Science Volume Imaging

Kolokalisering inom mikroskopi hänvisar till olika dataanalysmetoder för att karakterisera graden av överlappning mellan två kanaler i en bild (konventionellt kallade R- och G-kanaler, eller röda och gröna kanaler, oberoende av vilken våglängd de faktiskt har registrerat). En typisk tillämpning inom fluorescensmikroskopi är att studera närvaron av två märkta mål i samma region av en cell.
För en lättillgänglig introduktion se Colocalization Coefficients och Colocalization Basics.
Mind that Blur And Noise affect Colocalization.
Se Colocalization Analyzer och Colocalization Theory för mer information.

Objektkolokalisering

Visa att Object Analyzer i Huygens-programvaran också ger kolokaliseringsmätningar på objektsnivå. Colocalization Analyzer arbetar mer på nivån för hela bilden, trots att viss lokal statistik för de kolokaliserande regionerna lätt kan hämtas.
Båda analysatorerna arbetar, i denna mening, på kompletterande sätt.

  • Med Object Analyzer kan du definiera objekt (se Object Segmentation) och se hur mycket de överlappar varandra, i volym eller intensitet. Objekt som definieras på detta sätt kan överlappa med andra objekt, eller inte. Du kan filtrera bort objekt som inte kolokaliserar alls.
  • Colocalization Analyzer utforskar hela bilden för att söka efter kolokaliserande regioner baserat på de vanliga kolokaliseringskoefficienterna. Dessa regioner segmenteras sedan och behandlas som objekt att analysera. Dessa objekt är därför alltid volymer av skärningspunkter.

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.