Porównano dwie różne metody ekstrakcji białek magazynowych sorgo (Sorghum bicolor L. Moench.) do analizy metodą elektroforezy kapilarnej w wolnej strefie (FZCE). Tradycyjny rozpuszczalnik oparty na 60% t-butanolu porównywano z buforem boranowym o pH 10 zawierającym anionowy detergent SDS, po którym następowało wytrącenie niekafiryn przy użyciu 60% t-butanolu. Analiza FZCE dla obu typów ekstraktów wykazała identyczne wzory, pomimo faktu, że SDS powinien nadać wszystkim białkom jednakowy stosunek ładunku do masy. Metodologia ta została również z powodzeniem zastosowana do białek kukurydzy. Uważa się, że zastosowanie t-butanolu do wytrącenia niekafiryn, w połączeniu z elektroforezą przy niskim pH, spowodowało usunięcie SDS z białek magazynowych. Procedura ekstrakcji SDS dała bardziej stabilne ekstrakty do analizy FZCE. Ekstrakty te mogły być również wykorzystane bezpośrednio do rozdziału metodą elektroforezy kapilarnej SDS (SDS-CE). Kafiryny z 15 genotypów ekstrahowano za pomocą tej procedury i analizowano metodą FZCE i SDS-CE. Rozdzielczość kafiryn za pomocą FZCE była znacznie wyższa niż SDS-CE, wykazując, że białka kafiryn posiadają wysoki poziom zmienności gęstości ładunku w obrębie stosunkowo niewielkiego rozkładu wielkości cząsteczek. Dwie odrębne grupy α-kafiryn można było zaobserwować w elektrofotogramach FZCE.