Joly a părăsit Vivendi în 2004 pentru a deveni președinte și director general al CWT. În ianuarie 2008, Joly a fost anunțat președinte și director general al Carlson Companies, un conglomerat internațional american cu capital privat din industria hotelieră, a călătoriilor și a francizelor de restaurante, care are peste 175.000 de angajați în peste 160 de țări și teritorii. El a preluat această funcție în martie 2008, ca înlocuitor al lui Marilyn Carlson Nelson, fiica fondatorului Curt Carlson. Sub conducerea sa, CWT și-a crescut vânzările anuale de la 8,9 miliarde de dolari în 2003 la 25,5 miliarde de dolari în 2007.

La 17 august 2012, Joly a demisionat din poziția sa la Carlson pentru a prelua funcția de CEO la Best Buy. Sub conducerea lui Joly și a transformării sale Renew Blue la Best Buy, acțiunile companiei s-au triplat în 2013, accentul fiind pus pe miza pe magazinele de tip big box, pe servicii superioare pentru clienți, pe selecția produselor și pe servicii precum Geek Squad. Potrivit The New York Times, obiectivul principal al lui Joly este egalarea celui mai mic preț, hotărât să se asigure că un client care a venit la Best Buy ca showroom nu are niciun motiv să cumpere din altă parte. „Strategia este foarte simplă”, a declarat el pentru New York Times în 2012, la scurt timp după ce a preluat postul. „Credem că competitivitatea prețurilor este o miză de masă. Modul în care vrem să câștigăm este în jurul sfaturilor, al confortului, al serviciilor.”

La 20 ianuarie 2017, un raport din ziarul brazilian Valor Economico a afirmat că Joly era luat în considerare pentru postul de CEO la Carrefour. Joly a emis o declarație: „Au existat informații potrivit cărora sunt luat în considerare pentru un rol de CEO la o altă companie. Permiteți-mi să fiu clar, sunt pe deplin angajat în transformarea continuă a Best Buy și nu am absolut niciun plan de plecare.”

Joly a demisionat din funcția de CEO al Best Buy în iunie 2019 pentru a deveni președinte executiv al companiei. În iunie 2020, Joly a renunțat la funcția de președinte executiv și a început să predea la Harvard Business School în calitate de profesor senior de administrare a afacerilor. El rămâne consilier al directorului general și al Consiliului de administrație al Best Buy.

Joly este autorul cărții în curs de apariție, The Heart of Business, care va fi publicată de Harvard Business Review Press la 4 mai 2021.

.