ポルトガルのイザベラとフィリップ善人
イザベラはさらに8週間ポルトガルを離れることがなかった。 彼女の父親は船団と衣装を準備させ、1429年10月19日、約20隻の船団とともに、イザベラは-約2000人のポルトガル人を伴って-ポルトガルを永遠に離れることになった。 11週間にわたる航海の間、船団は嵐に見舞われ、いくつかの船と花嫁衣装の多くを失ったが、1429年12月25日に船団はスルイスに到着した。 公爵夫人は翌日に下船し、2週間後の1430年1月7日にフィリップと宗教上の正式な結婚を祝った。
イザベラは夫とともに、ナミュール伯爵夫人ジャンヌ・ド・アルクールを伴って、ブルゴーニュの主要な領地を旅した。 ゲント（1月16日）、コルトレイク（2月13日）、リール、そしてブリュッセル、アラス、ペロンヌ＝アン＝メラントワ、メヘレン、3月中旬にはノヨンと、イザベラは春までここで休んでいたが、ジョアン＝ダルクが近くのコンピエーニュに対して遠征したときだけ出発している。
ヨーロッパで最も贅沢なブルゴーニュの宮廷生活に対して、イザベラは当初は何の準備もしていなかった。 ポルトガルの皇太子は、結婚を交渉したブルゴーニュ使節の目に、初めて会ったときは修道女のように見えたと言われ、今は妊娠を隠すためにゆったりした服に平たい羽織りを着ていたので、新しい宮廷では特に下品に見えたそうです。 しかし、イザベラにとって、それ以上に腹立たしかったのは、夫の振る舞いだった。 イザベラが着任したときも、妊娠したときも、彼は贈り物をしたが、貞節と貞操の誓いを守るつもりがないことは明らかであった。 しかし、彼は貞節と貞操の誓いを守るつもりがないことを明らかにした。彼は多くの女性を愛人にし、そのほとんどは宮廷から離れて暮らし、50人もの非嫡出子がいた。
イザベラは結婚から1年後の1430年12月30日にブリュッセルのクーデンベルクで最初の子供を出産した。 アントワーヌは生まれつき病弱であったが、1431年1月16日に洗礼を受け、間もなく両親は公爵家の用事のために出かけた。 その年の秋には、イザベラは再び次男ジョゼフを身ごもった。さらに重要なことは、夫と長い間継続して過ごし、彼女の知性と能力、そしてブルゴーニュの独立への決意を示したことであった。 そのため、1432年1月にフランスのシャルル7世がブルゴーニュを攻撃し始めると、フィリップはディジョンを守るためにクーデンブルグを離れ、留守中の代理人を彼女に命じた。 アントワーヌとジョセフは1432年に死去したが、公爵夫人は1433年11月10日に後のシャルル・ザ・ボールドを出産した。
イザベラは洗練された知的な女性で、芸術家や詩人に囲まれるのを好んだという。 芸術の惜しみないパトロンであった。 政治面では、息子に大きな影響を与えたが、それ以上に、夫の代表として何度も外交会議に出席し、夫が不在のときは夫の代わりに政治を行った。 特に、息子のシャルルとフランスのカトリーヌの結婚をはじめ、宮廷の人々の結婚を数多く取り持った。 また、カトリーヌに付き添うゲルダール家のメアリーにも特別な配慮をした。 イザベラはスコットランドのジェームズ2世との結婚を手助けし、彼女を女王とした
。