Se perustettiin vuonna 1815 nimellä Seneca Republican, ja sen nimi muutettiin The Ithaca Journaliksi vuonna 1823. Sen verkkosivujen (ks. linkit alla) mukaan lehden ensimmäinen päivittäinen painos julkaistiin vuonna 1870, ja sen toimitilat sijaitsevat samassa rakennuksessa, jossa se on ollut vuodesta 1905.
Journalin osti Frank E. Gannett vuonna 1912, jolloin siitä tuli toinen paikallinen sanomalehti sille, josta myöhemmin tuli mediakonglomeraatti Gannett Co, Inc. Se yhdistyi Daily Newsin kanssa vuonna 1919 ja otti virallisesti käyttöön nimen The Ithaca Journal-News, vaikka sitä julkaistaankin nimellä The Ithaca Journal.
Sen tähtiin kuului Kenneth Van Sickle, pitkäaikainen urheilutoimittaja, jolla oli vuosikymmenien ajan suosittu kolumni, jossa käsiteltiin kaikenlaista Cornellista ja Ithaca Collegesta lukioihin ja paikallisiin vapaa-ajan urheilulajeihin.
Sanomalehti voitti vuonna 1985 toimituspäällikkönä toimivan Joseph Junodin johdolla viikoittaisen Softball- lehtensä Gannettin parhaana palkinnon urheilutoiminnan uutisoinnista. Tuohon aikaan Journalissa työskenteli myös kolme valokuvaajaa, joiden työt huomioitiin koko Gannettissa ja sanomalehtialalla.
Toukokuussa 1996 Journal siirtyi aamupainoon ja -jakeluun monien iltapäivälehtenä vietettyjen vuosien jälkeen. Siihen asti Cornellin yliopiston opiskelijoiden ylläpitämä sanomalehti The Cornell Daily Sun oli ollut kaupungin ainoa aamupäivän sanomalehti.
12. kesäkuuta 2006 sanomalehden painotilat siirrettiin Gannett Central New Yorkin tuotantolaitokseen Johnson Cityssä, New Yorkissa, joka sijaitsee Binghamtonin ulkopuolella, New Yorkissa. Tässä uudessa laitoksessa sijaitsevat myös Binghamton Press & Sun-Bulletinin ja Elmira Star-Gazetten painolaitokset, jotka molemmat ovat Gannettin omistamia päivälehtiä.
Tämän siirron jälkeen Ithaca Journalin nykyistä rakennusta kunnostetaan, jotta sinne saataisiin lisää toimistotilaa.
Vuoden 2006 loppupuolella Ithaca Journal irtisanoi osan Ithacassa sijaitsevasta levikki-, markkinointi- ja mainostoimiston henkilökunnasta. Lehden levikki- ja markkinointitarpeet hoidetaan nyt Binghamtonin toimistosta käsin.
Kesäkuuhun 2020 mennessä sanomalehden paikallinen henkilökunta oli vähentynyt vain yhteen toimittajaan: Matt Steeckeriin. Tämä on johtanut siihen, että Ithacasta ei ole ollut päivääkään uutisia. Sen sijaan lehti käyttää Binghamtonissa ja Elmirassa sijaitsevien Gannett-kiinteistöjen sisältöä täyttääkseen lehden ja verkkosivuston.