特徴
ゲノムの5末端には、他の属のウイルスには見られないI型キャップ(m7GpppAmp)が存在する。 ほとんどのフラビウイルスは、蚊やダニなどの節足動物の媒介によって脊椎動物に感染し、その中で活発に複製を行う。 4073>
Virion
Morphology
ウイルスは直径50nmの球状である(図1.Flavivirus)。 ウイルスの形態は2種類に分けられる。 成熟したウイルスはEとMの2つの膜結合タンパク質を含む。細胞内の未熟なウイルスは前駆体のprMを含み、成熟する過程でMにタンパク質分解される(Stadler et al.、1997)。 また、感染細胞から部分的に成熟・未熟な形態が放出されることもある。 デングウイルス(DENV)および西ナイルウイルス(WNV)のビリオン構造は、X線結晶構造解析により決定されている(Kuhnら、2002年、Mukhopadhyayら、2003年)。 エンベロープタンパク質であるEは、二量体の棒状分子で、膜と平行に配向し、中性pHのコンフォメーションではスパイク状の突起を形成しない(Yuら、2008)。 図1.フラビウイルスの低温電子顕微鏡写真からの画像再構成により、ビリオンのエンベロープは20面体対称であり、Eタンパク質の2量体がヘリンボン状に配列していることが明らかになった
Figure 1.Flavivirus. デングウイルス分離株の未熟粒子(左)と成熟粒子(右)の低温電子顕微鏡による3次元再構築(M. Rossmann氏提供)。 左は12.5Å分解能の未熟型デングウイルス、右は10Å分解能の成熟型デングウイルスの表面レンダリング。 ウイルスは縮尺通りに描かれているが、縮尺通りに着色されてはいない。
物理化学的および物理的性質
ウイルスのMrは正確には決定されていない。 成熟したビリオンは約200Sで沈降し、スクロース中で約1.19g cm-3の浮力を持つ(Kokorev et al.、1976)。 ウイルスは弱アルカリ性のpH8.0で安定であるが、酸性pH、40℃以上の温度、有機溶媒、洗剤、紫外線、ガンマ線照射によって容易に失活する。
核酸
フラビウイルスのビリオンRNAはポジティブセンスの感染性ssRNAで、9.2-11.0kbである。 ゲノムの5′-末端にはタイプIキャップ(m-7GpppAmp)があり、Aの後に高度に保存されたGヌクレオチドが続いている。 3末端にはポリ(A)トラクトがなく、保存されたジヌクレオチドCUで終止している。
タンパク質
ウイルスは3つの構造タンパク質を含む:カプシド(C、11kDa)、主要エンベロープタンパク質(E、50kDa)、未熟ビリオンのprM(26kDa)と、成熟ビリオンのM(8kDa)である。 Eタンパク質はウイルスのヘマグルチニンで、受容体結合と受容体介在エンドサイトーシスによる取り込み後の酸性pH依存の融合活性の両方を媒介する。 感染細胞内では7種類の非構造タンパク質が合成される。 NS1 (46 kDa), NS2A (22 kDa), NS2B (14 kDa), NS3 (70 kDa), NS4A (16 kDa), NS4B (27 kDa), NS5 (103 kDa)の7種類の非構造タンパク質が感染細胞内で合成される。 この属のいくつかの細菌は、翻訳中のリボソームの一部を-1 ntシフトさせ、新しいリーディングフレームで翻訳を続け、「トランスフレーム」融合タンパク質を生成するように誘導する配列を持つ(Firth and Atkins 2009)。 機能的に利用される場合、これはprogrammed-1 ribosomal frameshifting (-1 PRF)と称される。 NS1には複数の形態と役割があり、ウイルスRNAの複製に機能する細胞関連型と補体の活性化を制御する分泌型がある。 そのような形態の1つであるNS1′タンパク質は、-1リボソームフレームシフトの産物であり、ウイルスの神経侵入性に関与している(Melian et al.、2010)。 NS1のN末端1/3は、NS2Bとともにウイルスセリンプロテアーゼ複合体を形成し、ポリタンパク質のプロセッシングに関与している。 NS3のC末端には、RNAの複製に関与するRNAヘリカーゼドメインと、ウイルスRNAの5′末端キャップ構造の形成に関与すると考えられるRNAトリフォスファターゼ活性が存在する。 NS5は、ウイルスのRdRPとして働く最大かつ最も高度に保存されたタンパク質であり、また、ウイルスのキャップ構造の修飾に関与するメチルトランスフェラーゼ活性を有している。
脂質
ウイルスは約17重量%の脂質を含み、脂質は宿主細胞膜に由来する。
糖質
ウイルスは約9重量%の糖質(糖脂質、糖タンパク質)を含み、それらの組成と構造は宿主細胞(脊椎動物、節足動物)に依存する。 N-グリコシル化部位は、prM(1〜3箇所)、E(0〜2箇所)、NS1(1〜3箇所)のタンパク質に存在する。
ゲノム構成と複製
ゲノムRNAは、感染細胞内で唯一のウイルスメッセンジャーRNAを示す。 これは、すべての構造および非構造タンパク質をコードする10,000 nt以上の単一の長いORFからなり、5′-および3′-末端にNCRがある(図2.フラビウイルス)
Figure 2.Flavivirus. フラビウイルスのゲノム構成(ノンスケール)とポリタンパク質のプロセッシング。 ビリオンRNAは約11kbである。 上部はウイルスゲノムで、構造タンパク質と非構造タンパク質のコード領域、5′-と3′-NCRがある。 ゲノムの下のボックスは、タンパク質分解プロセシングカスケードによって生成されたウイルスタンパク質を示している。 P、H、R記号はそれぞれ、NS3プロテアーゼ、NS3 RNAヘリカーゼ、NS5 RdRPドメインの局在を示す。
5-NCRと3-NCRはどちらもウイルスRNA翻訳、複製、おそらくパッケージ化に関与するRNA配列モチーフを含んでいる。 いくつかの要素のRNA二次構造と機能は保存されているが、配列の構成、長さ、正確な局在は、属の異なるメンバー間、特にダニ媒介と蚊媒介のフラビウイルス間でかなり異なることがある。 例えば、ダニ媒介性脳炎ウイルスの3′-NCRは、内部にポリ(A)トラクトを持つ場合がある。 ウイルスの感染により、核周囲の小胞体内の細胞膜構造は劇的に変化し、小胞体由来の小胞パックが形成され、これがウイルスの複製部位である可能性が高い。 ゲノムRNAの翻訳後、RNA複製は相補的な負鎖の合成から始まり、それを鋳型としてさらにゲノム長の正鎖分子が作られる。 これらは、複製中間体(二本鎖領域と新生一本鎖分子を含む)と複製体(二重鎖RNA分子)を含む半保存的メカニズムにより合成される。 翻訳は通常、ORFの最初のAUGから始まるが、蚊媒介性フラビウイルスでは12〜14コドン下流の第2フレーム内AUGで行われることもある。 ポリタンパク質は、細胞内プロテアーゼとウイルスNS2B-NS3セリンプロテアーゼによって処理され、成熟した構造タンパク質と非構造タンパク質が生成される。 ERと細胞質に対するタンパク質のトポロジーは、内部のシグナル配列と停止配列によって決定される。 ウイルス粒子はまず粗面小胞体で観察され、ここがウイルス組み立ての場と考えられている。 これらの未熟なウイルスは、次に宿主の分泌経路の膜システムを通って、エキソサイトーシスが起こる細胞表面へと運ばれる。 ビリオンが放出される少し前に、prMタンパク質はfurinまたはfurin様細胞プロテアーゼによって切断され、成熟ビリオンが生成される。 感染細胞はまた、全ウイルスよりも沈降係数が低く(200Sよりも70S)、赤血球凝集活性を示す非感染性のサブウイルス粒子を放出する。
Biology
Host range
フラビウイルスはさまざまな脊椎動物や多くの場合、節足動物に感染する可能性がある。 脊椎動物の宿主範囲が限定されているウイルス(霊長類のみなど)もあれば、多種多様な種(哺乳類、鳥類など)に感染し複製するウイルスもある。 節足動物の感染経路は、通常、ウイルス性の脊椎動物を宿主とする場合であるが、ダニ媒介性フラビウイルスでは、媒介動物間の非ウイルス性感染も報告されている。 細胞融合剤ウイルスを含む同属の未分類の新グループは蚊にのみ感染するようであり、現在ではさらにいくつかの、遺伝的に大きく異なる昆虫専用のフラビウイルスが同定されている(Blitvich and Firth 2015)。
感染
ほとんどのフラビウイルスは節足動物を媒介するウイルスで、食血性節足動物のベクターから脊椎動物の宿主への感染サイクルがある。 既知のフラビウイルスの約50%は蚊を媒体とし,28%はダニを媒体とし,残りは節足動物を媒体としないネズミの間やコウモリの間で感染する。 いくつかのフラビウイルスでは、感染サイクルがまだ特定されていない。 場合によっては、血液製剤、臓器移植、非殺菌牛乳、エアロゾルによって、フラビウイルスがヒトに感染することもあります。 ダニ媒介性フラビウイルスの中には、非病原性感染として知られるプロセスによって、ダニ間で直接感染するものがあることが知られています。 節足動物の媒介者では、ウイルスは経卵巣的または垂直方向(蚊、マダニ)および経静止体(マダニ)にも感染することがあります。 4073>
地理的分布
フラビウイルスは世界中に分布しているが、個々の種は特定の流行地や疫病地に限定されている(例:, アフリカと南米の熱帯・亜熱帯地域の黄熱病ウイルス、アジア・オセアニア・アフリカ・オーストラリア・南北アメリカの熱帯地域のデング熱ウイルス、東南アジアの日本脳炎ウイルス、ヨーロッパと北アジアのダニ媒介脳炎ウイルスなど)。
病原性
黄熱ウイルス、デングウイルス、ジカウイルス、日本脳炎ウイルス、西ナイルウイルス、ダニ媒介脳炎ウイルスなど多くの重要なヒトの病原体を含む50%以上のフラビウイルスは、ヒト疾患と関連しています。 誘発される疾患は、中枢神経系の症状(髄膜炎、脳炎など)、発熱、関節痛、発疹、出血熱などを伴うことがあります。 いくつかのフラビウイルスは家畜や野生動物(七面鳥、豚、馬、羊、犬、ライチョウ、マスクラット)に対して病原性を持ち、経済的に重要な病気を引き起こす。
抗原性
すべてのフラビウイルスは血清学的に関連しており、ELISAなどの結合測定やポリクローナル抗体、モノクローナル抗体を用いた血球凝集阻害で証明することが可能である。 中和アッセイはより識別性が高く、種レベルまでではないが、より近縁なフラビウイルス血清複合体(図1.フラビウイルス科に示す)の同定に使用されている。 エンベロープタンパク質Eは、中和抗体の主要な標的であり、防御免疫を誘導する。 また、Eタンパク質はフラビウイルスの交差反応性非中和抗体も誘導する。 中和に関与する抗原部位は、Eタンパク質の3つの構造ドメインのそれぞれにマッピングされています。 prMおよびNS1タンパク質はまた、致死的な感染から感染動物を保護する抗体を誘導することができる。
Species demarcation criteria
属における種分化の基準は以下の通り:
- 塩基および推定アミノ酸配列データ。
- 抗原特性.
- 地理的関連.
- ベクター関連.
- ホスト関連.
- 疾患関連.
- 生態的特性.
種の区分は上記のそれぞれの基準の組み合わせを考慮する。 ヌクレオチド配列の関連性、および結果として得られる系統樹は、種の区分けにとって重要な基準であるが、他の列挙された基準は、遺伝的に密接に関連するウイルスの区分けにおいて特に有用であろう。 例えば、ダニ媒介性脳炎ウイルスのfar-eastern(FE)株は、オムスク出血熱ウイルスと比較すると、遺伝的には比較的近縁であるにもかかわらず、明確な生態的差異を示している。 FE株はロシア極東の森林地帯でIxodes persulcatus属のマダニに主に感染し、オムスク出血熱ウイルスは西シベリアのステップ地帯でDermacentor属に特に感染し、Ixodes属にはあまり感染しない。 これらのウイルスは、回復期の血清を用いた中和試験においても抗原的に区別される。
Louping ill virusとTick-borne encephalitis virusは、遺伝的関係が近く、宿主の範囲が似ているにもかかわらず、生態(湿原対森林)、病原性(アカライチョウ、ヒツジ/ヤギ対ヒト)、地理的分布(英国対欧州/ユーラシア)が異なるため、Louping ill virus と Tick-borne encephalitis virusという別の種に分類できるウイルスの例となった。
一方、4つのデングウイルス血清型は、系統学的にも抗原的にも全く異なるにもかかわらず、すべて1つの種(デングウイルス)に属している。 これは、それらが同じ地理的地域や生態的生息地で共流行し、同一のベクターを利用し、同様のライフサイクルや疾患発現を示すという事実によって正当化されます(表1.フラビウイルス)
表1.フラビウイルス フラビウイルスを媒介・宿主別に分類したもの。
ウイルス種 |
アクセッション番号 |
ウイルス略称 |
|
ダニが媒介する。 哺乳類宿主 |
|||
ガジェットガリーウイルス |
DQ235145 |
GYV |
|
キョウサヌール 森林病ウイルス |
Kyasanur 森林病ウイルス |
AY323490 |
|
Alkhumra 出血性熱ウイルス |
AF331718 |
AHFV |
|
Langat virus |
Langat virus |
AF253419 |
LGTV |
Louping 病気ウイルス |
ルーピング病ウイルス |
Y07863 |
LIV |
D12937 |
LIV-…Brit |
||
X86784 |
LIV-…Ir |
||
DQ235152 |
LIV-…スペイン |
||
トルコ羊脳炎ウイルスサブタイプ |
DQ235151 |
TSEV |
|
DQ235153 |
GEV |
||
Omsk hemorrhagic fever virus |
AY193805 |
OHFV |
|
Powassan virus |
Powassan virus |
L06436 |
POWV |
DER TICK VIRUS |
AF311056 |
DTV |
|
Royal Farmウィルス |
Royal Farm virus |
DQ235149 |
RFV |
Tick-…ボーン型脳炎ウイルス |
欧州サブタイプ |
U27495 |
TBEV-」。Eur |
X07755 |
TBEV-。FE |
||
L40361 |
TBEV-Sib |
||
ダニが媒介する。 海鳥を宿主とする |
|||
ミーバンウイルス DQ235144 |
MEAV |
||
Saumarez Reefウィルス |
Saumarez Reef ウイルス |
DQ235150 |
SREV |
Tyuleniy ウイルス |
Tyuleniy virus |
KF815939 |
|
Probably tick->TYUV |
TYV |
Probably tick->TYUV |
|
Kadam virus |
Kadam virus |
DQ235146 |
KADV |
Mosquito-…を媒介とする。 アロアウイルス群 |
|||
アロアウイルス |
AY632536 |
Aroa ウイルス AROAV |
|
Bussuquara virus |
AF013366 |
BSQV |
|
Iguape virus |
AF013375 |
IGUV |
|
ナランジャルウイルス |
AF013390 |
NJLV |
|
蚊ーを媒介とする。 デングウイルス群 |
|||
デングウイルス |
U88536 |
DENV-」。1 |
|
U87411 |
DENV-…2 |
||
M93130 |
DENV-。3 |
||
AF326573 |
|||
蚊が媒介する。 日本脳炎ウイルス群 |
|||
カシパコレウイルス |
KF917536 |
CPCV |
|
日本人 日本脳炎ウイルス |
M18370 |
JEV |
|
Koutango ウイルス |
Koutango ウイルス AF013384 |
KOUV |
|
マレーバレー脳炎ウイルス |
ALFY ウイルス |
AF013360 |
|
AF161266 |
MVEV |
||
St Louis encephalitisウイルス |
St. Louis encephalitis virus |
DQ525916 |
SLEV |
Usutu virus |
Usutu virus AY453411 |
USUV |
|
西ナイルウイルス |
Kunjin virus |
D00246 |
KUNV |
West Nile virus |
M12294 |
WNV |
|
Yaounde virus |
AF013413 |
YAOV |
|
Mosquito-…を媒介とする。 ココベラウイルス群 |
|||
ココベラウイルス |
AY632541 |
KOKV |
|
Stratford virus |
AF013407 |
||
Mosquito-> モスキート。を媒介とする。 Ntayaウイルス群 |
|||
バガザウイルス |
Bagaza virus AY632545 |
BAGV |
|
Ilheus virus |
Ilhéus virus AY632539 |
ILHV |
|
Rocio ウイルス |
AF013397 |
ROCV |
|
Israel turkey meningoencephalitis virus |
AF013377 |
ITV |
|
Ntaya ウイルス |
Ntaya ウイルス |
JX236040 |
NTAV |
Tembusu ウイルス |
Tembusu virus |
JF895923 |
TMUV |
ジカ熱 ウイルス |
ジカウイルス |
AY632535 |
ZIKV |
モスキート-。を媒介とする。 黄熱病ウイルス群 |
|||
Sepik virus |
DQ837642 |
SEPV |
|
Wesselsbron ウイルス |
Wesselsbron ウイルス |
EU707555 |
WESSV |
Yellow fever virus |
yellow fever virus |
X03700 |
YFV |
おそらく蚊に刺されている。を媒介とする。 ケドゥグーウイルス群 |
|||
ケドゥグーウイルス |
AY632540 |
KEDV |
|
おそらく蚊が媒体と思われるものです。 エッジヒルウイルス群 |
|||
Banzi virus |
Banzi virus DQ859056 |
BANV |
|
Bouboui ウイルス |
Bouboui ウイルス DQ859057 |
BOUV |
|
Edge Hill ウイルス |
Edge Hill virus |
DQ859060 |
EHV |
Jugra virus |
Jugra(ジュグラ)。 ウイルス |
DQ859066 |
JUGV |
Saboya ウイルス |
Potiskum virus |
DQ859067 |
|
Saboya ウイルス |
DQ859062 |
SABV |
|
Uganda Sウイルス |
Uganda S virus |
DQ859065 |
|
Unknown vector.の略。 エンテベコウモリウイルス群 |
|||
Entebbe bat virus |
DQ837641 |
ENTV |
|
SOKV |
|||
Yokose virus |
AB114858 |
YOKV |
|
未知のベクターです。 モドックウイルス群 |
|||
Apoi ウイルス AF160193 |
APOIV |
||
Cowbone Ridgeウィルス |
Cowbone リッジウイルス |
AF013370 |
CRV |
Jutiapa ウイルス |
Jutiapa ウイルス |
KJ469371 |
JUTV |
モドックウイルス |
AJ242984 |
MODV |
|
Sal Vieja virus |
Sal Vieja virus |
AF013401 |
SVV |
San Perlitaウイルス |
San Perlita virus |
AF013402 |
SPV |
ベクター不明です。 リオブラボーウイルス群 |
|||
ブカラサコウモリウイルス |
AF013365 |
BBV |
|
Carey Islandウィルス |
AF013368 |
CIV |
|
Dakar bat virus |
AF013371 |
DBV |
|
モンタナ州 myotis leukoencephalitis virus |
Montana myotis leukoencephalitis virus |
AJ299445 |
|
Phnom Penh bat virus |
Batu Cave virus |
AF013369 |
|
Phnom Penh bat virus |
AF013394 |
||
Rio Bravo virus |
AF144692 |
RBV |
メンバー種
種 | ウイルス名 | 分離株 | アクセッション番号 | RefSeq番号 | 利用可能配列 | ウイルス略称 | Virus Abbb. | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ApMAR | AF160193 | NC_003676 | 完全なゲノム | APOIV | ||||||||
アロアウイルス | BeAn 4073 | AY632536 | NC_009026 | 完全なゲノム | AROAV | |||||||
VenA-> | Aroa virus1809 | AF013362 | 部分ゲノム | AROAV | ||||||||
ブスアカラ ウイルス | BeAn 4073 | AF013366 | 部分ゲノム | BSQV | ||||||||
SP An71686 | AF013375 | 部分ゲノム | IGUV | |||||||||
Naranjal ウイルス | 25008 | AF013390 | 部分ゲノム | NJLV | ||||||||
バガザウイルス | DakAr B209 | AY632545 | NC_012534 | コンプリートゲノム | BAGV | |||||||
Banzi virus | SAH 366 | DQ859056 | NC_043110 | Complete ゲノム | BANV | |||||||
Bouboui virus | DAK AR B490 | DQ859057NC_033693 | 完全なゲノム | BOUV | ||||||||
Bukalasa bat virus | UGBP-> | Bukalasa bat virus111 | AF013365 | NC_043111 | 部分ゲノム | BBV | ||||||
BeAn 3276000 | KF917536 | NC_026623 | 完全なゲノム | CPCV | ||||||||
P70-…1215 | AF013368 | NC_043112 | 部分ゲノム | CIV | ||||||||
Cowbone Ridge virus | W-.10986 | AF013370 | NC_043113 | パーシャルゲノム | ||||||||
Dakar bat virus | 209 | AF013371 | NC_043114 | Dakar bat virus | 209 | 部分ゲノム | DBV | |||||
デングウイルス2型 | 16681 | U87411 | NC_001474 | 完全なゲノム | DENV-> | Complete Genome55372 | ||||||
45AZ5 | U88536 | DENV-…1 | ||||||||||
H87 | M93130 | DENV-3 | ||||||||||
814669 | AF326573 | DENV- | COMPLETE4 | |||||||||
Edge Hill virus | YMP 48 | DQ859060 | NC_030289完全なゲノム | EHV | ||||||||
Entebbe bat virus | UgIL- | Entebbe bat virus | DQ837641 | NC_008718 | 完全なゲノム | ENTV | ||||||
Entebbe bat virus | LEIV-> | Sokuluk400K | AF013405 | 部分ゲノム | SOKV | |||||||
Gadgets Gullyウイルス | Aus | DQ235145 | NC_033723 | 完全なゲノム | GGYV | |||||||
Ilheus virus | オリジナル | AY632539 | NC_009028完全ゲノム | ILHV | ||||||||
Rocio ウイルス | H-…34675 | AF013397 | 部分ゲノム | ROCV | ||||||||
Israel turkey meningoencephalomyelitis virus | AF013377 | NC_043115 | パーシャルゲノムITV | |||||||||
JaOArS982 | M18370 | ITV | ITV | ITV | ITV | JaOArS982 | ITV | ITV5537 | NC_001437 | 完全なゲノム | JEV | |
Jugra ウイルス | P-…9-314 | DQ859066 | NC_033699 | 完全なゲノム | JUGV | |||||||
JG- …etc…etc…etc…etc…etc.etc…etc….etc…etc…etc…etc….etc128 | KJ469371 | NC_026620 | 完全なゲノム | JUTV | ||||||||
Kadam ウイルス | Uganda | NC_033724 | 完全なゲノム | KADV | ||||||||
DakAar D1470 | AY632540 | NC_012533 | 完全なゲノム | KEDV | ||||||||
ココベラウイルス | AusMRM 32 | AY632541 | NC_009029 | 完全なゲノム | KOKV | |||||||
Stratford ウイルス | AUSC-。338 | AF013407 | 部分ゲノム | STRV | ||||||||
Koutango virus | Dak Ar D1470 | AF013384 | NC_043116 | パーシャルゲノム | KOUV | NC_039218 | 完全なゲノム | KFDV | ||||
アルクムラ 出血熱ウイルス | 1176 | AF331718 | 完全なゲノム | AHFV | ||||||||
Langat virus | TP21 | AF253419 | NC_003690 | 完全なゲノム | LGTV | |||||||
369/T2 | Y07863NC_001809 | 完全なゲノム | LIV | |||||||||
Louping ill virus | Louping ill virus- | Louping ill virus- | Louping illness virus- | Louping illness- | LI/31 | D12937 | 部分ゲノム | LIV-…Brit | ||||
LI/MA54 | X86784 | LIV-…Ir | ||||||||||
87/2617 | DQ235152 | LIV-…スペイン | ||||||||||
Louping ill virus | Turkish sheep encephalitis virus subtype | TTE80 | DQ235151 | 完全コード化ゲノム | TSEV | |||||||
Greek goat encephalitits virus subtype | DQ235153 | 完全コーディングゲノム | GEV | |||||||||
メーバンウイルス | Meaban ウイルス | フランス | DQ235144 | NC_033721 | 完全なゲノム | MEAV | ||||||
Modoc ウイルス | M544 | AJ242984 | NC_003635 | 完全なゲノム | MODV | |||||||
USA | AJ299445 | NC_004119 | 完全なゲノム | MMLV | ||||||||
18629 | AF161266 | NC_000943 | 完全なゲノム | MVEV | ||||||||
アルフイウイルス | MRM-3929 | AF013360 | 部分ゲノム | ALFV | ||||||||
Ntaya ウイルス | IPDIA | JX236040 | NC_018705 | 完全なゲノム | NTAV | |||||||
Omsk hemorrhagic fever virus | Bogoluvovska | AY193805 | NC_005062 | 完全なゲノム | OHFV | |||||||
CAMA-38D | AF013394 | 部分ゲノム | PPBV | |||||||||
Batu Caveウイルス | P70-…1459 | AF013369 | 部分ゲノム | BCV | ||||||||
Powassan ウイルス | LB | L06436 | NC_003687 | 完全なゲノム | POWV | |||||||
シカダニウイルス | ctb30 | AF311056 | 完全なコーディングゲノム | DTV | ||||||||
Rio Bravo virus | RiMAR | AF144692 | NC_003675 | 完全なゲノム | RBV | |||||||
アフガニスタン | DQ235149 | NC_039219 | コンプリート ゲノム | RFV | ||||||||
Saboya virus | Dak AR D4600 | DQ859062NC_033697 | コンプリートゲノム | SABV | ||||||||
サボヤウイルス | ポチスカムウイルス | IBAN 10069 | DQ859067 | 完全コード化ゲノム | POTV | |||||||
St. ルイ脳炎ウイルス | Kern217 | DQ525916 | NC_007580 | 完全なゲノム | SLEV | |||||||
38TWM-」は、「Sal Viejaウイルス106 | AF013401 | NC_043117 | 部分ゲノム | SVV | ||||||||
San Perlitaウイルス | 71V-…1251 | AF013402 | NC_043118 | 部分ゲノム | SPV | |||||||
SaumarezReefウイルス ウイルス | オーストラリア | DQ235150 | NC_033726 | 完全なゲノム | SREV | |||||||
MK7148 | DQ837642 | NC_008719 | 完全なゲノム | SEPV | ||||||||
Tembusu virus | JS804 | JF895923 | NC_015843 | 完全なゲノム | TMUV | |||||||
tick-borne encephalitis virus-European subtype | Neudoerfl | U27495 | NC_001672 | 完全なゲノム | TBEV- | U27495 | ||||||
ダニ媒介脳炎ウイルス-極東サブタイプ | Sofjin | X07755 | 部分ゲノム | TBEV- | ||||||||
dick-borne encephalitis virus- | dick-borne encephalitis virus- | dick-borne encephalitis virus- | dick-borne encephalitis virus- | Vasilchenko | L40361 | TBEV-Sib | ||||||
LEIV- | Tyuleniy virus6C | KF815939 | NC_023424 | 完全なゲノム | TYUV | |||||||
ウガンダSウイルス | ウガンダ | DQ859065 | NC_033698 | Complete Genome | UGSV | |||||||
Usutu virus | Vienna 2001 | AY453411 | NC_006551 | Completeゲノム<5537> | USUV<5537> | |||||||
SAH177 | EU707555 | NC_012735 | 完全なゲノム | WESSV | ||||||||
956 | M12294 | NC_001563 | 完全なゲノム | WNV | ||||||||
WNV | クン ジンウイルス | Kunkjin virusMRM61C | D00246 | KUNV | ||||||||
Yaounde virus | DakArY276 | AF013413 | 部分ゲノム | YAOV | ||||||||
黄熱ウイルス | 17D | X03700 | NC_002031 | 完全なゲノム | YFV | |||||||
大分36 | AB114858 | NC_005039 | 完全ゲノム | YOKV | ||||||||
ジカウイルス | MR 766 | AY632535 | NC_012532 | 完全なゲノム | ZIKV | |||||||
KY766069 | ZIKV | |||||||||||
H/PF/2013 | KJ776791 | ZIKV | ||||||||||
Zika virus | PRVABC59KX377337 | 完全なゲノム | ZIKV |
ウイルス名です。 模範菌株の選択、およびウイルスの略称は、ICTVの正式な呼称ではありません。
関連。 未分類のウイルス
ウイルス名 |
アクセッション番号 |
ウイルス略号 |
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Mammalian tick-> |
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カルシウイルス |
DQ235147 |
KSIV |
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蚊- |
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Fitzroy River virus |
KM361634 |
FRV | ||||||||
Spondweni virus |
DQ859064 |
SPOV |
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T’Ho ウイルス |
EU879061 |
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Insect->Instructions特異的フラビウイルス |
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Aedes flavivirus |
AB488408 |
AEFV |
||||||||
Aedes galloisi flavivirus |
AB639347 |
AGFV |
||||||||
Anopheles flavivirus |
KX148546 |
AnFV |
||||||||
Calbertado ウイルス |
EU569288 |
CLBOV |
||||||||
細胞融合剤ウイルス |
M91671 |
CFAV |
||||||||
Cuacua virus |
KX245154 |
CuCuV |
||||||||
Culex フラビウイルス |
GQ165808 |
CXFV |
||||||||
Culex theileri フラビウイルス |
HE574574 |
CXthFV |
||||||||
Culiseta flavivirus |
KT599442 |
CsFV |
||||||||
Ecuador Paraiso Escondidoウィルス KJ152564 |
EPEV |
|||||||||
Hanko virus |
JQ268258 |
HaFV |
||||||||
Kamiti River virus |
AY149905 |
KRV |
||||||||
Mercadeo virus |
KP688058 |
MECDV |
||||||||
蚊フラビウイルス |
KC464457 |
MoFV |
||||||||
ナキウリゴク ウイルス |
GQ165809 |
NAKV |
||||||||
Nienokoue ウイルス |
JQ957875 |
NiFV |
||||||||
Palm Creekウィルス |
KC505248 |
PCFV |
||||||||
Parramatta Riverウイルス |
KT192549 |
PaRV |
||||||||
Quảng Bìnhウィルス |
FJ644291 |
QBV |
||||||||
Xishuangbanna aedes flavivirus |
KU201526 |
XFV |
||||||||
Yamadai flavivirus |
AB981186 |
YDFV |
||||||||
節足動物の媒介が知られていないウイルス |
||||||||||
バークドジ ウイルス |
KC496020 |
BJV |
||||||||
Cháoyáng ウイルス |
CHAOV |
|||||||||
Donggang ウイルス |
JQ086551 |
DONV |
||||||||
Ilomantsi virus |
KC692067 |
ILOV |
||||||||
Kampung Karu virus |
KY320648 |
KPKV |
||||||||
Lammi virus |
FJ606789 |
LAMV |
||||||||
La Tina virus |
KY320649 |
LTNV |
||||||||
Long Pine Key(ラ・パイン・キー ウイルス |
KY290256 |
LPKV |
||||||||
Marisma mosquito virus |
MF139576 |
MMV |
||||||||
ナナイウイルス |
MF139575 |
NANV |
||||||||
Ngoye virus |
DQ400858 |
NGOV |
NANV |
|||||||
Nhumirim virus |
KJ210048 |
NHUV |
Nhumirim virus |
KJ210048 |
NHUV |
ヌーナネウイルス |
EU159426 |
NOUV |
||
タマナーズ コウモリウイルス |
AF285080 |
TABV |
||||||||
Segmented flavi-Viruslike viruses |
||||||||||
Jingmen tick virus |
KJ001579.K |
など。 KJ001580; KJ001581; KJ001582 |
JMTV |
|||||||
Mogiana tick virus |
JX390986; |
MGTV |
||||||||
アロンシャンウイルス |
MH158415; |
ASV |
||||||||
Guaico Culex virus |
KM461666; |
GCXV |
||||||||
Shuangao insect virus 7 |
KR902717; |
SAIV7 |
||||||||
Wuhan flea virus |
KR902713; |
WHFV |
||||||||
Wuhan aphid virus 1 |
KR902721; |
WHAV1 |
||||||||
Wuhan aphid virus 2 |
KR902725.の3種類。 |
WHAV2 |
||||||||
Wuhan cricket virus |
KR902709; |
WHCV |