De krant werd in 1815 opgericht als de Seneca Republican en kreeg in 1823 de nieuwe naam The Ithaca Journal. Volgens de website (zie links hieronder) werd de eerste dagelijkse editie van de krant gepubliceerd in 1870 en zijn de kantoren gevestigd in hetzelfde gebouw dat sinds 1905 in gebruik is.
The Journal werd in 1912 gekocht door Frank E. Gannett, en werd daarmee de tweede lokale krant van wat later het mediaconglomeraat Gannett Co, Inc. zou worden. Het fuseerde met de Daily News in 1919 en nam officieel de naam The Ithaca Journal-News aan, hoewel het wordt gepubliceerd onder de naam The Ithaca Journal.
Ondere haar sterren waren Kenneth Van Sickle, de lange tijd sportredacteur die decennialang een populaire column had, waarin alles van Cornell en Ithaca College tot middelbare scholen en lokale recreatieve sporten werd behandeld.
De krant won in 1985, onder Managing Editor Joseph Junod, Best of Gannett voor Sport Coverage voor zijn wekelijkse Softball magazine. In die tijd was de Journal ook de thuisbasis van drie fotografen, wier werk werd opgemerkt in heel Gannett en de krantenindustrie.
In mei 1996 schakelde The Journal over op een ochtend druk- en distributieschema na vele jaren als een middagdagblad. Tot dat moment was de krant die werd gerund door studenten van de Cornell University, The Cornell Daily Sun, het enige ochtenddagblad in de stad geweest.
Op 12 juni 2006 werden de drukfaciliteiten van de krant overgebracht naar de Gannett Central New York Production Facility in Johnson City, New York, gelegen buiten Binghamton, New York. Deze nieuwe faciliteit huisvest ook de drukfaciliteiten voor de Binghamton Press & Sun-Bulletin en Elmira Star-Gazette, beide dagbladen die eigendom zijn van Gannett.
Na deze verhuizing zal het bestaande gebouw van The Ithaca Journal worden gerenoveerd om uitgebreide kantoorruimte te omvatten.
In het najaar van 2006 ontsloeg The Ithaca Journal een deel van zijn in Ithaca gevestigde circulatie-, marketing- en reclamepersoneel. De oplage en marketingbehoeften van de krant worden nu vanuit het kantoor in Binghamton beheerd.
Tegen juni 2020 was het lokale personeel van de krant gereduceerd tot slechts één verslaggever: Matt Steecker. Dit heeft geresulteerd in dagen zonder nieuws uit Ithaca. In plaats daarvan gebruikt de krant inhoud van Gannett-eigendommen in Binghamton en Elmira om de krant en de website te vullen.