Immunophenotyping は、細胞によって発現されるタンパク質を研究するために用いられる手法です。 この手法は、基礎科学研究および実験室診断の目的で一般的に使用されています。 組織切片（新鮮な組織または固定組織）、細胞懸濁液などで行うことができる。 例として、白血病の診断など、腫瘍マーカーの検出が挙げられる。 これは、白血球の膜上の表面タンパク質に向けられた抗体で、白血球を標識するものである。 適切な抗体を選択することで、白血病細胞の分化を正確に判断することができる。 標識された細胞は、フローサイトメーターというレーザーを使った装置で処理され、1秒間に数千個の細胞を分析することができる。 フローサイトメトリーによるイムノフェノタイピングの結果、悪性細胞はCD19、CD10、dimCD20、CD45、HLA-DR、およびλ免疫グロブリン軽鎖に陽性であることが判明しました。 モノクローナルB細胞集団によるCD5またはCD23の共発現は見られなかった」

イムノフェノタイピングは、蛍光色素を結合した抗体をプローブとして使用し、標的細胞を高い親和性で染色する非常に一般的なフローサイトメトリー検査である。 この手法により、異種試料中の各細胞株を、タンパク質の組み合わせの有無に応じて、迅速かつ容易にフェノタイピングすることができます。 したがって、複雑なサンプルでも視認性が向上する

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