Andres Bonifacio föddes i Tondo, Manila, den 30 november 1863. Han växte upp i slummen och kände av praktisk erfarenhet till de faktiska förhållandena för klasskampen i sitt samhälle. Han blev tidigt föräldralös och avbröt sin grundskoleutbildning för att försörja sig som hantverkare och sedan som kontorist, budbärare och agent för utländska handelsföretag i Manila. Bonifacio tog till sig den klassiska rationalismens läror genom José Rizals verk, Victor Hugos Les Miserables, Eugène Sues Den vandrande juden, böcker om den franska revolutionen och de amerikanska presidenternas liv, och fick på så sätt en förståelse för dynamiken i den sociohistoriska processen. Detta ledde till att han anslöt sig till Liga Filipina, som Rizal organiserade 1892 i syfte att ena och intensifiera den nationalistiska rörelsen för reformer.

När Liga upplöstes i samband med att Rizal arresterades och förvisades bildade Bonifacio 1892 Katipunan och utgjorde på så sätt en samlingspunkt för folkets agitation för frihet, oberoende och jämlikhet. Katipunan utformade sina initiationsritualer efter frimureriet, men dess ideologiska principer härstammade från franska revolutionen och kan bedömas som radikala i sin materialistiskt-historiska inriktning. Katipunan upphöjde arbetet som källan till allt värde. Den riktade uppmärksamheten mot kolonialsystemets orättvisa klasstruktur, den ökade exploateringen av ursprungsbefolkningen och följaktligen behovet av att bejaka de arbetande massornas kollektiva styrka för att förstöra det orättfärdiga systemet.

När sällskapet upptäcktes den 19 augusti 1896 hade det omkring 10 000 medlemmar. Den 23 augusti samlades Bonifacio och hans anhängare i Balintawak och kom överens om att inleda den väpnade kampen. Två dagar senare ägde den första skärmytslingen rum och ett skräckvälde från spanjorerna följde snart.

Konflikten delade upp rebellerna i de två grupperna Magdiwang och Magdalo i Cavite på Luzon. Bonifacio bjöds in för att medla, men blev avvisad av den klanistiska medelklassen i Cavite. General Emilio Aguinaldo, den provisoriska revolutionära regeringens valda president, bedömde Bonifacios planer som splittrande och skadliga för enigheten och beordrade att Bonifacio och hans bröder skulle arresteras, ställas inför rätta och avrättas för ”förräderi och uppvigling”. Den 10 maj 1897 avrättades Bonifacio.

I motsats till den allmänna uppfattningen kan orsaken till Bonifacios tragiska död i händerna på andra filippinska rebeller inte enbart tillskrivas hans personliga stolthet. Snarare ledde korrelationen mellan klasskrafterna och den äventyrliga tendensen hos Bonifacios grupp till hans isolering och därefter till Aguinaldos kompromisser med de amerikanska militära inkräktarna.