Twee verschillende extractiemethoden voor de extractie van opslagproteïnen uit sorghum (Sorghum bicolor L. Moench.) voor vrije zone capillaire elektroforese (FZCE) analyse werden met elkaar vergeleken. Een traditioneel oplosmiddel op basis van 60% t-butanol werd vergeleken met een pH 10 boraatbuffer met het anionische detergens SDS gevolgd door precipitatie van nonkafirines met 60% t-butanol. FZCE-analyse van beide soorten extracten toonde identieke patronen, ondanks het feit dat de SDS alle eiwitten gelijke lading-massaverhoudingen had moeten geven. Deze methode werd ook met succes toegepast op maïseiwitten. Het gebruik van t-butanol om de niet-kafirines te precipiteren, gecombineerd met elektroforese bij lage pH, zou de SDS uit de opslageiwitten hebben verwijderd. De SDS-extractieprocedure leverde stabielere extracten op voor FZCE-analyse. Deze extracten konden ook rechtstreeks gebruikt worden voor SDS capillaire electroforese (SDS-CE) scheidingen. Kafirines van 15 genotypes werden met deze procedure geëxtraheerd en geanalyseerd met FZCE en SDS-CE. De resolutie van de kafirines door FZCE was veel hoger dan de SDS-CE, wat aantoont dat de kafirine-eiwitten een hoog niveau van variabiliteit in ladingsdichtheid bezitten binnen een relatief kleine moleculaire grootteverdeling. Twee verschillende groepen α-kafirines konden worden gezien in de FZCE electropherogrammen.