Excavata

Ca și Rhizaria, Excavata (figurile 5(e)-5(j)) sunt în principal o colecție de protozoare, dar includ și un singur grup de alge secundare. Cel mai recent strămoș comun al excavatelor a fost un flagelat (probabil un bacterivor cu viață liberă) cu un șanț de hrănire larg caracteristic, iar diverse grupuri cu viață liberă existente au încă această formă celulară de bază [Simpson, 2003; de exemplu, figura 5(f)]. Excavatele sunt împărțite în două subgrupe principale, Metamonada și Discoba (Hampl et al., 2009). Metamonadele descind dintr-un strămoș comun care și-a pierdut capacitatea de a efectua respirația aerobă și, în consecință, au mitocondrii foarte modificate de diferite tipuri, care nu au genom mitocondrial (Cavalier-Smith, 2003; Stairs et al., 2015). Multe metamonade au viață liberă și locuiesc în medii marine sau de apă dulce sărace în oxigen (de exemplu, Kolisko et al., 2010; Figura 5(f)), dar mai multe subgrupuri au devenit paraziți specialiști sau simbioți ai animalelor. Parazitul intestinal Giardia și parazitul urogenital Trichomonas vaginalis sunt agenți patogeni umani foarte răspândiți (de ex, Adam, 2001; Lehker și Alderete, 2000), cu toate acestea, există, de asemenea, o diversitate spectaculoasă de metamonade simbiotice în intestinele posterioare ale multor termite care se hrănesc cu lemn (Brugerolle și Lee, 2002a,b; Figura 5(e)).

Majoritatea Discoba au mitocondrii aerobe cu genomuri organelare, de fapt, micul grup de flagelate Jakobida (de ex, Reclinomonas și Andalucia) au genomuri mitocondriale care păstrează mai multe gene unice și mai multe caracteristici asemănătoare cu cele bacteriene decât cele ale oricăror alte eucariote (Burger et al., 2013; Lang et al., 1997). Discoba include, de asemenea, Heterolobosea (Figura 5(g)), multe dintre acestea având faze alternative de amibă și de flagelat (faimoasa „amibă mâncătoare de creier” Naegleria fowleri este o heteroloboză; a se vedea Visvesvara, 2013). Ultimul grup major de Discoba, Euglenozoa, include numeroase protozoare flagelate care sunt abundente bacterivore și prădători de eucariote microbiene asociate la suprafață (de exemplu, kinetoplastidele „bodonide” și euglenidele fagotrofe; Boenigk și Arndt, 2002; Larsen și Patterson, 1990; Figura 5(j)). Aceasta include, de asemenea, kinetoplastidele parazite care provoacă boala somnului, boala Chagas și leishmanioza la om (toate cauzate de diferite trypanosomatide; figura 5(h)), precum și mai multe boli importante ale animalelor și câteva plante (Simpson et al., 2006; Vickerman, 2002). Euglenozoa este, de asemenea, casa taxonomică pentru euglenidele fotosintetice, care sunt alge secundare cu un plastid de origine algală verde [a se vedea mai sus; Figura 5(i)].

.