucí, marketingem a reklamou v Ithace. Náklad a marketingové potřeby novin jsou nyní řízeny z kanceláře v Binghamtonu.
V červnu 2020 se počet místních zaměstnanců novin snížil na jediného reportéra: Matta Steeckera. To mělo za následek dny bez zpráv z Ithacy. Místo toho noviny využívají k naplnění novin a webových stránek obsah z vlastních zdrojů společnosti Gannett v Binghamtonu a Elmiře.