Excavata

Podobnie jak Rhizaria, Excavata (rysunki 5(e)-5(j)) są przede wszystkim zbiorem pierwotniaków, ale obejmują również pojedynczą grupę glonów wtórnych. Najdawniejszym wspólnym przodkiem wykopalisk był flagelat (prawdopodobnie wolno żyjący bakteriozaur) z charakterystycznym szerokim rowkiem żerowym, a różne wymarłe wolno żyjące grupy nadal mają tę podstawową formę komórki (Simpson, 2003; np. rysunek 5(f)). Ekskariaty dzielą się na dwie główne podgrupy, Metamonada i Discoba (Hampl i in., 2009). Metamonady wywodzą się od wspólnego przodka, który utracił zdolność do oddychania tlenowego, a w konsekwencji mają silnie zmodyfikowane mitochondria różnego rodzaju, którym brakuje genomów mitochondrialnych (Cavalier-Smith, 2003; Stairs i in., 2015). Wiele metamonad jest wolno żyjących i zamieszkuje ubogie w tlen środowiska morskie lub słodkowodne (np., Kolisko i in., 2010; Rysunek 5(f)), ale kilka podgrup stało się wyspecjalizowanymi pasożytami lub symbiontami zwierząt. Pasożyt jelitowy Giardia i pasożyt układu moczowo-płciowego Trichomonas vaginalis są wysoce rozpowszechnionymi patogenami człowieka (np, Adam, 2001; Lehker i Alderete, 2000), jednakże istnieje również spektakularna różnorodność symbiotycznych metamonad w tylnych trzewiach wielu drewnożernych termitów (Brugerolle i Lee, 2002a,b; Rysunek 5(e)).

Większość Discoba posiada tlenowe mitochondria z organellarnymi genomami, w rzeczywistości mała grupa flagelatów Jakobida (np., Reclinomonas i Andalucia) mają genomy mitochondrialne, które zachowują więcej unikalnych genów, i więcej cech bakteryjnych, niż genomy jakiegokolwiek innego eukariota (Burger i in., 2013; Lang i in., 1997). Discoba obejmują również Heterolobosea (Rysunek 5(g)), z których wiele ma naprzemiennie fazy ameby i flagelity (niesławna „mózgożerna ameba” Naegleria fowleri jest heterolobozą; patrz Visvesvara, 2013). Ostatnia główna grupa Discoba, Euglenozoa, obejmuje liczne pierwotniaki flagellaty, które są licznymi powierzchniowymi bakteriożercami i drapieżnikami eukariontów mikrobiologicznych (np. kinetoplastydy „bodonidalne” i fagotroficzne euglenidy; Boenigk i Arndt, 2002; Larsen i Patterson, 1990; Rysunek 5(j)). Obejmuje również pasożytnicze kinetoplastydy wywołujące śpiączkę, chorobę Chagasa i leiszmaniozę u ludzi (wszystkie wywoływane przez różne trypanosomatidy; Rysunek 5(h)), a także kilka ważnych chorób zwierząt i kilka roślin (Simpson i in., 2006; Vickerman, 2002). Euglenozoa jest również taksonomicznym domem dla fotosyntetyzujących euglenidów, które są wtórnymi glonami z plastydem pochodzenia zielonego (patrz wyżej; Rysunek 5(i)).