Genus: フラビウイルス

特徴

ゲノムの5末端には、他の属のウイルスには見られないI型キャップ(m7GpppAmp)が存在する。 ほとんどのフラビウイルスは、蚊やダニなどの節足動物の媒介によって脊椎動物に感染し、その中で活発に複製を行う。 4073>

Virion

Morphology

ウイルスは直径50nmの球状である(図1.Flavivirus)。 ウイルスの形態は2種類に分けられる。 成熟したウイルスはEとMの2つの膜結合タンパク質を含む。細胞内の未熟なウイルスは前駆体のprMを含み、成熟する過程でMにタンパク質分解される(Stadler et al.、1997)。 また、感染細胞から部分的に成熟・未熟な形態が放出されることもある。 デングウイルス(DENV)および西ナイルウイルス(WNV)のビリオン構造は、X線結晶構造解析により決定されている(Kuhnら、2002年、Mukhopadhyayら、2003年)。 エンベロープタンパク質であるEは、二量体の棒状分子で、膜と平行に配向し、中性pHのコンフォメーションではスパイク状の突起を形成しない(Yuら、2008)。 図1.フラビウイルスの低温電子顕微鏡写真からの画像再構成により、ビリオンのエンベロープは20面体対称であり、Eタンパク質の2量体がヘリンボン状に配列していることが明らかになった

Figure 1.Flavivirus. デングウイルス分離株の未熟粒子(左)と成熟粒子(右)の低温電子顕微鏡による3次元再構築(M. Rossmann氏提供)。 左は12.5Å分解能の未熟型デングウイルス、右は10Å分解能の成熟型デングウイルスの表面レンダリング。 ウイルスは縮尺通りに描かれているが、縮尺通りに着色されてはいない。

物理化学的および物理的性質

ウイルスのMrは正確には決定されていない。 成熟したビリオンは約200Sで沈降し、スクロース中で約1.19g cm-3の浮力を持つ(Kokorev et al.、1976)。 ウイルスは弱アルカリ性のpH8.0で安定であるが、酸性pH、40℃以上の温度、有機溶媒、洗剤、紫外線、ガンマ線照射によって容易に失活する。

核酸

フラビウイルスのビリオンRNAはポジティブセンスの感染性ssRNAで、9.2-11.0kbである。 ゲノムの5′-末端にはタイプIキャップ(m-7GpppAmp)があり、Aの後に高度に保存されたGヌクレオチドが続いている。 3末端にはポリ(A)トラクトがなく、保存されたジヌクレオチドCUで終止している。

タンパク質

ウイルスは3つの構造タンパク質を含む:カプシド(C、11kDa)、主要エンベロープタンパク質(E、50kDa)、未熟ビリオンのprM(26kDa)と、成熟ビリオンのM(8kDa)である。 Eタンパク質はウイルスのヘマグルチニンで、受容体結合と受容体介在エンドサイトーシスによる取り込み後の酸性pH依存の融合活性の両方を媒介する。 感染細胞内では7種類の非構造タンパク質が合成される。 NS1 (46 kDa), NS2A (22 kDa), NS2B (14 kDa), NS3 (70 kDa), NS4A (16 kDa), NS4B (27 kDa), NS5 (103 kDa)の7種類の非構造タンパク質が感染細胞内で合成される。 この属のいくつかの細菌は、翻訳中のリボソームの一部を-1 ntシフトさせ、新しいリーディングフレームで翻訳を続け、「トランスフレーム」融合タンパク質を生成するように誘導する配列を持つ(Firth and Atkins 2009)。 機能的に利用される場合、これはprogrammed-1 ribosomal frameshifting (-1 PRF)と称される。 NS1には複数の形態と役割があり、ウイルスRNAの複製に機能する細胞関連型と補体の活性化を制御する分泌型がある。 そのような形態の1つであるNS1′タンパク質は、-1リボソームフレームシフトの産物であり、ウイルスの神経侵入性に関与している(Melian et al.、2010)。 NS1のN末端1/3は、NS2Bとともにウイルスセリンプロテアーゼ複合体を形成し、ポリタンパク質のプロセッシングに関与している。 NS3のC末端には、RNAの複製に関与するRNAヘリカーゼドメインと、ウイルスRNAの5′末端キャップ構造の形成に関与すると考えられるRNAトリフォスファターゼ活性が存在する。 NS5は、ウイルスのRdRPとして働く最大かつ最も高度に保存されたタンパク質であり、また、ウイルスのキャップ構造の修飾に関与するメチルトランスフェラーゼ活性を有している。

脂質

ウイルスは約17重量%の脂質を含み、脂質は宿主細胞膜に由来する。

糖質

ウイルスは約9重量%の糖質(糖脂質、糖タンパク質)を含み、それらの組成と構造は宿主細胞(脊椎動物、節足動物)に依存する。 N-グリコシル化部位は、prM(1〜3箇所)、E(0〜2箇所)、NS1(1〜3箇所)のタンパク質に存在する。

ゲノム構成と複製

ゲノムRNAは、感染細胞内で唯一のウイルスメッセンジャーRNAを示す。 これは、すべての構造および非構造タンパク質をコードする10,000 nt以上の単一の長いORFからなり、5′-および3′-末端にNCRがある(図2.フラビウイルス)

Figure 2.Flavivirus. フラビウイルスのゲノム構成(ノンスケール)とポリタンパク質のプロセッシング。 ビリオンRNAは約11kbである。 上部はウイルスゲノムで、構造タンパク質と非構造タンパク質のコード領域、5′-と3′-NCRがある。 ゲノムの下のボックスは、タンパク質分解プロセシングカスケードによって生成されたウイルスタンパク質を示している。 P、H、R記号はそれぞれ、NS3プロテアーゼ、NS3 RNAヘリカーゼ、NS5 RdRPドメインの局在を示す。

5-NCRと3-NCRはどちらもウイルスRNA翻訳、複製、おそらくパッケージ化に関与するRNA配列モチーフを含んでいる。 いくつかの要素のRNA二次構造と機能は保存されているが、配列の構成、長さ、正確な局在は、属の異なるメンバー間、特にダニ媒介と蚊媒介のフラビウイルス間でかなり異なることがある。 例えば、ダニ媒介性脳炎ウイルスの3′-NCRは、内部にポリ(A)トラクトを持つ場合がある。 ウイルスの感染により、核周囲の小胞体内の細胞膜構造は劇的に変化し、小胞体由来の小胞パックが形成され、これがウイルスの複製部位である可能性が高い。 ゲノムRNAの翻訳後、RNA複製は相補的な負鎖の合成から始まり、それを鋳型としてさらにゲノム長の正鎖分子が作られる。 これらは、複製中間体(二本鎖領域と新生一本鎖分子を含む)と複製体(二重鎖RNA分子)を含む半保存的メカニズムにより合成される。 翻訳は通常、ORFの最初のAUGから始まるが、蚊媒介性フラビウイルスでは12〜14コドン下流の第2フレーム内AUGで行われることもある。 ポリタンパク質は、細胞内プロテアーゼとウイルスNS2B-NS3セリンプロテアーゼによって処理され、成熟した構造タンパク質と非構造タンパク質が生成される。 ERと細胞質に対するタンパク質のトポロジーは、内部のシグナル配列と停止配列によって決定される。 ウイルス粒子はまず粗面小胞体で観察され、ここがウイルス組み立ての場と考えられている。 これらの未熟なウイルスは、次に宿主の分泌経路の膜システムを通って、エキソサイトーシスが起こる細胞表面へと運ばれる。 ビリオンが放出される少し前に、prMタンパク質はfurinまたはfurin様細胞プロテアーゼによって切断され、成熟ビリオンが生成される。 感染細胞はまた、全ウイルスよりも沈降係数が低く(200Sよりも70S)、赤血球凝集活性を示す非感染性のサブウイルス粒子を放出する。

Biology

Host range

フラビウイルスはさまざまな脊椎動物や多くの場合、節足動物に感染する可能性がある。 脊椎動物の宿主範囲が限定されているウイルス(霊長類のみなど)もあれば、多種多様な種(哺乳類、鳥類など)に感染し複製するウイルスもある。 節足動物の感染経路は、通常、ウイルス性の脊椎動物を宿主とする場合であるが、ダニ媒介性フラビウイルスでは、媒介動物間の非ウイルス性感染も報告されている。 細胞融合剤ウイルスを含む同属の未分類の新グループは蚊にのみ感染するようであり、現在ではさらにいくつかの、遺伝的に大きく異なる昆虫専用のフラビウイルスが同定されている(Blitvich and Firth 2015)。

感染

ほとんどのフラビウイルスは節足動物を媒介するウイルスで、食血性節足動物のベクターから脊椎動物の宿主への感染サイクルがある。 既知のフラビウイルスの約50%は蚊を媒体とし,28%はダニを媒体とし,残りは節足動物を媒体としないネズミの間やコウモリの間で感染する。 いくつかのフラビウイルスでは、感染サイクルがまだ特定されていない。 場合によっては、血液製剤、臓器移植、非殺菌牛乳、エアロゾルによって、フラビウイルスがヒトに感染することもあります。 ダニ媒介性フラビウイルスの中には、非病原性感染として知られるプロセスによって、ダニ間で直接感染するものがあることが知られています。 節足動物の媒介者では、ウイルスは経卵巣的または垂直方向(蚊、マダニ)および経静止体(マダニ)にも感染することがあります。 4073>

地理的分布

フラビウイルスは世界中に分布しているが、個々の種は特定の流行地や疫病地に限定されている(例:, アフリカと南米の熱帯・亜熱帯地域の黄熱病ウイルス、アジア・オセアニア・アフリカ・オーストラリア・南北アメリカの熱帯地域のデング熱ウイルス、東南アジアの日本脳炎ウイルス、ヨーロッパと北アジアのダニ媒介脳炎ウイルスなど)。

病原性

黄熱ウイルス、デングウイルス、ジカウイルス、日本脳炎ウイルス、西ナイルウイルス、ダニ媒介脳炎ウイルスなど多くの重要なヒトの病原体を含む50%以上のフラビウイルスは、ヒト疾患と関連しています。 誘発される疾患は、中枢神経系の症状(髄膜炎、脳炎など)、発熱、関節痛、発疹、出血熱などを伴うことがあります。 いくつかのフラビウイルスは家畜や野生動物(七面鳥、豚、馬、羊、犬、ライチョウ、マスクラット)に対して病原性を持ち、経済的に重要な病気を引き起こす。

抗原性

すべてのフラビウイルスは血清学的に関連しており、ELISAなどの結合測定やポリクローナル抗体、モノクローナル抗体を用いた血球凝集阻害で証明することが可能である。 中和アッセイはより識別性が高く、種レベルまでではないが、より近縁なフラビウイルス血清複合体(図1.フラビウイルス科に示す)の同定に使用されている。 エンベロープタンパク質Eは、中和抗体の主要な標的であり、防御免疫を誘導する。 また、Eタンパク質はフラビウイルスの交差反応性非中和抗体も誘導する。 中和に関与する抗原部位は、Eタンパク質の3つの構造ドメインのそれぞれにマッピングされています。 prMおよびNS1タンパク質はまた、致死的な感染から感染動物を保護する抗体を誘導することができる。

Species demarcation criteria

属における種分化の基準は以下の通り:

  • 塩基および推定アミノ酸配列データ。
  • 抗原特性.
  • 地理的関連.
  • ベクター関連.
  • ホスト関連.
  • 疾患関連.
  • 生態的特性.

種の区分は上記のそれぞれの基準の組み合わせを考慮する。 ヌクレオチド配列の関連性、および結果として得られる系統樹は、種の区分けにとって重要な基準であるが、他の列挙された基準は、遺伝的に密接に関連するウイルスの区分けにおいて特に有用であろう。 例えば、ダニ媒介性脳炎ウイルスのfar-eastern(FE)株は、オムスク出血熱ウイルスと比較すると、遺伝的には比較的近縁であるにもかかわらず、明確な生態的差異を示している。 FE株はロシア極東の森林地帯でIxodes persulcatus属のマダニに主に感染し、オムスク出血熱ウイルスは西シベリアのステップ地帯でDermacentor属に特に感染し、Ixodes属にはあまり感染しない。 これらのウイルスは、回復期の血清を用いた中和試験においても抗原的に区別される。

Louping ill virusとTick-borne encephalitis virusは、遺伝的関係が近く、宿主の範囲が似ているにもかかわらず、生態(湿原対森林)、病原性(アカライチョウ、ヒツジ/ヤギ対ヒト)、地理的分布(英国対欧州/ユーラシア)が異なるため、Louping ill virus と Tick-borne encephalitis virusという別の種に分類できるウイルスの例となった。

一方、4つのデングウイルス血清型は、系統学的にも抗原的にも全く異なるにもかかわらず、すべて1つの種(デングウイルス)に属している。 これは、それらが同じ地理的地域や生態的生息地で共流行し、同一のベクターを利用し、同様のライフサイクルや疾患発現を示すという事実によって正当化されます(表1.フラビウイルス)

表1.フラビウイルス フラビウイルスを媒介・宿主別に分類したもの。

(ランガットウイルス

英国サブタイプ

アイルランドサブタイプ

スペイン語サブタイプ

グリークヤギ脳炎 ウイルスサブタイプ

DEER TICK VIRUS

について

極東サブタイプ

Siberian subtype

TYV

の順です。

デングウイルス1

デングウイルス2

デングウイルス 3

デングウイルス4

DENV-4

マレーバレー脳炎ウイルス

に掲載されました。

の場合

STRV

<3393>

(イエロー・フィーバー・ウイルス

の場合

Sokulukウィルス

AF013405

Yokose virus

の場合。

について

MMLV

BCPV

Rio Bravo virus

ウイルス種

アクセッション番号

ウイルス略称

ダニが媒介する。 哺乳類宿主

ガジェットガリーウイルス

DQ235145

GYV

キョウサヌール 森林病ウイルス

Kyasanur 森林病ウイルス

AY323490

Alkhumra 出血性熱ウイルス

AF331718

AHFV

Langat virus

Langat virus

AF253419

LGTV

Louping 病気ウイルス

ルーピング病ウイルス

Y07863

LIV

D12937

LIV-…Brit

X86784

LIV-…Ir

DQ235152

LIV-…スペイン

トルコ羊脳炎ウイルスサブタイプ

DQ235151

TSEV

DQ235153

GEV

Omsk hemorrhagic fever virus

AY193805

OHFV

Powassan virus

Powassan virus

L06436

POWV

DER TICK VIRUS

AF311056

DTV

Royal Farmウィルス

Royal Farm virus

DQ235149

RFV

Tick-…ボーン型脳炎ウイルス

欧州サブタイプ

U27495

TBEV-」。Eur

X07755

TBEV-。FE

L40361

TBEV-Sib

ダニが媒介する。 海鳥を宿主とする

ミーバンウイルス

DQ235144

MEAV

Saumarez Reefウィルス

Saumarez Reef ウイルス

DQ235150

SREV

Tyuleniy ウイルス

Tyuleniy virus

KF815939

Probably tick->TYUV

TYV

Probably tick->TYUV

Kadam virus

Kadam virus

DQ235146

KADV

Mosquito-…を媒介とする。 アロアウイルス群

アロアウイルス

AY632536

Aroa ウイルス

AROAV

Bussuquara virus

AF013366

BSQV

Iguape virus

AF013375

IGUV

ナランジャルウイルス

AF013390

NJLV

蚊ーを媒介とする。 デングウイルス群

デングウイルス

U88536

DENV-」。1

U87411

DENV-…2

M93130

DENV-。3

AF326573

蚊が媒介する。 日本脳炎ウイルス群

カシパコレウイルス

KF917536

CPCV

日本人 日本脳炎ウイルス

M18370

JEV

Koutango ウイルス

Koutango ウイルス

AF013384

KOUV

マレーバレー脳炎ウイルス

ALFY ウイルス

AF013360

AF161266

MVEV

St Louis encephalitisウイルス

St. Louis encephalitis virus

DQ525916

SLEV

Usutu virus

Usutu virus

AY453411

USUV

西ナイルウイルス

Kunjin virus

D00246

KUNV

West Nile virus

M12294

WNV

Yaounde virus

AF013413

YAOV

Mosquito-…を媒介とする。 ココベラウイルス群

ココベラウイルス

AY632541

KOKV

Stratford virus

AF013407

Mosquito-> モスキート。を媒介とする。 Ntayaウイルス群

バガザウイルス

Bagaza virus

AY632545

BAGV

Ilheus virus

Ilhéus virus

AY632539

ILHV

Rocio ウイルス

AF013397

ROCV

Israel turkey meningoencephalitis virus

AF013377

ITV

Ntaya ウイルス

Ntaya ウイルス

JX236040

NTAV

Tembusu ウイルス

Tembusu virus

JF895923

TMUV

ジカ熱 ウイルス

ジカウイルス

AY632535

ZIKV

モスキート-。を媒介とする。 黄熱病ウイルス群

Sepik virus

DQ837642

SEPV

Wesselsbron ウイルス

Wesselsbron ウイルス

EU707555

WESSV

Yellow fever virus

yellow fever virus

X03700

YFV

おそらく蚊に刺されている。を媒介とする。 ケドゥグーウイルス群

ケドゥグーウイルス

AY632540

KEDV

おそらく蚊が媒体と思われるものです。 エッジヒルウイルス群

Banzi virus

Banzi virus

DQ859056

BANV

Bouboui ウイルス

Bouboui ウイルス

DQ859057

BOUV

Edge Hill ウイルス

Edge Hill virus

DQ859060

EHV

Jugra virus

Jugra(ジュグラ)。 ウイルス

DQ859066

JUGV

Saboya ウイルス

Potiskum virus

DQ859067

Saboya ウイルス

DQ859062

SABV

Uganda Sウイルス

Uganda S virus

DQ859065

Unknown vector.の略。 エンテベコウモリウイルス群

Entebbe bat virus

DQ837641

ENTV

SOKV

Yokose virus

AB114858

YOKV

未知のベクターです。 モドックウイルス群

Apoi ウイルス

AF160193

APOIV

Cowbone Ridgeウィルス

Cowbone リッジウイルス

AF013370

CRV

Jutiapa ウイルス

Jutiapa ウイルス

KJ469371

JUTV

モドックウイルス

AJ242984

MODV

Sal Vieja virus

Sal Vieja virus

AF013401

SVV

San Perlitaウイルス

San Perlita virus

AF013402

SPV

ベクター不明です。 リオブラボーウイルス群

ブカラサコウモリウイルス

AF013365

BBV

Carey Islandウィルス

AF013368

CIV

Dakar bat virus

AF013371

DBV

モンタナ州 myotis leukoencephalitis virus

Montana myotis leukoencephalitis virus

AJ299445

Phnom Penh bat virus

Batu Cave virus

AF013369

Phnom Penh bat virus

AF013394

Rio Bravo virus

AF144692

RBV

メンバー種

種の模範分離者

アポイウイルス

アロエウイルス ウイルス

アロアウイルス

アロアウイルス

アロア・ウイルスイグアスウイルス

Aroa ウイルス

部分ゲノム

カシパコレウイルス

キャリーアイランドウイルス

カウボーンリッジウイルス

Dakar bat virus。

デングウイルス1型

完全なゲノム

デングウイルス3型

完全なゲノム

デングウイルス デングウイルス4型

完全なゲノム

Sokuluk virus

ガジェット・ガリー ウイルス

イルヘウスウイルス

イスラエル七面鳥髄膜脳筋膜炎 ウイルス

日本脳炎ウイルス

Jutiapaウイルス

Kadamウイルス

DQ235146

ケドゥグーウイルス

ココベラウイルス

ココベラウイルス

Koutangoウイルス。

キヤサヌール森林病ウイルス

AY323490

Kyasanur森林病ウイルス

を持つ。

ルーピングイールス

LIV LIV

ルーピングイールス

部分ゲノム

ルーピング・イッラ・ウイルス-スペイン・サブタイプ

完全なコーディングゲノム

Louping ill virus

Vergina

Modocウイルス

Montana myotis モンタナ州脳炎ウイルス

マレーバレー脳炎ウイルス

マレーバレー脳炎ウイルス

Ntayaウイルス

プノンペン・コウモリ・ウイルス

プノンペン・コウモリウイルス

Powassan ウイルス

Powassanウイルス。

ロイヤルファームウイルス

Saint Louis encephalitis virus

Sal Viejaウイルス

San Perlitaウイルス

Saumarez Reefウイルス

SepikウイルスSepik virus

Tembusu ウイルス

Tick-…borne encephalitis virus

Neudoerfl

NC_001672Eur

ダニ媒介脳炎ウイルス

Tyuleniy virus

ウェッセル・ブロンウイルス

West ウエストナイルウイルス

ヨコセウイルス

ジカ ウイルス

Pf13/251013-。18

完全なゲノム

ジカウイルス

完全に一致するもの ゲノム

ウイルス名 分離株 アクセッション番号 RefSeq番号 利用可能配列 ウイルス略称 Virus Abbb.
ApMAR AF160193 NC_003676 完全なゲノム APOIV
アロアウイルス BeAn 4073 AY632536 NC_009026 完全なゲノム AROAV
VenA-> Aroa virus1809 AF013362 部分ゲノム AROAV
ブスアカラ ウイルス BeAn 4073 AF013366 部分ゲノム BSQV
SP An71686 AF013375 部分ゲノム IGUV
Naranjal ウイルス 25008 AF013390 部分ゲノム NJLV
バガザウイルス DakAr B209 AY632545 NC_012534 コンプリートゲノム BAGV
Banzi virus SAH 366 DQ859056 NC_043110 Complete ゲノム BANV
Bouboui virus DAK AR B490 DQ859057NC_033693 完全なゲノム BOUV
Bukalasa bat virus UGBP-> Bukalasa bat virus111 AF013365 NC_043111 部分ゲノム BBV
BeAn 3276000 KF917536 NC_026623 完全なゲノム CPCV
P70-…1215 AF013368 NC_043112 部分ゲノム CIV
Cowbone Ridge virus W-.10986 AF013370 NC_043113 パーシャルゲノム
Dakar bat virus 209 AF013371 NC_043114 Dakar bat virus 209 部分ゲノム DBV
デングウイルス2型 16681 U87411 NC_001474 完全なゲノム DENV-> Complete Genome55372
45AZ5 U88536 DENV-…1
H87 M93130 DENV-3
814669 AF326573 DENV- COMPLETE4
Edge Hill virus YMP 48 DQ859060 NC_030289完全なゲノム EHV
Entebbe bat virus UgIL- Entebbe bat virus DQ837641 NC_008718 完全なゲノム ENTV
Entebbe bat virus LEIV-> Sokuluk400K AF013405 部分ゲノム SOKV
Gadgets Gullyウイルス Aus DQ235145 NC_033723 完全なゲノム GGYV
Ilheus virus オリジナル AY632539 NC_009028完全ゲノム ILHV
Rocio ウイルス H-…34675 AF013397 部分ゲノム ROCV
Israel turkey meningoencephalomyelitis virus AF013377 NC_043115 パーシャルゲノムITV
JaOArS982 M18370 ITV ITV ITV ITV JaOArS982 ITV ITV5537 NC_001437 完全なゲノム JEV
Jugra ウイルス P-…9-314 DQ859066 NC_033699 完全なゲノム JUGV
JG- …etc…etc…etc…etc…etc.etc…etc….etc…etc…etc…etc….etc128 KJ469371 NC_026620 完全なゲノム JUTV
Kadam ウイルス Uganda NC_033724 完全なゲノム KADV
DakAar D1470 AY632540 NC_012533 完全なゲノム KEDV
ココベラウイルス AusMRM 32 AY632541 NC_009029 完全なゲノム KOKV
Stratford ウイルス AUSC-。338 AF013407 部分ゲノム STRV
Koutango virus Dak Ar D1470 AF013384 NC_043116 パーシャルゲノム KOUV NC_039218 完全なゲノム KFDV
アルクムラ 出血熱ウイルス 1176 AF331718 完全なゲノム AHFV
Langat virus TP21 AF253419 NC_003690 完全なゲノム LGTV
369/T2 Y07863NC_001809 完全なゲノム LIV
Louping ill virus Louping ill virus- Louping ill virus- Louping illness virus- Louping illness- LI/31 D12937 部分ゲノム LIV-…Brit
LI/MA54 X86784 LIV-…Ir
87/2617 DQ235152 LIV-…スペイン
Louping ill virus Turkish sheep encephalitis virus subtype TTE80 DQ235151 完全コード化ゲノム TSEV
Greek goat encephalitits virus subtype DQ235153 完全コーディングゲノム GEV
メーバンウイルス Meaban ウイルス フランス DQ235144 NC_033721 完全なゲノム MEAV
Modoc ウイルス M544 AJ242984 NC_003635 完全なゲノム MODV
USA AJ299445 NC_004119 完全なゲノム MMLV
18629 AF161266 NC_000943 完全なゲノム MVEV
アルフイウイルス MRM-3929 AF013360 部分ゲノム ALFV
Ntaya ウイルス IPDIA JX236040 NC_018705 完全なゲノム NTAV
Omsk hemorrhagic fever virus Bogoluvovska AY193805 NC_005062 完全なゲノム OHFV
CAMA-38D AF013394 部分ゲノム PPBV
Batu Caveウイルス P70-…1459 AF013369 部分ゲノム BCV
Powassan ウイルス LB L06436 NC_003687 完全なゲノム POWV
シカダニウイルス ctb30 AF311056 完全なコーディングゲノム DTV
Rio Bravo virus RiMAR AF144692 NC_003675 完全なゲノム RBV
アフガニスタン DQ235149 NC_039219 コンプリート ゲノム RFV
Saboya virus Dak AR D4600 DQ859062NC_033697 コンプリートゲノム SABV
サボヤウイルス ポチスカムウイルス IBAN 10069 DQ859067 完全コード化ゲノム POTV
St. ルイ脳炎ウイルス Kern217 DQ525916 NC_007580 完全なゲノム SLEV
38TWM-」は、「Sal Viejaウイルス106 AF013401 NC_043117 部分ゲノム SVV
San Perlitaウイルス 71V-…1251 AF013402 NC_043118 部分ゲノム SPV
SaumarezReefウイルス ウイルス オーストラリア DQ235150 NC_033726 完全なゲノム SREV
MK7148 DQ837642 NC_008719 完全なゲノム SEPV
Tembusu virus JS804 JF895923 NC_015843 完全なゲノム TMUV
tick-borne encephalitis virus-European subtype Neudoerfl U27495 NC_001672 完全なゲノム TBEV- U27495
ダニ媒介脳炎ウイルス-極東サブタイプ Sofjin X07755 部分ゲノム TBEV-
dick-borne encephalitis virus- dick-borne encephalitis virus- dick-borne encephalitis virus- dick-borne encephalitis virus- Vasilchenko L40361 TBEV-Sib
LEIV- Tyuleniy virus6C KF815939 NC_023424 完全なゲノム TYUV
ウガンダSウイルス ウガンダ DQ859065 NC_033698 Complete Genome UGSV
Usutu virus Vienna 2001 AY453411 NC_006551 Completeゲノム<5537> USUV<5537>
SAH177 EU707555 NC_012735 完全なゲノム WESSV
956 M12294 NC_001563 完全なゲノム WNV
WNV クン ジンウイルス Kunkjin virusMRM61C D00246 KUNV
Yaounde virus DakArY276 AF013413 部分ゲノム YAOV
黄熱ウイルス 17D X03700 NC_002031 完全なゲノム YFV
大分36 AB114858 NC_005039 完全ゲノム YOKV
ジカウイルス MR 766 AY632535 NC_012532 完全なゲノム ZIKV
KY766069 ZIKV
H/PF/2013 KJ776791 ZIKV
Zika virus PRVABC59KX377337 完全なゲノム ZIKV
ウイルス名です。 模範菌株の選択、およびウイルスの略称は、ICTVの正式な呼称ではありません。

関連。 未分類のウイルス

について

について

の場合

FJ883471

について

ウイルス名

アクセッション番号

ウイルス略号

Mammalian tick->

カルシウイルス

DQ235147

KSIV

蚊-

Fitzroy River virus

KM361634

FRV

Spondweni virus

DQ859064

SPOV

T’Ho ウイルス

EU879061

Insect->Instructions特異的フラビウイルス

Aedes flavivirus

AB488408

AEFV

Aedes galloisi flavivirus

AB639347

AGFV

Anopheles flavivirus

KX148546

AnFV

Calbertado ウイルス

EU569288

CLBOV

細胞融合剤ウイルス

M91671

CFAV

Cuacua virus

KX245154

CuCuV

Culex フラビウイルス

GQ165808

CXFV

Culex theileri フラビウイルス

HE574574

CXthFV

Culiseta flavivirus

KT599442

CsFV

Ecuador Paraiso Escondidoウィルス

KJ152564

EPEV

Hanko virus

JQ268258

HaFV

Kamiti River virus

AY149905

KRV

Mercadeo virus

KP688058

MECDV

蚊フラビウイルス

KC464457

MoFV

ナキウリゴク ウイルス

GQ165809

NAKV

Nienokoue ウイルス

JQ957875

NiFV

Palm Creekウィルス

KC505248

PCFV

Parramatta Riverウイルス

KT192549

PaRV

Quảng Bìnhウィルス

FJ644291

QBV

Xishuangbanna aedes

flavivirus

KU201526

XFV

Yamadai flavivirus

AB981186

YDFV

節足動物の媒介が知られていないウイルス

バークドジ ウイルス

KC496020

BJV

Cháoyáng ウイルス

CHAOV

Donggang ウイルス

JQ086551

DONV

Ilomantsi virus

KC692067

ILOV

Kampung Karu virus

KY320648

KPKV

Lammi virus

FJ606789

LAMV

La Tina virus

KY320649

LTNV

Long Pine Key(ラ・パイン・キー ウイルス

KY290256

LPKV

Marisma mosquito virus

MF139576

MMV

ナナイウイルス

MF139575

NANV

Ngoye virus

DQ400858

NGOV

NANV

Nhumirim virus

KJ210048

NHUV

Nhumirim virus

KJ210048

NHUV

ヌーナネウイルス

EU159426

NOUV

タマナーズ コウモリウイルス

AF285080

TABV

Segmented flavi-Viruslike viruses

Jingmen tick virus

KJ001579.K

など。
KJ001580;
KJ001581;
KJ001582

JMTV

Mogiana tick virus

JX390986;
KY523073;
JX390985;
KY523074

MGTV

アロンシャンウイルス

MH158415;
MH158416;
MH158417;
MH158418

ASV

Guaico Culex virus

KM461666;
KM461667;
KM461668;
KM461669;
KM461670

GCXV

Shuangao insect virus 7

KR902717;
KR902718;
KR902719.All Rights Reserved;
KR902720

SAIV7

Wuhan flea virus

KR902713;
KR902714.KR902720;KR902714;
KR902715;
KR902716

WHFV

Wuhan aphid virus 1

KR902721;
KR902722;
KR902723;
KR902724

WHAV1

Wuhan aphid virus 2

KR902725.の3種類。
KR902726;
KR902727;
KR902728

WHAV2

Wuhan cricket virus

KR902709;
KR902710;
KR902711;
KR902712

WHCV

ウイルス名およびウイルス略称はICTV公式呼称ではございません。

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