Bildades 1815 som Seneca Republican och döptes om till The Ithaca Journal 1823. Enligt dess webbplats (se länkar nedan) publicerades den första dagliga utgåvan av tidningen 1870 och dess kontor ligger i samma byggnad som den har haft sedan 1905.
The Journal köptes av Frank E. Gannett 1912 och blev därmed den andra lokala tidningen i det som senare skulle bli mediekonglomeratet Gannett Co, Inc. Den slogs samman med Daily News 1919 och antog officiellt namnet The Ithaca Journal-News, även om den publiceras under namnet The Ithaca Journal.
En av tidningens stjärnor var Kenneth Van Sickle, den mångårige sportredaktören som hade en populär spalt i årtionden, och som täckte allt från Cornell och Ithaca College till gymnasieskolor och lokal fritidssport.
Tidningen vann 1985 under chefredaktör Joseph Junod Best of Gannett för sporttäckning för sin veckomagasin Softball. Vid den tiden hade The Journal också tre fotografer, vars arbete uppmärksammades inom hela Gannett och tidningsbranschen.
I maj 1996 övergick The Journal till att trycka och distribuera på morgonen efter många år som en eftermiddagstidning. Fram till dess hade tidningen som drevs av studenter vid Cornell University, The Cornell Daily Sun, varit den enda morgontidningen i staden.
Den 12 juni 2006 flyttades tidningens tryckeri till Gannett Central New York Production Facility i Johnson City, New York, som ligger utanför Binghamton, New York. I denna nya anläggning finns också tryckerierna för Binghamton Press & Sun-Bulletin och Elmira Star-Gazette, båda dagstidningar som ägs av Gannett.
Efter denna flytt kommer The Ithaca Journals befintliga byggnad att renoveras för att inkludera utökade kontorsutrymmen.
I slutet av 2006 avskrev The Ithaca Journal en del av den Ithaca-baserade personalen för utgivning, marknadsföring och annonsering. Tidningens upplagor och marknadsföringsbehov sköts nu från kontoret i Binghamton.
I juni 2020 var tidningens lokala personal reducerad till en enda reporter: Matt Steecker. Detta har resulterat i dagar utan nyheter från Ithaca. I stället använder tidningen innehåll från Gannetts fastigheter i Binghamton och Elmira för att fylla tidningen och webbplatsen.