Colokalisatie in microscopie verwijst naar verschillende gegevensanalysemethoden om de mate van overlapping tussen twee kanalen in een beeld te karakteriseren (conventioneel R- en G-kanalen genoemd, of rode en groene kanalen, onafhankelijk van de Golflengte die ze werkelijk hebben geregistreerd). Een typische toepassing in fluorescentiemicroscopie is het bestuderen van de aanwezigheid van twee gelabelde targets in hetzelfde gebied van een cel.
Voor een toegankelijke inleiding zie Colokalisatiecoëfficiënten en Colokalisatie Basisprincipes.
Bedenk dat Waas en Ruis de Colokalisatie beïnvloeden.
Zie Colocalization Analyzer en Colocalization Theory voor meer details.

Object colocalization

Merk op dat de Object Analyzer in de Huygens Software ook colocalisatiemetingen op objectniveau verschaft. De Colocalization Analyzer werkt meer op het niveau van het hele beeld, hoewel sommige lokale statistieken van de colocaliserende regio’s gemakkelijk kunnen worden opgehaald.
Beide analyzers werken, in die zin, op complementaire manieren.

• De Object Analyzer stelt u in staat om objecten te definiëren (zie Object Segmentatie) en te zien hoeveel ze overlappen, in volume of intensiteit. Objecten die op deze manier zijn gedefinieerd, kunnen al dan niet overlappen met andere objecten. U kunt objecten uitfilteren die helemaal niet overlappen.
• De Colocalisatie Analyzer verkent het hele beeld om te zoeken naar colocaliserende regio’s, gebaseerd op de gebruikelijke colocalisatie coëfficiënten. Deze regio’s worden dan gesegmenteerd en behandeld als te analyseren objecten. Deze objecten zijn dus altijd intersectievolumes.