Dois diferentes métodos de extração para extração de sorgo (Sorghum bicolor L. Moench.) foram comparadas proteínas de armazenamento para análise de eletroforese capilar de zona livre (FZCE). Um solvente tradicional à base de 60% t-butanol foi comparado com um tampão borato de pH 10 contendo o detergente aniônico SDS seguido pela precipitação de não kafirinas utilizando 60% t-butanol. A análise FZCE dos dois tipos de extratos mostrou padrões idênticos, apesar do fato de que a SDS deveria ter dado a todas as proteínas a mesma relação carga/massa. Esta metodologia também foi aplicada com sucesso às proteínas do milho. Pensa-se que o uso do t-butanol para precipitar as não kafirinas, combinado com a electroforese a pH baixo, removeu a SDS das proteínas armazenadas. O procedimento de extração da SDS produziu extratos mais estáveis para análise de FZCE. Estes extratos também poderiam ser utilizados diretamente para a separação da eletroforese capilar da SDS (SDS-CE). As Kafirinas de 15 genótipos foram extraídas com este procedimento e analisadas por FZCE e SDS-CE. A resolução das kafirinas por FZCE foi muito superior à SDS-CE, demonstrando que as proteínas kafirinas possuíam um alto nível de variabilidade de densidade de carga dentro de uma distribuição de tamanho molecular relativamente pequena. Dois grupos distintos de α-kafirins puderam ser vistos nos eletroferogramas da FZCE.