En huaca kunde byggas längs en processionell ceremoniell linje eller rutt, vilket gjordes för att genomföra heliga ritualer i huvudstaden Cusco. Sådana linjer kallades ceques. Tom Zuidema och Brian Bauer (UT-Austin) utforskar den omfattande debatten om deras användning och betydelse.

Dessa linjer anlades för att uttrycka kulturens kosmologi och var ibland astronomiskt anpassade till olika stjärnors upp- och nedgångar. Dessa gällde säsongsceremonier och tidsbestämning (för jordbruk, ceremonier och registrering). Dessa ceque-linjer har stora likheter med processionslinjerna hos mayaerna (sacbe), chakoanerna och muiscaerna (Suna).

Speciella anläggningar uppfördes vid vissa huacas där prästerna komponerade utarbetade ritualer och religiös ceremoniell kultur. Till exempel utfördes solceremonin i Cusco (Inti Raymi). Inkaerna utarbetade kreativt ett redan befintligt system för religiös vördnad av de folk som de tog in i sitt rike. Detta utbyte säkerställde att de erövrade folken följde reglerna på ett korrekt sätt. Inkaerna transplanterade och koloniserade också hela grupper av personer med inka-bakgrund med nytillkomna folk för att ordna en bättre fördelning av inka-personer i hela sitt imperium för att undvika utbrett motstånd. I detta fall blev huacas och pacarinas viktiga centra för gemensam tillbedjan och en punkt för förening av etniskt och språkligt olika folk. De bidrog till att skapa enhet och ett gemensamt medborgarskap för ofta geografiskt skilda folk. Sedan förinkatiden utvecklade folket ett system för pilgrimsfärder till dessa olika helgedomar, innan katolicismen introducerades.