Kalorymetria pośrednia mierzy zużycie O2 i produkcję CO2. Przy założeniu, że cały tlen jest zużywany do utleniania paliw degradowalnych i cały CO2, który w ten sposób powstaje jest odzyskiwany, możliwe jest obliczenie całkowitej ilości wyprodukowanej energii. Powinno być jasne, że „produkcja energii” oznacza konwersję chemicznej energii swobodnej składników odżywczych w energię chemiczną ATP plus utratę części energii podczas procesu utleniania.Oddechowa kalorymetria pośrednia, lub kalorymetria pośrednia (IC), jak jest znana przez większość autorów, jest nieinwazyjną i bardzo dokładną metodą pomiaru tempa metabolizmu, która ma poziom błędu niższy niż 1%. Charakteryzuje się wysoką powtarzalnością i została uznana za metodę złotego standardu. Metoda ta umożliwia oszacowanie BEE i REE, a także pozwala na identyfikację substratów energetycznych, które w danym momencie są w przeważającej mierze metabolizowane przez organizm. Opiera się ona na pośrednim pomiarze ciepła wytwarzanego w procesie utleniania makroskładników odżywczych, które jest szacowane poprzez monitorowanie zużycia tlenu (O2) i produkcji dwutlenku węgla (CO2) przez określony czas. Kalorymetr posiada kolektor gazowy, który dostosowuje się do osoby badanej oraz system, który mierzy objętość i stężenie O2 i CO2 minuta po minucie. Poprzez jednokierunkowy zawór, kalorymetr zbiera i określa ilościowo objętość i stężenie O2 wdechowego i CO2 wydychanego przez osobę badaną. Po osiągnięciu określonej objętości, spoczynkowy wydatek energetyczny jest obliczany za pomocą wzoru Weira, a wyniki są wyświetlane w oprogramowaniu dołączonym do systemu. Inny stosowany wzór to:

M = V O 2 ( R Q – 0,7 0,3 e c + 1 – R Q 0,3 e f ) {displaystyle M=VO_{2}}}left({frac {RQ-0,7}{0,3}}e_{c}+{frac {1-RQ}{0,3}e_{f}}right)}

gdzie RQ to iloraz oddechowy (stosunek objętości produkowanego CO2 do objętości zużywanego O2), e c {{displaystyle e_{c}}}

to 21,13 kilodżuli (5,05 kcal), ciepło uwalniane na litr tlenu w wyniku utleniania węglowodanów, a e f {displaystyle e_{f}}

to 19,62 kilodżuli (4,69 kcal), wartość dla tłuszczu. Daje to taki sam wynik jak wzór Weira przy RQ = 1 (spalanie tylko węglowodanów) i prawie taką samą wartość przy RQ = 0,7 (spalanie tylko tłuszczu).⊅∑′.