La calorimetría indirecta mide el consumo de O2 y la producción de CO2. Suponiendo que todo el oxígeno se utiliza para oxidar los combustibles degradables y todo el CO2, así evolucionado, se recupera, es posible calcular la cantidad total de energía producida. Debe quedar claro que la «producción de energía» significa la conversión de la energía química libre de los nutrientes en la energía química del ATP más la pérdida de algo de energía durante el proceso de oxidación.La calorimetría indirecta respiratoria, o calorimetría indirecta (CI) como la conocen la mayoría de los autores, es un método no invasivo y muy preciso de la tasa metabólica que tiene una tasa de error inferior al 1%. Tiene una alta reproducibilidad y se ha considerado un método de referencia. Este método permite estimar la BEE y la REE, y también permite identificar los sustratos energéticos que están siendo predominantemente metabolizados por el organismo en un momento determinado. Se basa en la medición indirecta del calor producido por la oxidación de los macronutrientes, que se estima mediante la monitorización del consumo de oxígeno (O2) y la producción de dióxido de carbono (CO2) durante un determinado periodo de tiempo. El calorímetro cuenta con un colector de gases que se adapta al sujeto y un sistema que mide el volumen y las concentraciones de O2 y CO2 minuto a minuto. A través de una válvula unidireccional, el calorímetro recoge y cuantifica el volumen y la concentración de O2 inspirado y CO2 expirado por el sujeto. Una vez alcanzado un volumen, se calcula el Gasto Energético en Reposo mediante la fórmula de Weir y los resultados se muestran en un software acoplado al sistema. Otra fórmula utilizada es:

M = V O 2 ( R Q – 0,7 0,3 e c + 1 – R Q 0,3 e f ) {\displaystyle M=VO_{2}left({\frac {RQ-0,7}{0,3}e_{c}+{\frac {1-RQ}{0,3}e_{f}right)}

donde RQ es el cociente respiratorio (relación entre el volumen de CO2 producido y el volumen de O2 consumido), e c {{displaystyle e_{c}}

es 21,13 kilojulios (5,05 kcal), el calor liberado por litro de oxígeno por la oxidación de los hidratos de carbono, y e f {\displaystyle e_{f}}

es 19,62 kilojulios (4,69 kcal), el valor de la grasa. Esto da el mismo resultado que la fórmula de Weir en RQ = 1 (quemar sólo carbohidratos), y casi el mismo valor en RQ = 0,7 (quemar sólo grasas).⊅∑′