Flensburg, danska Flensborg, stad i Schleswig-Holstein, Tyskland. Hamnstaden ligger vid Flensburgfjorden och är Tysklands nordligaste storstad. Den nämns första gången 1240, fick stadskarta 1284 och plundrades ofta av svenskarna efter 1643. Den blev huvudstad i Schleswig under danskt styre 1848 och ockuperades av Preussen efter det tysk-danska kriget 1864. Vid folkomröstningen 1920 röstade Flensburg för att stanna kvar i Tyskland. Före andra världskriget fanns här en flottstation och en akademi, och staden blev återigen en flottbas efter inrättandet av Västtyskland.

Staden är kulturellt och kommersiellt centrum i norra Schleswig-Holstein och har ett antal administrativa roller på delstats- och förbundsnivå. Dess industrier omfattar bland annat varvsindustri, metallbearbetning, pappersbruk samt tillverkning av maskiner och rom. Många danska företag har kontor i staden. Flensburgs anmärkningsvärda landmärken är bland annat de medeltida kyrkorna Sankt Nikolaus och Sankt Maria (1284), den stora Nordertor (port; 1595), stadsmuseet, Nordermarkt (Nordermarknad; 1595) och konserthuset German House. Staden är säte för universitetet i Flensburg (grundat 1946) och för en teknisk högskola. Den intilliggande Östersjöorten Glücksburg har ett berömt slott (1582-87) som var säte för hertighuset Schleswig-Holstein-Sonderburg-Glücksburg och var förknippat med kungafamiljerna i Danmark, Storbritannien, Norge och Grekland. Den tyska regeringen under amiral Karl Dönitz kapitulerade där till de allierade i maj 1945. Pop. (2003 est.) 85 300.