Joly opustil Vivendi v roce 2004 a stal se prezidentem a výkonným ředitelem společnosti CWT. V lednu 2008 byl Joly oznámen jako prezident a generální ředitel společnosti Carlson Companies, amerického soukromého mezinárodního konglomerátu v oblasti hotelnictví, cestovního ruchu a franšízových restaurací, který zaměstnává více než 175 000 lidí ve více než 160 zemích a teritoriích. Do funkce nastoupil v březnu 2008 jako náhrada za Marilyn Carlson Nelsonovou, dceru zakladatele Curta Carlsona. Pod jeho vedením společnost CWT zvýšila své roční tržby z 8,9 miliardy USD v roce 2003 na 25,5 miliardy USD v roce 2007.
Dne 17. srpna 2012 Joly odstoupil ze své pozice u společnosti Carlson a nastoupil na pozici generálního ředitele společnosti Best Buy. Pod Jolyho vedením a jeho transformací Renew Blue ve společnosti Best Buy se akcie společnosti v roce 2013 ztrojnásobily, přičemž důraz byl kladen na sázku na velké prodejny, vynikající služby zákazníkům, výběr produktů a služby, jako je Geek Squad. Podle deníku The New York Times je Jolyho hlavním cílem dorovnávání nejnižší ceny, přičemž je odhodlán zajistit, aby zákazník, který přišel do Best Buy jako do showroomu, neměl důvod nakupovat jinde. „Strategie je velmi jednoduchá,“ řekl deníku New York Times v roce 2012, krátce po svém nástupu do funkce. „Jsme přesvědčeni, že cenová konkurenceschopnost je sázkou do loterie. Způsob, jakým chceme zvítězit, se točí kolem poradenství, pohodlí a služeb.“
Dne 20. ledna 2017 se v brazilských novinách Valor Economico objevila zpráva, že se o Jolyho kandidatuře na post generálního ředitele společnosti Carrefour uvažuje. Joly k tomu vydal prohlášení: „Objevily se zprávy, že se o mně uvažuje jako o generálním řediteli v jiné společnosti. Chci, aby bylo jasné, že jsem plně odhodlán pokračovat v transformaci společnosti Best Buy a rozhodně nemám v plánu ji opustit.“
Joly odstoupil z funkce generálního ředitele společnosti Best Buy v červnu 2019 a stal se výkonným předsedou představenstva společnosti. V červnu 2020 Joly odstoupil z funkce výkonného předsedy představenstva a začal vyučovat na Harvard Business School jako senior lektor obchodní administrativy. Nadále zůstává poradcem generálního ředitele a představenstva společnosti Best Buy.
Joly je autorem připravované knihy The Heart of Business, která vyjde v nakladatelství Harvard Business Review Press 4. května 2021.
Joly je také členem představenstva společnosti Best Buy.