ハイパーリンクレキシアは、シナプス前およびシナプス後のタンパク質をコードするさまざまな遺伝子によって引き起こされることが知られています。

GLRA1Edit

最初にハイパークレプシアと決定的に結びついた遺伝子はGLRA1であった。 GLRA1遺伝子はグリシン受容体α1サブユニットをコードしており、これはグリシン受容体βサブユニットとともにシナプスのグリシン受容体を形成している。 抑制性グリシン受容体は、リガンドが結合した塩化物チャネルであり、脳幹や脊髄における高速な反応を促進する。 α1サブユニットのみからなるホモマー型グリシン受容体は、通常のイオンチャネル電気生理を示すが、シナプス接合部には隔離されない。

これらのヘテロマーにおいて、α-1サブユニットがグリシンと結合して構造変化を起こし、5量体の構造変化を誘導してイオンチャネルを開口させると考えられている。 当初は常染色体優性遺伝が報告されていたが、少なくともそれと同数の常染色体劣性遺伝の症例が報告されている。 グリシンと結合できない、あるいは必要な立体構造変化を適切に起こせない構造的に正常なタンパク質を引き起こす変異は優性遺伝し、受容体タンパク質に統合できない切断型あるいは野生型サブユニットを引き起こす変異は劣性遺伝することが一般的である。 βサブユニットからなるホモマー型グリシン受容体はグリシン刺激に応答して開口しないが、βサブユニットはゲフィリンとの相互作用を通じて受容体が適切に局在化し、シナプス間隙に受容体が集積するために必須である。 SLC6A5遺伝子は、神経細胞のシナプス前グリシン再取込トランスポーターであるGlyT2トランスポーターをコードしている。 グリア細胞に多く存在するGlyT1トランスポーターと比較して、GlyT2はグリシン作動性ニューロンの軸索末端内でグリシンの濃度を高く維持するのに役立っている。 SLC6A5遺伝子の変異は、常染色体劣性遺伝的にハイパークレキシアと関連している。 この遺伝子の欠陥は、細胞膜へのトランスポーターの取り込みに影響を与えるか、トランスポーターが輸送する分子（ナトリウムイオン、塩素イオン、グリシン）への親和性に影響を与えるかのいずれかであると推測される。 これらの作用のいずれかが、シナプス前細胞が適切なグリシン神経伝達に必要な高濃度のグリシンを小胞内で産生する能力を劇的に低下させるであろう。 GPHNとARHGEF9は、しばしば超複雑症の遺伝的原因のリストに含まれているが、実際には、古典的な超複雑症とは全く異なる、より複雑な表現型が生み出されている。

GPHNEdit

Gephyrinはグリシン受容体を調整すると考えられている膜タンパク質で、GPHNという遺伝子がコードしている。 この遺伝子のヘテロ接合型変異は散発的なハイパークレキシアの症例で確認されているが、この変異が病原であるかどうかについては実験データから結論が出ていない。 ゲフィリンは、グリシン受容体βサブユニットと細胞内の微小管構造の両方に結合する作用により、シナプス結合部でのグリシン受容体の集積に必須である。 また、ゲフィリンは、シナプスにおけるGABA受容体のクラスター化やモリブデン補酵素の合成にも寄与している。

ARHGEF9Edit

collybistin（ARHGEF9）をコードする遺伝子内の欠陥は、てんかんと協調して過敏症を引き起こすことが明らかにされている。 ARHGEF9遺伝子はX染色体上に存在するため、この遺伝子はX連鎖劣性遺伝を示す。 コリビスチン蛋白質は、グリシン受容体とGABA受容体の適切な局在に重要なゲフィリン標的化に関与している。 コルリビスティンの機能が欠損すると、シナプス間隙のグリシンおよびGABA受容体が人工的に欠落することになる

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