Skilda händelser börjar äga rum, till exempel när Spider-Man (Marvel-karaktär) dyker upp i Gotham City tillsammans med Jokern (DC-karaktär).Medan de två bröderna, som förkroppsligar Marvels multiversum och DC:s multiversum, befinner sig på det astrala planet blir de medvetna om att de inte är ensamma i universum: bröderna upptäcker varandras existens.

Superhjältar och skurkar, antihjältar, civila eller poliser drabbas i sina respektive multiverser av märkliga gula lampor som transporterar dem. Medan vissa kämpar och undrar vad som händer, använder andra, som Doctor Strange (Marvel) och andra mystiker, sin magi för att hitta svaret. I Batcave är Bullseye (Marvel) förvirrad och hotar Batman (DC) att döda Robin (DC) om han inte berättar vad som pågår. Robin bryter sig loss och Batman slår ut Bullseye, men ett gult ljus förflyttar Robin till X-Mansion, hem för X-Men (Marvel).

Hulk (Marvel) som Master Hulk (den mäktigaste av hans personligheter, eftersom han är en sammansmältning av Bruce Banners sinne och Hulks fysik), är tillsammans med Betty Ross, när han plötsligt försvinner utan förvarning. På Daily Planet har Clark Kent (DC) nu två chefer: Perry White (DC) och Jonah Jameson (Marvel). Han har också en ny fotografisk sidekick: Peter Parker (som egentligen är Ben Reilly som använder namnet på den riktiga Spider-Man, eftersom han nu befinner sig i DC:s multiversum är det ingen som känner honom).

En karaktär letar efter X-Factors gömställe, men hittar i stället en butik med Looney Tunes-tema. Axel Asher hittar en misstänksam hemlös man i en gränd med en glödande låda som försöker täcka den med tejp, och han förklarar att det är en av de återstående bitarna från när Big Bang uppstod, som förutom att skapa ett solsystem, skapade en mängd olika universum och parallella jordar (som Marvels Earth 616 och DC:s Earth 0).

Nu när bröderna vet om varandras existens kommer de inte att sluta. De avslöjar för alla i båda universumen att de en gång var förenade, men att de kämpade mot varandra och förstörde varandra, att de återuppbyggde varandra separat, men att de gradvis skapade sina egna olikheter och glömde när de kände varandra, men att de båda var trötta på varandras existens och bestämde sig för att förstöra varandra. Med råd från de kosmiska entiteterna The Spectre (DC) och The Living Tribunal (Marvel) utmanar de varandra i en duell med flera strider, var och en med hjälp av karaktärer eller mästare från sitt eget huvuduniversum (Earth 616 och Earth 0). Förloraren försvinner.

Det finns elva strider mellan huvudhjältarna:

Thor (Marvel) vs Shazam (DC)

De teleporteras och får veta att de ska slåss, men bestämmer sig först för att be till sina respektive fäder och gudar. Medan de slåss tror Thor och Shazam att de kan lära bröderna att komma överens. När Thor lämnar Shazam i spillrorna säger han Shazam och vänder sig till sitt alter ego, en pojke vid namn Billy Batson. Thor märker att Shazam också använder åskans kraft och när han bryter sig loss säger han Shazam igen. Thor använder sin hammare och kontrollerar blixten, men när han rör vid hammaren ger blixten honom en bieffekt och han teleporteras till New York, där Wonder Woman hittar hammaren, plockar upp den och får Thors krafter, medan Thor redan har vunnit.

Namor (Marvel) vs. Aquaman (DC)

Vattenherrarna slåss, men i vattnet är de väldigt jämna, så Namor slår Aquaman på ytan (eftersom Namor kan flyga), men Aquaman kontaktar en val för att hoppa nära stranden och krossar Namor, vilket gör att Aquaman vinner.

Quicksilver (Marvel) vs. Flash (DC)

De två slåss i supersnabb hastighet och slår vad om vem som är snabbast; en lastbilschaufför distraheras av dem och Flash räddar honom, tillsammans med fordonet och andra passagerare, men Quicksilver överraskar Flash med ett slag och gör honom svag. Men när Quicksilver inte är på sin vakt, förbättrar Flash sin attack och ger honom ett slag som besegrar honom och gör honom till vinnare. På Daily Planet har Kingpin tagit över byggnaden, medan Lois Lane blir kär i Peter Parker.

Jubilee (Marvel) vs Robin (DC)

Jubilee från X-Men ska slåss mot Robin, vilket är svårt eftersom hon har varit kär i honom sedan han dök upp i X-Mansion. Medan Júbilo skriver deras kärlekshistoria i sin dagbok säger Robin att det är dags, de håller varandra i handen och teleporterar sig.

Robin lovar att inte skada Júbilo. Hon kastar krafter mot honom, medan Robin lurar henne genom att gömma sig och lämna sin kappa bakom sig. Hon tror att hon ser honom och skjuter honom, men misslyckas med att vinna, eftersom den skicklige unge mannen immobiliserar henne med ett lasso av koppar och vinner matchen.

Silver Surfer (Marvel) vs. Green Lantern (DC)

I den djupa rymden vill varken Green Lantern eller Silver Surfer slåss, men de vet att deras kamp är nödvändig, vilket avslöjar att Surfer och Lantern samarbetade före kampen och efter karaktärsbytet. Lantern och Surfer möts, men när deras krafter kolliderar vinner Silver Surfer, även om han ångrar segern.

Elektra (Marvel) vs Catwoman (DC)

Catwoman är förvirrad, eftersom hon inte kan förklara varför hon valdes till mästare i sitt universum, om hon är en antihjältinna och inte en hjältinna. Catwoman kliar Elektra och trasslar in hennes arm med sin piska, men Elektra drar tillbaka henne med den och ser till att inte döda henne. Catwoman kastar sin piska för att gå upp, men Elektra skär av den och Catwoman faller medvetslös, Elektra vinner.

I Metropolis friar Peter till Lois på en dejt, men hon avslöjar för honom att hon redan är förlovad med Clark. Peter, som är generad, bestämmer sig för att gå till mörkrummet för att framkalla foton. Han är mycket orolig, eftersom Marvel Multiverse är beroende av om Spider-Man vinner eller förlorar, när hans arkansinne aktiveras och han teleporteras. Jonah dyker upp med Clark och Lois och berättar att Hulken slåss mot Metallo.

I gränden är Asher skräckslagen när den mystiske luffaren avslöjar för honom att gränden är den enda punkt som de två multiverserna har gemensamt i båda verkligheterna och att Asher och han är ett par fragment av Marvel och DC, men att Asher bor i Marvel. Vandraren rör vid honom och ger honom kraften inom sig (färgade Marvel rött och DC blått, färgerna på deras respektive logotyper), eftersom Asher är nästa efterträdare som ska skilja bröderna åt, Access är Access. Axel har, till skillnad från alla sina föregångare, den mest avgörande positionen.

Wolverine (Marvel) vs. Lobo (DC)

På en avlägsen planet driver Lobo in en av sina krokar i Wolverines hjärta (mellan hans adamantiumribbor), men förväntar sig inte att Wolverine ska regenerera. Båda slåss, men Wolverine föredrar att skära upp och Lobo att krossa. Men Wolverine hugger Lobo och Lobo kan inte längre slåss medan den andra vinner och börjar röka.

Storm (Marvel) vs Wonder Woman (DC)

I början av matchen kastar Wonder Woman (Wonder Woman) bort Thors hammare, eftersom hon anser att det inte skulle vara rättvist och föredrar att slåss med de attribut hon fick i sitt multiversum. Wonder Woman sparkar Storm när de slåss, men Storm ger henne två elchocker och vinner.

Spider-Man (Marvel) vs. Superboy (DC)

Ben börjar med att slå av Superboys glasögon, vilket ökar hans raseri. Ben gömmer sig sedan bakom en vattencistern, men Superboy använder sin taktila telekinesi för att flytta honom. Under slagsmålet frågar Ben honom vilket blodsband Superboy har med Stålmannen och Superboy säger att han är en yngre klon, vilket gör Ben upprörd och förstår att anledningen till att bröderna satte honom att slåss mot honom var att de båda är kloner, så om den riktiga Peter hade valts skulle Peter ha mött Stålmannen. Superboy försöker ta tag i honom, men Ben svarar med en spark; Superboy är under vatten och trots att Bens arkansinne slår till träffar Superboy honom.

Svagt, Ben ser en strömbrytare när Superboy går efter honom, när Ben kommer på ett nytt trick: han hoppar upp och fyller Superboys ögon med nät och Superboy faller in i strömbrytaren och får en elchock och förlorar matchen, vilket gör att ställningen blir 6-3.

Hulken (Marvel) vs Superman (DC)

Superman anländer med sin superhastighet mot Hulken, som har besegrat Metallo. Hulken inser att de ännu inte har teleporterats och bestämmer sig för att de måste slåss. I slagsmålet får de båda ett slag och blir hårt träffade för första gången i sina liv. Stålmannen vill egentligen inte slåss, men när han inser sin fästmös situation slår han Hulken med all sin kraft och slår honom medvetslös och Stålmannen vinner med 6-4.

Captain America (Marvel) vs. Batman (DC)

Båda karaktärerna teleporteras in i kloakerna och slåss med sköldar och batarangs, men i närkampen kastar Captain America Batman in i ett avloppsrör som spricker, vilket leder till att stället översvämmas. Batman tar på sig en syretank och eftersom Captain America inte har någon sådan slås han medvetslös och Batman räddar honom och vinner med 6-5. Fem av matcherna avgjordes genom publikens röster. Marvel fick fler röster än DC, så Marvel vann, även om historien inte visar någon vinnare.

Trots Marvels triumf (och trots de kontroversiella segrarna för Wolverine, Storm och Spider-Man över Lobo, Wonder Woman respektive Superboy) var inget universum villigt att försvinna. För att förhindra total förstörelse skapade Spectre och Living Tribunal ett universum som kallades Amalgam Line, skilt från de andra, där endast Axel Asher (senare känd som Access) och Dr. Strangefate kände till sanningen. Till slut återställde Access verkligheten.

Axel letar som en galning efter vad han ska göra med sina krafter när han ser Batman dyka upp ur kloakerna med Captain America som försöker få honom att reagera med framgång. Asher har en plan, men misslyckas i praktiken, eftersom bröderna löser tvisten genom att röra vid Batman och Captain och placera dem i det motsatta multiversumet genom att skapa det nya Amalgamuniversumet, där de ”kombinerade” versionerna av olika hjältar skulle finnas, t.ex. Dark Claw, som är en förening av Batman och Wolverine.

När Dr Strangefate (en sammansmältning av Charles Xavier, Doctor Strange och Doctor Fate, som kände till sanningen om sin värld) överlever vänder han sig mot Asher eftersom han vill lämna sin värld. Access letar efter de nycklar som Super-Soldier och Dark Claw har deponerat när de passerar genom gränden för att återställa universum. Slutligen, genom att röra vid de sammanslagna superhjältarna, återställer han båda universumen samtidigt som Batman och Captain America, vilket gör att ingen kommer ihåg Amalgamuniversumet.

I en grotta slåss Hulken mot mullvadsmännen och de avslöjar ett desintegreringsvapen, men Stålmannen dyker upp och hjälper honom och lyckas vinna. På Daily Planet hotar Kingpin fortfarande att köpa den när Spider-Man och Superboy stoppar honom. I New York söker Thanos upp Darkseid för att avsluta kampen när Lobo och Wolverine bekämpar honom, liksom Flash och Quicksilver mot Venom.

The Spectre och The Living Tribunal är glada över att bröderna har skilts åt, när det plötsligt börjar skaka i båda universumen. Axel, Batman och Cap försöker skydda människorna, men Axel resonerar och säger att det är förgäves, eftersom de kommer att dö i slutändan eftersom bröderna slåss. Wolverine och Lobos kamp ökar när de möter Quicksilver, Flash, Shazam och Thor; Thanos lämnar Venom svag och alla går emot honom, men Thor är förbryllad av Wonder Woman och hennes förmåga att lyfta sin hammare. På Daily Planet ser Superboy och Spider-Man hur himlen börjar blöda och inser att även om de kommer ut är det slutet för deras världar, så Jameson ber Spider-Man om ursäkt. Alla hjältar slutar med sin verksamhet och inser att deras strider är meningslösa och världarna börjar falla sönder. Medan alla ser det som det värsta, ser Thanos det som vackert.

Captain America och Batman sätter ihop en plan för att stoppa honom och Access tar dem ut i kosmos, där de bokstavligen ser Marvel och DC slåss med svärd (vilket förklarar den blödande himlen). Cap och Batman föreslår att de ska åka tillbaka och ta med sig en armé, men Access berättar för dem att deras världar håller på att dö och att det är för svårt att teleportera längre. Batman och Cap talar till sina respektive universum, men universumen hör dem inte, när DC och Marvel slår ihop sina svärd och ger dem de motsatta karaktärerna.

Axel är förbryllad, men när allt verkade förlorat ser Marvel en pojke som levde och växte upp i skuggorna, växa sig starkare och starkare med sina svagheter och skydda andra. DC ser en pojke med hopp som lyckas donera sin kropp till vetenskapen och slåss för det goda och blir en inspirerande ikon för många. Plötsligt stannar allting upp, bröderna slutar slåss, tar kaptenen och Batman inom sig och för första gången skakar de hand och säger: ”Ni har gjort bra ifrån er.”

Allting är återställt och de återvänder till sina världar. Även om många söker sanningen är det bara Access som vet. När sprickorna sluter sig lovar Júbilo Robin att aldrig glömma. Wonder Woman och Thor söker efter svar, men varken amazonerna eller Oden vet vad som händer, medan andra som Spider-Man och Superman resonerar och inser att världarna har det bättre. Access lovar att bli förmyndare mellan syskonen så att detta inte ska hända igen.