DDRGK1 is required for ER homoeostasis
DDRGK1の細胞機能の理解のため、先に述べた21種類のsiRNA混合を用いてDDGK1のノックダウンの影響を検討した。 その結果、DDRGK1のノックダウンにより、MCF7とHepG2の両細胞において、Annexin V/PI染色(図1a)、カスパーゼ3の活性化およびPARP切断(図1b)で特徴付けられるアポトーシス細胞死が誘導されることが分かった。 なお、DDRGK1のノックダウンによって誘導されたHepG2細胞ではカスパーゼ-3切断を検出できるが、MCF7細胞ではカスパーゼ-3が欠損しているため、検出できないことに注意すべきである22。 定量的リアルタイムPCR(Q-PCR)解析により、DDRGK1のノックダウンにより、プロアポトーシス遺伝子BAX、BAK、NOXA、DR5およびBidの発現が増加し、一方、アンチアポトーシス遺伝子Bcl-2の発現が減少することがわかった(図1c,d)。 重要なことは、MCF7およびHepG2細胞におけるDDRGK1のノックダウンがERストレス応答を誘導し、BiP、HSPA8およびCHOPのERストレス特異的遺伝子発現が増加することがわかった(図1e、f)
DDRGK1がERストレス応答に関与することをさらに確認するために、ERストレス誘導物質であるタプシガルギン(Tg)およびツニカマイシン(Tm)で処理した後の細胞の生存に対するDDRGK1の影響を決定した。 DDRGK1をノックダウンすると、HepG2とMCF7の両細胞において、Tg処理によるERストレス誘発性アポトーシスを、Annexin V/PI染色とカスパーゼ-3とPARPの切断によって評価した(図2a-cおよび補足図1a-c)。 一方、DDRGK1の過剰発現は、HepG2細胞におけるERストレス誘発性細胞死を減少させた(図2d-f)。 さらに、MCF7細胞の生存率をMTTアッセイで評価した結果、DDRGK1をノックダウンすると、TgまたはTm処理に対して感受性が高くなり、細胞生存率が低下する(補足図1D)、一方、DDRGK1を過剰発現するとTgまたはTm処理後の細胞生存率が上昇する(補足図1E)ことが分かった。 以上のことから、DDRGK1はERホメオスタシスの制御に重要な役割を果たしていることが示唆された。
DDRGK1 modulates the UPR
DDRGK1 がどのように ER homoeostasis を制御するのかを理解するために、まず DDRGK1 欠損細胞における 3 つの UPR センサーとその下流の標的のタンパク質レベルの変化について分析した。 その結果、MCF7およびHepG2細胞においてDDRGK1をノックダウンすると、総IRE1αのレベルは有意に低下したが、リン酸化IRE1α(p-IRE1α)のレベルは弱くなった(図3a)。 ATF6および切断型ATF6のレベルは影響を受けなかった(図3a)。 興味深いことに、DDRGK1のノックダウンは、総PERKのレベルに影響を与えなかったが、リン酸化PERK(p-PERK)およびBiPのレベルは、有意に増加した(図3a)。 次に、IRE1αの基質であるXBP1に対するDDRGK1枯渇の影響を検討した。 その結果、DDRGK1ノックダウンMCF7細胞では、XBP1のスプライシングフォームであるXBP1sが時間依存的に有意に減少し(図3b)、これはIRE1αタンパク質レベルの変化と相関していた(補足図2A)。 さらに、DDRGK1の枯渇は、MCF7細胞およびHepG2細胞の両方において、eIF2αリン酸化レベル(p-eIF2α)およびCHOP発現量を増加させた(補足図2B)。 これらの結果は、図1および2で観察されたように、DDRGK1の枯渇がUPR-IRE1αシグナルを抑制し、UPR-PERKアポトーシス経路を活性化し、その結果、アポトーシスを誘発することを示唆するものである。 しかし、DDRGK1過剰発現細胞では、IRE1αのレベルが用量依存的に上昇した(図3c)。一方、p-PERK、PERK、ATF6、p-IRE1α、BiPおよびXBP1のスプライシング形態のレベルは大きく変化しなかった(図3c;補足図2CおよびD)。 DDRGK1とUPRの機能的関係を探るため、DDRGK1ノックダウンMCF7細胞と対照細胞において、Tg処理後のIRE1αとPERKの動的変化を異なるタイミングで評価した。 Tg処理により、予想通り、コントロール細胞のIRE1αおよびp-IRE1α、p-PERKおよびBiPのレベルが増加した。 しかし、DDRGK1欠失細胞では、コントロール細胞と比較して、総IRE1αレベルが有意に低下し(0-24時間)、p-IRE1αレベルは緩やかに低下した(4-24時間)(図3d)。 同時に、XBP1sのレベルは、DDRGK1欠失細胞において、対照細胞と比較して減少した(4-12時間)(図3e)。 PERKの総量は変化しなかったが、p-PERKはDDRGK1欠失細胞で有意に増加した(0-12時間)(図3d)。 同様の結果は、HepG2細胞でも得られた(補足図2EおよびF)。 以上のことから,DDRGK1の枯渇はIRE1αの分解とPERKの活性化を引き起こすことが示唆された。
DDRGK1 はIRE1α
UPR はERストレスセンサーによりERストレス時に誘発され、ER homoeostasis 8を調節している。 マウスでIRE1αを肝細胞特異的に欠失させるとUPR-PERK経路が活性化されることが報告されている23。 DDRGK1 欠損細胞で観察された p-PERK の誘導が IRE1α のレベル低下に よってもたらされているかどうかを調べるために、IRE1α欠失細胞における p-PERK, PERK およびその下流標的のレベルを調べた。 その結果、IRE1αのノックダウンにより、MCF7細胞、HepG2細胞ともにp-PERKおよびp-eIF2αのタンパク質レベルが有意に増加し(図4a)、DDRGK1欠失細胞で観察されたものと同様である(図3a;補足図2b)。 これらの結果は、DDRGK1がIRE1αを標的とすることでUPRを制御していることを示している。 次に、DDRGK1がどのようにIRE1αを制御しているのかについて検討した。 その結果、DDRGK1ノックダウン細胞では、mRNAレベルではなく、IRE1αタンパク質レベルが劇的に減少していた(補足図3A)。 プロテアソーム阻害剤MG132で細胞を処理すると、DDRGK1が介在するIRE1αタンパク質の減少が阻止された(図4b;補足図3B)。 さらに、DDRGK1の枯渇は、シクロヘキシミドチェイスアッセイにおけるIRE1αの半減期を劇的に減少させることが確認された(図4c)。 これらの観察結果に従い、IRE1αの異所性発現は、DDRGK1欠失MCF7およびHepG2細胞の両方において、コントロール細胞と比較して、アネキシンV/PI染色およびカスパーゼ3活性化によって特徴付けられる細胞生存率を改善することが分かった(図4d、e;補足図3CおよびD)。 全体として、これらの結果は、DDRGK1がIRE1αの安定性を調節し、それによってUPRを調節することを示唆する。