Excavata

Likt Rhizaria är Excavata (figurerna 5(e)-5(j)) i första hand en samling protozoer, men innehåller också en enda grupp sekundära alger. Den senaste gemensamma förfadern till excavata var en flagellat (troligen en fritt levande bakterivor) med ett karakteristiskt brett matningsfåra, och olika existerande fritt levande grupper har fortfarande denna grundläggande cellform (Simpson, 2003; t.ex. figur 5(f)). Excavater delas in i två huvudsakliga undergrupper, Metamonada och Discoba (Hampl et al., 2009). Metamonader härstammar från en gemensam förfader som hade förlorat förmågan att utföra aerob andning, och har följaktligen starkt modifierade mitokondrier av olika slag som saknar mitokondriegenom (Cavalier-Smith, 2003; Stairs et al., 2015). Många metamonader är fritt levande och lever i syrefattiga marina eller sötvattensmiljöer (t.ex. Kolisko et al., 2010; figur 5(f)), men flera undergrupper har blivit specialiserade parasiter eller symbionter av djur. Tarmparasiten Giardia och den urogenitala parasiten Trichomonas vaginalis är mycket utbredda humanpatogener (t.ex, Adam, 2001; Lehker och Alderete, 2000), men det finns också en spektakulär mångfald av symbiotiska metamonader i bakre delen av många träätande termiter (Brugerolle och Lee, 2002a,b; figur 5(e)).

De flesta Discoba har aeroba mitokondrier med organellära genomer, i själva verket har den lilla flagellatgruppen Jakobida (t.ex, Reclinomonas och Andalucia) har mitokondriella genomer som behåller fler unika gener, och mer bakterieliknande drag, än någon annan eukaryot (Burger et al., 2013; Lang et al., 1997). Discoba omfattar även Heterolobosea (figur 5(g)), varav många har alternerande amöba- och flagellatfaser (den ökända ”hjärnätande amöba” Naegleria fowleri är en heterolobosea; se Visvesvara, 2013). Den sista stora Discoba-gruppen, Euglenozoa, omfattar många protozoiska flagellater som är rikligt förekommande ytassocierade bakterivorer och predatorer av mikrobiella eukaryoter (t.ex. ”bodonida” kinetoplastider och phagotrofa euglenider; Boenigk och Arndt, 2002; Larsen och Patterson, 1990; figur 5(j)). Den omfattar också de parasitiska kinetoplastider som orsakar sömnsjuka, Chagas sjukdom och leishmaniasis hos människor (alla orsakade av olika trypanosomatider; figur 5(h)), och flera viktiga sjukdomar hos djur och ett fåtal växter (Simpson et al., 2006; Vickerman, 2002). Euglenozoa är också det taxonomiska hemmet för de fotosyntetiska eugleniderna, som är sekundära alger med en plastid av grönalgsursprung (se ovan; figur 5(i)).