Excavata

Stejně jako Rhizaria jsou Excavata (obrázky 5(e)-5(j)) především souborem prvoků, ale zahrnují také jednu skupinu sekundárních řas. Nejnovějším společným předkem exkavátů byli bičíkovci (pravděpodobně volně žijící bakteriofilové) s charakteristickou širokou potravní rýhou a různé dosud žijící volně žijící skupiny mají stále tuto základní formu buňky (Simpson, 2003; např. obr. 5(f)). Exkaváty se dělí na dvě hlavní podskupiny, Metamonada a Discoba (Hampl et al., 2009). Metamonády pocházejí ze společného předka, který ztratil schopnost aerobního dýchání, a proto mají vysoce modifikované mitochondrie různého druhu, které postrádají mitochondriální genom (Cavalier-Smith, 2003; Stairs et al., 2015). Mnoho metamonád je volně žijících a obývá mořské nebo sladkovodní prostředí chudé na kyslík (např. Kolisko et al., 2010; obr. 5f), ale několik podskupin se stalo specializovanými parazity nebo symbionty živočichů. Střevní parazit Giardia a urogenitální parazit Trichomonas vaginalis jsou vysoce rozšířenými lidskými patogeny (např, Adam, 2001; Lehker a Alderete, 2000), nicméně v zadních střevech mnoha dřevožravých termitů existuje také velkolepá rozmanitost symbiotických metamonád (Brugerolle a Lee, 2002a,b; obr. 5(e)).

Většina Discoba má aerobní mitochondrie s organelárním genomem, ve skutečnosti malá skupina bičíkovců Jakobida (např, Reclinomonas a Andalucia) mají mitochondriální genomy, které si zachovávají více unikátních genů a více znaků podobných bakteriím než genomy jakýchkoli jiných eukaryot (Burger et al., 2013; Lang et al., 1997). Mezi diskoby patří také heterolobosea (obr. 5(g)), z nichž mnohé mají střídavě amébovou a bičíkatou fázi (nechvalně známá „mozkožravá améba“ Naegleria fowleri je heterolobosea; viz Visvesvara, 2013). Poslední velká skupina Discoba, Euglenozoa, zahrnuje četné prvoky bičíkovce, kteří jsou hojnými povrchovými bakterivoři a predátory mikrobiálních eukaryot (např. „bodonidní“ kinetoplastidy a fagotrofní euglenidy; Boenigk a Arndt, 2002; Larsen a Patterson, 1990; obr. 5(j)). Patří sem také parazitické kinetoplastidy, které způsobují spavou nemoc, Chagasovu chorobu a leishmaniózu u lidí (všechny způsobují různé trypanosomatidy; obrázek 5(h)), a několik významných onemocnění zvířat a několik rostlin (Simpson et al., 2006; Vickerman, 2002). Euglenozoa je také taxonomickým domovem pro fotosyntetické euglenidy, což jsou sekundární řasy s plastidem původu zelených řas (viz výše; obrázek 5(i)).