• Invaginace je morfogenetický proces, při kterém se formuje embryo, a je počátečním krokem gastrulace, masivní reorganizace embrya z jednoduché kulovité koule buněk, blastuly, v mnohovrstevný organismus s diferencovanými zárodečnými vrstvami: endodermem, mezodermem a ektodermem. K lokalizovanějším invaginacím dochází také později v embryonálním vývoji,
• Vnitřní membrána mitochondrie se invaginuje a vytváří krysty, čímž poskytuje mnohem větší povrch pro umístění proteinových komplexů a dalších účastníků, kteří produkují adenosintrifosfát (ATP).
• K invaginaci dochází během endocytózy a exocytózy, kdy se v buňce vytvoří vezikula a membrána se kolem ní uzavře.
• Invaginace části střeva do jiné části se nazývá intususcepce.

AmphioxusEdit

Proces invaginace u Amphioxus

Invaginace u Amphioxus je první buněčný pohyb gastrulace. Tento proces poprvé popsal Conklin. Během gastrulace dojde k přeměně blastuly pomocí invaginace. Endoderm se složí směrem k vnitřní části a tím dojde k zániku blastocelu, který se přemění na strukturu ve tvaru pohárku s dvojitou stěnou. Vnitřní stěna se bude nazývat archenteron; primitivní střevo. Archenteron se otevře navenek blastoporem. Vnější stěna se stane ektodermem. Později se vytvoří epidermis a neurální hřeben.

TunicatesEdit

U tunicates je invaginace prvním mechanismem, který probíhá během gastrulace. Proces invaginace u tunikátů vyvolávají čtyři největší buňky endodermu. Invaginace spočívá ve vnitřních pohybech listu buněk (endodermu) na základě změn jejich tvaru. Blastuly tunikátů jsou ve vegetativním pólu poněkud zploštělé, což způsobuje změnu tvaru ze sloupcovitého na klínovitý. Jakmile byly buňky endodermu invaginovány, budou se dále pohybovat pod ektodermem. Později se vytvoří blastopor a tím je proces invaginace dokončen. Blastopor bude ze všech stran obklopen mezodermem

.