Publicações
Em um trabalho inicial, um tratado médico sobre as virtudes do leite, Libellus de lacte et operibus lactariis (1545), ele incluiu uma carta a um amigo na qual ele elogiou as montanhas como uma das maiores maravilhas da natureza. Esta referência e um relato posterior de sua escalada do Monte Pilatos (1555) fornecem um dos primeiros registros de escalada de montanha.
Em 1545 Gesner publicou sua Bibliotheca universalis, a primeira bibliografia do gênero, listando cerca de 1.800 autores em ordem alfabética com os títulos de suas obras, anotações, avaliações e comentários sobre a natureza e o mérito de cada entrada. Esta monumental referência foi seguida em 1548 pela obra enciclopédica Pandectarum sive Partitionum universalium Conradi Gesneri…libri xxi, na qual Gesner tentou pesquisar o conhecimento registrado do mundo sob 21 títulos. Os primeiros 19 livros foram publicados em 1548; o último, dedicado ao pensamento teológico, foi publicado em 1549, enquanto o 20º, sobre medicina, nunca foi completado.
A próxima realização monumental de Gesner foi um compêndio de conhecimento registrado sobre a vida animal, o Historiae animalium, no qual ele procurou distinguir fatos observados de mitos e erros populares. O primeiro volume (1551), uma obra generosamente ilustrada de 1.100 páginas de fólio, tratava de quadrúpedes vivíparos (animais de quatro patas que têm crias vivas). Os volumes posteriores, dedicados aos quadrúpedes ovíparos (aqueles que chocam as crias a partir de ovos), aves, peixes e outros animais aquáticos seguiram-se em 1554, 1555 e 1556; o quinto volume, parcialmente concluído, sobre serpentes, foi publicado postumamente em 1587.
Gesner nunca completou um levantamento da vida vegetal semelhante, mas as suas notas e cerca de 1.500 gravuras em madeira de plantas e suas importantes flores e sementes foram utilizadas por outros autores durante dois séculos após a sua morte. Embora em sua própria vida fosse mais conhecido por suas obras botânicas, Gesner também publicou Mithridates: de differentis linguis (1555), um relato de cerca de 130 línguas então conhecidas, e uma edição (1556) das obras do escritor romano Claudius Aelian, do século III.